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Name : CLL_A3534 (CLL_A3534) Accession : YP_001887679.1 Strain : Clostridium botulinum Eklund 17B Genome accession: NC_010674 Putative virulence/resistance : Unknown Product : oligo-1,6-glucosidase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : 3.2.1.10 Position : 3741285 - 3742952 bp Length : 1668 bp Strand : - Note : identified by match to protein family HMM PF00128 DNA sequence : ATGATAAAAAAATGGTGGCATGATAAAGTAGCATATCAAATATATCCTAAAAGTTTTAATGATTCTAATGGAGATGGAAT AGGTGATTTAAGAGGAATTATTAATAAACTTGATTATTTAAAAGAATTAGGAGTAGATATAATTTGGATTTCTCCAGTTT ATTGCTCTCCAATGGTAGACCAAGGTTATGATATTTCTGATTATTATAATATAGATCCTAGATTTGGAACAATGGAAGAT ATGGATGAGTTATTAAAAGAAGCTAAATCAAGAGATATGCATATATTAATGGATTTAGTTGTTAATCATTGTTCTGATCA ACATGAATGGTTTAAGAAAGCTATAGCAGATCCAGATGGTGAATATGCGGATTATTTTTATTTTAGAGAAGGTAAAAATG GAAATCCACCATGTAACTGGCGTTCATATTTTGGAGGCAGTGTATGGGAGAAGATACCTAACAGTAATAAATATTATCTA CATTTATTTGCTAAGGAACAACCAGATTTAAATTGGGAAAACCCTAAATTGAGAAAAAAAATATATGAAATGATTAACTG GTGGCTTGAAAAAGGATTATCAGGATTTAGAATTGATGCGATTATTAATATAAAAAAGGATTTAAGATTTGAAGATTTTC CATCTGATAGAGAGGATGGTCTTTGCAGTTTATATAATATGTTGAATGCAGCAAAAGGCGTTGGGGATATGCTTAATGAA TTAAAAAGAGAAACTTTTGATAAGTTTGATGCATTTACTGTAGGTGAGGTATTTAATGAAAAAGAAGATGAGCTTTATAA ATTTATAGGAAAAGATGGATATTTTTCTTCTATGTTTGATTTTAGTATGAGCATGTTAGGTGGTAATGAAAAAGGCTGGT ATGGTTATTGTGATTTTAAGACAAATGAATTAAGAAAGGTAATTTTTGATAGTCAGGTAAAAACTGCTGATATAGGATTT AAAGCAAATATTATTGAAAACCATGATGAACCAAGAGGGGTAAGCAGATATATACCTGCTGAAGATTGTAATGATTATAG TAAAAAGATGCTGGCAGCTATATCACTTATGTTAAAGGGAATTCCGTTTATATATCAAGGACAAGAAATTGGAATGACAA ATAATAAATTTAATTCTATAAAAGAGATAGATGATATTTCAACAATAGATCAATATAAGGTTGCTATAGAACATGGATTT AATGAGATAGAATCATTAAAAATTGTAAATAAATATAGTAGAGACAATGCTAGAACTCCATTCCATTGGAATAACGGTAA AAATGCAGGATTTACAGAAGGAAAGCCATGGATTACTATAAATGAAAATTATAAACATATAAATGCAGAATCACAAATTA GTGATGAAAATTCAGTAATTAGTTTTTATAAGAAGCTTATAAAATTAAGAAAATCTGATGAATTTAAGGATGCTATAGTT TATGGAGAATTTAAACCTACTTTAGAACAATATGATAATATATTCTCTTTTTACAGAAAAGGTAAAGAGAAAAAATTAAT GTTAATAGCTAATTATCAAAAAGACGAATATAAAATAAGAATACCAAGTCTTCCTAAAAAAGTTTTAATTAATAACTATG AAACAATAACTATTGAAGAAAATGAATTAAATTTACAAGGATATCAAGTATTAATTTTAGAAATTTAA Protein sequence : MIKKWWHDKVAYQIYPKSFNDSNGDGIGDLRGIINKLDYLKELGVDIIWISPVYCSPMVDQGYDISDYYNIDPRFGTMED MDELLKEAKSRDMHILMDLVVNHCSDQHEWFKKAIADPDGEYADYFYFREGKNGNPPCNWRSYFGGSVWEKIPNSNKYYL HLFAKEQPDLNWENPKLRKKIYEMINWWLEKGLSGFRIDAIINIKKDLRFEDFPSDREDGLCSLYNMLNAAKGVGDMLNE LKRETFDKFDAFTVGEVFNEKEDELYKFIGKDGYFSSMFDFSMSMLGGNEKGWYGYCDFKTNELRKVIFDSQVKTADIGF KANIIENHDEPRGVSRYIPAEDCNDYSKKMLAAISLMLKGIPFIYQGQEIGMTNNKFNSIKEIDDISTIDQYKVAIEHGF NEIESLKIVNKYSRDNARTPFHWNNGKNAGFTEGKPWITINENYKHINAESQISDENSVISFYKKLIKLRKSDEFKDAIV YGEFKPTLEQYDNIFSFYRKGKEKKLMLIANYQKDEYKIRIPSLPKKVLINNYETITIEENELNLQGYQVLILEI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 7e-97 | 43 |
