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Name : CLH_3330 (CLH_3330) Accession : YP_001922664.1 Strain : Clostridium botulinum Alaska E43 Genome accession: NC_010723 Putative virulence/resistance : Unknown Product : oligo-1,6-glucosidase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : 3.2.1.10 Position : 3601827 - 3603491 bp Length : 1665 bp Strand : - Note : identified by match to protein family HMM PF00128 DNA sequence : ATGATGAAAAAATGGTGGCATGATAAAGTAGCATATCAAATATATCCTAAAAGTTTTAACGATTCTAATGGTGATGGAAT AGGTGATTTAAGAGGAATTATCAATAAACTTGATTATCTAAAAGAATTAGGTGTAGATATAATTTGGATTTCTCCAGTTT ATTGTTCTCCAATGGTAGATCAAGGTTATGATATTTCTGATTATTATAATATAGATCCTAGATTTGGAACAATGGAAGAT ATGGATGAATTATTAAAAGAAGCTAAAGCAAGAGATATGCATATATTAATGGATTTAGTTGTTAATCATTGTTCTGATCA ACATGAATGGTTCAAAAAAGCTATAGCAGATCCAGAAGGGGAATTTGCTGATTATTTCTATTTTAGAGAAGGTAAAGATG GAAATCCACCATGTAATTGGCGTTCATATTTTGGTGGAAGTGTTTGGGAAAAAATACCTAATAGTAATAAATATTATCTT CATTTATTTGCAAAAGAGCAACCAGATTTAAATTGGGAAAATCCTAAATTAAGAAAGAAGTTATATGACATGATTAATTG GTGGCTTGAAAAAGGATTATCAGGCTTTAGAATTGATGCAATCATTAATATAAAGAAGGATTTAAGATTTGAAGATTTCC TAGCTGATAGAGAAGATGGTCTTTGCAGTATGCATAATATGTTAGAAGCAGCTGAAGGTGTTGGGGATATGCTTAAAGAA TTAAAAGAAGAAACTTTTGATGAATTTGATGCATTTACAGTTGGAGAAGTGTTTAATGAAAAAGAAGGCGAGCTTTATAA ATTCATAGGTAAAGATGGATATTTCTCTTCTATGTTTGATTTTAGTATGAATATATTAGGAGAAAATGAAAAAGGCTGGT ATGGTTATAGAGATTTTACCCCAAATGAATTAAGAAAGGTGATTTTTGATAGCCAAATAAAAACAGCTGATATTGGATTT AAGGCAAATATTATTGAAAATCATGATGAGCCAAGAGGGGTAAGCAGATATCTTCCTACTGAAGATTGTAATGATAATAG TAAAAAGATGTTGGCAGCTATATCACTTATGTTAAGAGGAATTCCTTTTATTTATCAAGGACAAGAAATTGGAATGACAA ATAATAAATTTAATTCAATAGAAGAAATTGATGATATTTCAACAATAGATCAATACAAGGTTGCAATAGAACATGGATTT AGTGAGATAGAAGCATTACAAATTGTAAATAGATATAGTAGGGATAATTCTAGAACACCATTTCATTGGAATGATAGTAA AAATGCAGGATTTACAGATGGAGAGCCTTGGCTTAAAGTTAATGAAAACTATAAATCAATTAATGCAGAATCACAAATTG ATGATGAATATTCTATATTTACATTTTATAAAGAGCTTATAAATTTAAGAAAATCTGATGAATTTAAGGATGTAGTAGTA TATGGTGAATTTAAGCCAGCATTAGAAATGTATGATAATATTTTTGCTTTTTACAGGGAGAGTTTAGATAAGAAATTGAT GTTAGTAGCTAATTATCAAAGAGATGAGCAAGTCATTGAATTATCAAGTTATAAGAAGGTATTAATCAATAATTATGAAA CAGTAAATGTTGAAAACAAGAAAATAGCATTACAAGGGTATCAAGTATTAATTTTAGAAATTTAA Protein sequence : MMKKWWHDKVAYQIYPKSFNDSNGDGIGDLRGIINKLDYLKELGVDIIWISPVYCSPMVDQGYDISDYYNIDPRFGTMED MDELLKEAKARDMHILMDLVVNHCSDQHEWFKKAIADPEGEFADYFYFREGKDGNPPCNWRSYFGGSVWEKIPNSNKYYL HLFAKEQPDLNWENPKLRKKLYDMINWWLEKGLSGFRIDAIINIKKDLRFEDFLADREDGLCSMHNMLEAAEGVGDMLKE LKEETFDEFDAFTVGEVFNEKEGELYKFIGKDGYFSSMFDFSMNILGENEKGWYGYRDFTPNELRKVIFDSQIKTADIGF KANIIENHDEPRGVSRYLPTEDCNDNSKKMLAAISLMLRGIPFIYQGQEIGMTNNKFNSIEEIDDISTIDQYKVAIEHGF SEIEALQIVNRYSRDNSRTPFHWNDSKNAGFTDGEPWLKVNENYKSINAESQIDDEYSIFTFYKELINLRKSDEFKDVVV YGEFKPALEMYDNIFAFYRESLDKKLMLVANYQRDEQVIELSSYKKVLINNYETVNVENKKIALQGYQVLILEI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 2e-93 | 42 |
