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Name : HPSH_00710 (HPSH_00710) Accession : YP_001909632.1 Strain : Helicobacter pylori Shi470 Genome accession: NC_010698 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 137046 - 138701 bp Length : 1656 bp Strand : + Note : COG1620 L-lactate permease DNA sequence : GTGTCAGAATTTCATCAAGTTTATGACCCTTTGGGTAATATTTGGCTGAGCGCTCTTGTGGCCTTATTACCGATTTTGTT ATTTTTCTTATCTTTAATGGTTTTTAAACTCAAAGGTTATGCGGCGGCCTTTTTGAGCGTGGTTCTGTCAGCCGTTATTG CGGTTTTAGTGTATAAAATGCCTGTTAGCATGGCGGGTTCAAGCTTTCTTTATGGCTTCCTCTATGGCTTATGGCCGATC GCTTGGATCATTATTGCGGCGATTTTTTTATACAAACTCAGCGTTAAATCCGGCTATTTTGAAATTTTAAAAGAAAGCGT TCAGTCCATCACTTTAGATCACAGGATTTTAGTGATTTTGATTGGCTTTTGTTTTGGCTCGTTTTTAGAAGGAGCGATCG GCTTTGGAGGGCCTATTGCCATTACAGCGGCGATTTTAGTGGGCTTAGGGTTAAGCCCCTTATACGCTGCCGGGTTATGT TTGATTGCTAACACCGCTCCTGTAGCCTTTGGCGCAGTGGGTATCCCTATAAGCGCGATGGCGAGTGCGGTAGGGGTGCC AGCGATTTTGATTTCAGCCATGACGGGTAAAATCCTCTTTTTTGTGAGCTTGTTCGTGCCGTTTTTCATTGTGTTTTTAA TGGATGGCTTTAAGGGGATTAAAGAAACTTTTCCGGCCGTTTTTATCGCGGCTTTTTCTTTCGCTGGCGCGCAATTTTTA AGCTCTAATTACTTGGGGCCAGAATTGCCTGGCATTATTTCAGCCCTTGTTTCACTCGTTGCAACGGCGCTTTTTTTGAA ATTTTGGCAACCTAAAGTGATTTTTAGAAGCGACGGCAAAGCGGCTTCATTCACTAAGAGTAACCATCATATTTGTAAGA TTTATGTCGCTTGGTCTCCTTTTGTGATTTTGGTTTTAGTGATTGTGTTATGGATACAGCCTTTTTTTAAGGCTTTATTT GAAAAAGACGGCTTGTTAGCTTTTTCTAATTTTTATTTTGAATTCAATAACATCAGTAACCACATCTTTAAAAGCCCGCC TTTTGTAGAATCCGATCAAAGTGCGAGTTTTCCGGTGGTGTTTAAATTTTTCTTAATCAACACGGTTGGCACTTCCATTT TTTTGGCCGCTCTCATTAGCATGCTCGTTTTAAGGGTGCGAGTGAGCGATGCGCTGAGCGTTTTTGGCGAAACTCTAAAA GAAATGCGCTACCCCATTCTTACCATCGGTTTAGTCTTAAGCTTTGCCTATGTGTCTAATTACAGCGGGATTTCTTCCAC CCTGGCCTTAGCGCTCACCCATACGGGCTTAGCTTTCACCTTTTTCTCGCCCTTGATCGGGTGGGTGGGCGTGTTTTTAA CCGGGAGCGATACGAGTTCTAATCTTTTATTTGGCTCTTTACAGCAACTCACCGCCCAACGATTGCACCTCCCTGAGATT TTAACCCTAACGGCTAATACCGTGGGTGGCACTTTAGGCAAGATGATAAGCCCTCAAAGCATCGCTATCGCTTGCGCGGC AGTGGGATTGGTCGGGAAAGAGAGCGATTTATTCAAATTCACGGTCAAATACTCCCTTATTTTTGTAGCGATCATGGGAG TCGTGATTAGCGCGATTGCGTATTTGATCCCTGAAGTGGTGCCTGCGATAAAGTAG Protein sequence : MSEFHQVYDPLGNIWLSALVALLPILLFFLSLMVFKLKGYAAAFLSVVLSAVIAVLVYKMPVSMAGSSFLYGFLYGLWPI AWIIIAAIFLYKLSVKSGYFEILKESVQSITLDHRILVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPIAITAAILVGLGLSPLYAAGLC LIANTAPVAFGAVGIPISAMASAVGVPAILISAMTGKILFFVSLFVPFFIVFLMDGFKGIKETFPAVFIAAFSFAGAQFL SSNYLGPELPGIISALVSLVATALFLKFWQPKVIFRSDGKAASFTKSNHHICKIYVAWSPFVILVLVIVLWIQPFFKALF EKDGLLAFSNFYFEFNNISNHIFKSPPFVESDQSASFPVVFKFFLINTVGTSIFLAALISMLVLRVRVSDALSVFGETLK EMRYPILTIGLVLSFAYVSNYSGISSTLALALTHTGLAFTFFSPLIGWVGVFLTGSDTSSNLLFGSLQQLTAQRLHLPEI LTLTANTVGGTLGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESDLFKFTVKYSLIFVAIMGVVISAIAYLIPEVVPAIK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 1e-100 | 52 |
