Name : pilX4 (PMIP09) Accession : YP_001812459.1 Strain : Genome accession: NC_010555 Putative virulence/resistance : Resistance Product : putative conjugal transfer protein Function : - COG functional category : U : Intracellular trafficking, secretion and vesicular transport COG ID : COG3451 EC number : - Position : 3610 - 6384 bp Length : 2775 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGAGTGTTGTTTTTAAAGGATTAACCCGCCCCGCTTTAATTCGGGGCTTAGGTGTACCGCTGTACCCGTTTTTATTCAT GATTATGGTGGTCGTCGTTATCGCAGCAAACACAAGCGATTATATGTATTTTTTAATTCCGGTCGGTTGGTTCTTGATTA AAAAAATGACGGAAATTGATGATCGGGTGTTTGATTTGTTGTATTTGCGTTATCGAGTGAGTGGTCATCCAGTCAGTAAT CAGAAATATGATGCTGTACACTATTCAGGAAACACATACGATAAGGTCGATATATCAAAACTGGAAAAAATGATGAAACT AAATCACCAAACCCCGATTGAAGATATGATCCCATTTTCTACACATATAACAGATAAGTTGGTATGCACTCGTAAGCAGG ATTTAATTGCTACTTGGGAAATTGACGGGGCTTATTTTGAATGTCAGGCTGAGGATGAGCTAGATCGTTTAACAGATCGT TTGAATACGCTCATTCGTAGTTTTGAGGATAAAGCTGTAACTTTTTATACTCACCGGATAAGAACGAAAAGTAAAATAGA AAAGAACTTCCGTTCTCTTGTCCCTTTTGCTAACAGAGTAATGAATGATTACTATGACTCTTTAAGTCAGGAATGTTTTT ATAAAAATCGTCTTTTTATCTCTTTATGTTATAAGCCGTTAACGGCAGATGAGAAGTTAACGTTTCTTTTTTCCAAAAAT AAAAAAGAGAAAGAAAAACAAAACAAAAAAATATTAACAGAATCGATAGCTGTCATGAATGATATGACAGGAAGATTAGA TAACTATCTTGAGCAGTTTAATGCAACTCGTTTAGGTGTGTATGAAGAAAAAAACAGAGTGTTTTCTTCTCAGCTATCTT TATTCCAGTATCTTTTAACAGGGAAATGGCAAAAAATAGCCATCACTAATAGCCCATTTTATAATTCATTGGGTGGGAAA GATGTTTTCTTCGGTAGTGATTCAGGTCAGTTATCCGCCGGAAGTGATGCGCGTTATTTCCGTATTATTGAGATAAAGGA TTATTTTCAACATACCGAATCCGGTATTTTTGATGCGCTGATGTATGTTCCTGTGGAATATATTATGACCAGTAGCTTTA CCATTTTAAGGAAAAAAGAATCAACAAAAAGATTAGATGATCAGTTAGATAAATTGGTTATTGCTAATGATGCAGCAGTC ACACAACAAAATCAGCTTATTGTGGGAACTGATATGTTAGCCAGTGGATTGATTGCATTTGGTAATGCCAGTTTTTCATT GTTAGTTTATGCGGATTCACCGGAAGAATTAATAAAAAATAGCAATATGGTTGCAAATATCTTACAGGATTTAGGATTGG TTGTGACATATTCAGGTTTATCTTTAGGAGCGGCTTATTTTGCTCAGTTACCTGCTAATTATACACTGCGTCCTCGCCTG TCGATGATAAGTAGCCTGAATTTTGTGGAAATGGAATCATTTCATAATTTCTTTTCAGGAAAAGAAAAAAATAACTCATG GGGCGATGCGTTAATCACTCTTAAAGGATCAGGTAATGATGTGTACCACATGAATTACCACATGACCCGTGAGGGTGTTA ATGATTTTGGTAAGAACCCGCCGCTGGCTCATACTGAGATATTAGGCGCATCAGGGGGAGGGAAAACGGTCTTGATGATG GCTCATGCGTTAGCTGCACAACAATATGGAATGGCTGATTCATTTCCTGATAACCGGAAAATAAAAAAACTAACCACTGT TTTTTTTGATAAAGACCGTGCGGGAGAAGTAGCCATAAGAGCTATGGGCGGTGAATATTTTAAAATTAAAAGTGGTGAAC