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Name : coxA (OTT_1196) Accession : YP_001937888.1 Strain : Orientia tsutsugamushi Ikeda Genome accession: NC_010793 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase polypeptide I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : - Position : 1224473 - 1226059 bp Length : 1587 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAGCAGCAAACATAGTGATACTCCTCGTGGATGGCGCAGATGGTTATTATCAACTAACCATAAAGATATAGGCAGTAT GTATTTAATATTTGCAATTTTAGCAGGACTAATTGGAGGATTGTTCTCATTTATTTTTAGATTGCAATTAGCAGTACCTG GAAGCAATTTTTTAGGGGGCAATTTTCAACTTTTTAATGTATTAATTACAGCTCATGCTATAATAATGGTATTCTTTATG ATTATGCCAGCTCTATTTGGCGGCTTTGGAAATTGGTTCGTACCATTAATGATTGGAGCTCCAGATGTTGCTTTTCCAAG ATTAAATAATATTAGCTTTTGGCTATTAGTACCAGCTTTTATTTTGCTTATTGCATCAGTTTTTGTTGACGAGGGAGCTG GTACTGGCTGGACTCTATATCCTCCTTTAAGTAGTAGTTTAAGCCATCCAGGAGCTGCTGTTGACATGGTAATTTTTAGC TTACATTTAGTTGGACTATCTTCTATCCTTGGATCAATGAACCTTATAGTAACAATTTTTAATATGAGAGCCCCAGGCAT GGGATTATTACAAATTCCATTGTTTGTATGGTCAATACTAATTACTGCATTTCTATTAATTATAGTAATTCCAGTTCTAG GAGGAGCTATTACAATGCTATTAATGGATCGTAACTTCAATACCTCATTTTTTGTTCCATCAGGTGGTGGAGATCCAGTA TTATTTCAGCACTTATTTTGGTTTTTTGGTCACCCTGAAGTATATATAGTTATTTTACCAGGGTTTGGAGTTATTAGCCA CGTTATATCAACTTTTTCTAAAAAGCCAATATTTGGCTATTTAGGTATGGTAGGGGCAATGATTGCCATTGGAGTAATCG GCACATTAGTATGGGCTCACCACATGTTTACGGTTGGATTATCGCCGCAAGCCTTAATATTTTTTACTGCAGGGTCAATG ATTATAGCTTTGCCAACTGGAATCAAAATCTTCAGCTGGCTAGCAACTATGTGGGGAGGATCAATTGAATTTAAGACTCC AATGCTATTTAGTATAGGATTTATTATATTATTTACTATTGGAGGAGTAACTGGAGTAGTATTAGCTAACTCATCAATTG ACAGAGTATTACACGATACATATTATGTAGTAGCTCACTTTCATTACACAATGTCCTTGGGAGCATTGTTTTCGGCATTC GCTGGATTTTATTACTGGATCGGAAAAATATCAGGTCGACAATATCCAGAAATACTTGGAAAAATTCACTTTTGGATAAC TTTTATCGGAGTTAATCTTACTTTTTTTCCTCAACATTTTTTAGGACTTGCTGGTATGCCAAGAAGAATTCCAGATTATC CTGATGCTTTTGCTGGCTGGAATATGGTATCATCCATAGGTTCTACAATTTCAATAATCGCTGCATTCTTTTTTATCTAC ATAGCAATCTACACAATATTCTATGGTAAAAAATGCCCAGCTAATCCATGGGGACAAGGAGCTACAACTCTAGAATGGAG CTTAGAATCCCCTCCACCTTATCATTGCTTTCAAGACCCACCAAAAATTGAGAATGTAGATCACTAA Protein sequence : MSSKHSDTPRGWRRWLLSTNHKDIGSMYLIFAILAGLIGGLFSFIFRLQLAVPGSNFLGGNFQLFNVLITAHAIIMVFFM IMPALFGGFGNWFVPLMIGAPDVAFPRLNNISFWLLVPAFILLIASVFVDEGAGTGWTLYPPLSSSLSHPGAAVDMVIFS LHLVGLSSILGSMNLIVTIFNMRAPGMGLLQIPLFVWSILITAFLLIIVIPVLGGAITMLLMDRNFNTSFFVPSGGGDPV LFQHLFWFFGHPEVYIVILPGFGVISHVISTFSKKPIFGYLGMVGAMIAIGVIGTLVWAHHMFTVGLSPQALIFFTAGSM IIALPTGIKIFSWLATMWGGSIEFKTPMLFSIGFIILFTIGGVTGVVLANSSIDRVLHDTYYVVAHFHYTMSLGALFSAF AGFYYWIGKISGRQYPEILGKIHFWITFIGVNLTFFPQHFLGLAGMPRRIPDYPDAFAGWNMVSSIGSTISIIAAFFFIY IAIYTIFYGKKCPANPWGQGATTLEWSLESPPPYHCFQDPPKIENVDH |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 8e-87 | 44 |