CTACAGGCTGGAATCCATTTCAGTTAGCCCCGACAAAACGCAACATTGCCTTTTTAAAAGAACTGGTAAGAATTTTGTGT ACTGTAAATGGCGGAGAACTGGACGATCATCAATTACAGTTAATTTCAGATGCTGTAGAACGCTTAATGCAACGGGATAA CCGTACATATGGTATCAGTAAACTAATTCCTTTAATTATGGAGGACAGAGACGGAACAACGTTAAAAACGGGATTAAAAG TCCGGCTGAATGCATGGGCGAAAGATGGGGAGTTTGGTTGGGTATTCGATAATGAAAATGAAACTTTTGATATAAATGAG AAATCTGTATTTGGGGTAGACGGCACGGAATTTTTAGACGACAAAGTCACCTCACAGGTGATCCCATTCTACCTTATTTA TAAGGTTGCATCATTAGCCGATGGTCGTCGCCTGTTAATATATATGGATGAGTTTCATCAGTGGCTTGTTAATGAAAGTA TGCAAAAAAGTATTTATAACATACTGAAAACAGGTAGGAAACTGGATATGGTGCTTGTTTTTGCTACTCAATCACCTGAT GAACTTATTAAAACGCCAATAGCTGCCGCTGTCAGGGAACAATGTGCCACACATATTTATTTGTCTAACCCTAAAGCTAC CCGTGAGGATTACGTTAACGGCTTACAGGTCAGTGAATTGTATTTTGACATTATTAAAAATATTGACCCGCTTTCCCGTA TGCACTTAGTGGTCAAAAACCCACAACGCAAAGGCGATAAAACTGAGTTTGCTGCATTTGCAAAACTCGATTTAGGTCAG GCAGCAAAATATTTACCAATATTAAGTGCATCCAGTGATCAGATGGTGATTTTTGATGAAATTTATCAAGAGGGCATGAA ACCGGAAGAATGGATTGATGTGTACTTAAATCAGGTCAATAAAATATCACATTAA Protein sequence : MSVVFKGLTRPALIRGLGVPLYPFLFMIMVVVVIAANTSDYMYFLIPVGWFLIKKMTEIDDRVFDLLYLRYRVSGHPVSN QKYDAVHYSGNTYDKVDISKLEKMMKLNHQTPIEDMIPFSTHITDKLVCTRKQDLIATWEIDGAYFECQAEDELDRLTDR LNTLIRSFEDKAVTFYTHRIRTKSKIEKNFRSLVPFANRVMNDYYDSLSQECFYKNRLFISLCYKPLTADEKLTFLFSKN KKEKEKQNKKILTESIAVMNDMTGRLDNYLEQFNATRLGVYEEKNRVFSSQLSLFQYLLTGKWQKIAITNSPFYNSLGGK DVFFGSDSGQLSAGSDARYFRIIEIKDYFQHTESGIFDALMYVPVEYIMTSSFTILRKKESTKRLDDQLDKLVIANDAAV TQQNQLIVGTDMLASGLIAFGNASFSLLVYADSPEELIKNSNMVANILQDLGLVVTYSGLSLGAAYFAQLPANYTLRPRL SMISSLNFVEMESFHNFFSGKEKNNSWGDALITLKGSGNDVYHMNYHMTREGVNDFGKNPPLAHTEILGASGGGKTVLMM AHALAAQQYGMADSFPDNRKIKKLTTVFFDKDRAGEVAIRAMGGEYFKIKSGEPTGWNPFQLAPTKRNIAFLKELVRILC TVNGGELDDHQLQLISDAVERLMQRDNRTYGISKLIPLIMEDRDGTTLKTGLKVRLNAWAKDGEFGWVFDNENETFDINE KSVFGVDGTEFLDDKVTSQVIPFYLIYKVASLADGRRLLIYMDEFHQWLVNESMQKSIYNILKTGRKLDMVLVFATQSPD ELIKTPIAAAVREQCATHIYLSNPKATREDYVNGLQVSELYFDIIKNIDPLSRMHLVVKNPQRKGDKTEFAAFAKLDLGQ AAKYLPILSASSDQMVIFDEIYQEGMKPEEWIDVYLNQVNKISH |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
unnamed | AAP70302.1 | Pilx3-4/VirB3-4-like protein | Not tested | HPI | Protein | 1e-180 | 42 |
Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
pilX4 | YP_001812459.1 | putative conjugal transfer protein | BAC0398 | Protein | 0.0 | 43 |