Name : PMI1466 (PMI1466) Accession : YP_002151197.1 Strain : Proteus mirabilis HI4320 Genome accession: NC_010554 Putative virulence/resistance : Virulence Product : fimbrial outer membrane usher protein Function : - COG functional category : N : Cell motility COG ID : COG3188 EC number : - Position : 1548820 - 1551423 bp Length : 2604 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGCTAAAATCTAAAACTATATGTTTTAATTTATATATCTTTTTAGGTACATGCTTTTCTGGTGTGGTGTATGCGGATAG TTTTTTTAATCCTAACTTAATTTCAAATATTGATAATGAAGTAGCAGATTTATCTCGATTTGATAAAGGTGAAGGCCAAC CTGAAGGAATGTATTCAGTAGAAATTTATGTAAACGATGAATATGTTGAAACAAAAAATTTAATATTTTATGAAAGCGAT GCATCATCCGATGATACAGGTTTATTACCTTGTATAGATAATAAAACTTTGACAAATTTTGGAATAACTTTAACTGAAAA TAGCAAAAAGAAATCAGAAGAGGTAGAAAGTAAAGATAGTGCTTGTGAGAATATTTTAGATAAAATAGAAAACTCAAGTG TTAAATTCGATTTTGAAGGACAAAAATTATTTTTAAGTATTCCACAAATAATGTTTAAAAATAATGTTCGTGGCTTTATC CCACCTGAAAAATGGGATAATGGGATTAATGCGTTTTTACTAAATTATAATTTCACAGGAAGAAATAGTAAGAACTTTAA GGATAACGTTGATAATAATAATTATTTTTTAAACTTAAATCCTGGTATTAATCTTGGTTCATGGCGATTTAGAAATGAAA GTTCATGGAACTATGCCAGTGGTGAAAGTAAGCAAAATAAATGGAGGAATATAAGAACATATGTACAAAAACCTATTATT CCATTACGTGCTGAATTAACCCTTGGTGACTCTTTTTCTAATGGAACCATTTTTGATAGTCTTGGTTTTAGAGGGATTAA GCTAGAATCTGATGATAATATGTTGCCTGATAGCATGAGAGGATTTGCACCTACGATAAAGGGTATTGCGAATAGCAATG CTATTGTTACAGTCAAGCAGAATGGTTTTGTTATTTATCAAATTTCTGTACCTCCAGGTGCATTTGAAATAAAAGATCTC TATGCCACATCAAGTAGCGGTAATTTAGATGTCACAATCAAAGAGAATAACGGTAAAATTACACAATTTGTTGTACCTTA TTCAAATGTGCCTATTTTACAACGTGAAGGACGCTTAAAATACGAATTGATTGGAGGGGAATTTCGTAGCGGAGCAGATT ATCAAGATAAACCTAATTTTGGTCAATTAAGTTTAGTATATGGCTTACCTTATAATATGACGTTATATGGAGGAAGCCAA TTTTCAAATAATTATCAAGCCTATGCGATTGGTTTAGGTGGTAATCTAGGCACCTTTGGGGCGATATCAGCAGATGTAAT ACAGGCGAATAGTATATTGCCAAACGATGAGCATAAAAAAGGGCAGTCATTCCGATTACTTTATGCTAAATCGATTAATA GCACAGGCACTAACTTTCAAATAATGGGGTATCGATATTCAACGCAAGGCTACTATACCCTAAATGAAGTTAGTTATAAA AAAATGGCAGGGCGTGAAATAGTAACAGATAATGGAATAATAAGAGATGAGGATAACTTATCTAACTACTATAATTTAAA TTATTCTAAAAAAGGGAGGTTTCAACTTAATATAAATCAGCAAATTACCAATAATAGTTCTTTGTATATTTTAGGCTCTT ACCAAAACTATTGGCGCACAACTGAAACTGAACAGTTATGGCAACTGGGTTATAATGCTAATATTGATAGGATAAATTAT AGTCTTAGTTTATCGAAATTAAAATCACCGGGTATGCGTGGTGATAATAAAAATGTAGCTTTTAATATATCAATTCCTCT TAATGATGTATTTAACCAACAAACTGTAAGTGACTTACATTCAAGTAGAAATAGTATGTATGCTGTTTACTCAATGAATA GAAGCGATGACAATGTTTGGGTCAATCAAGTGGGACTAACAGGAACTCTCCTTGAAGACAATAATTTAAATTATAATATT CAACAAGGATATACGCATAATGGTTCTGGTTATTCAGGAATGGTTTATGCTAATTATAAAGGTAAATATGCTAATATAGG TAGCGGATATAATTATAGTAATGATTGGCATGAGTTTAATTATAGTTTAAATGGTGGTATTGTTGCTCATGCAGGAGGTA TTACTTTAACTCAACCTTTAGGGGATACCAATATTCTTATTAAAGCAAATGATGCTAATAATATTAAAGTAGAAAATGCA AATGGTATATTAACTGATAATAATGGTTATGCTGTCTTACCGTTTGCTTCAACATATAAAAATAATCGAGTTTCATTAGA TGTTAATTCATTAGAAGAAAATATTGAATTAGAAAATACGATTATTAATGTAGTTCCTACTAAAGGGGCATTGGTTGAAG CTAATTTTAAAACGAATATTGGCTATCGAGCAATGGTTACATTAAGCAAAAAAGATGGCGCTATTATACCTTTCGGTGCG ATGGTTGTTGATGAAGAGCGTTCCGTAAGTGGTATTGTTGGCGATAATGGGAATGTTTTTATCTCTGGTTTAGCACCTGT TGGTAGGCTAAAAGCAAAATGGGGAAAAATGGCTGATCAACAATGTATATTTGATTACCAAATTAATGAGAAGTCATCAA AAGAAAAAGGTATCTATTTTATTTCTTCCACATGCCAATATTAA Protein sequence : MLKSKTICFNLYIFLGTCFSGVVYADSFFNPNLISNIDNEVADLSRFDKGEGQPEGMYSVEIYVNDEYVETKNLIFYESD ASSDDTGLLPCIDNKTLTNFGITLTENSKKKSEEVESKDSACENILDKIENSSVKFDFEGQKLFLSIPQIMFKNNVRGFI PPEKWDNGINAFLLNYNFTGRNSKNFKDNVDNNNYFLNLNPGINLGSWRFRNESSWNYASGESKQNKWRNIRTYVQKPII PLRAELTLGDSFSNGTIFDSLGFRGIKLESDDNMLPDSMRGFAPTIKGIANSNAIVTVKQNGFVIYQISVPPGAFEIKDL YATSSSGNLDVTIKENNGKITQFVVPYSNVPILQREGRLKYELIGGEFRSGADYQDKPNFGQLSLVYGLPYNMTLYGGSQ FSNNYQAYAIGLGGNLGTFGAISADVIQANSILPNDEHKKGQSFRLLYAKSINSTGTNFQIMGYRYSTQGYYTLNEVSYK KMAGREIVTDNGIIRDEDNLSNYYNLNYSKKGRFQLNINQQITNNSSLYILGSYQNYWRTTETEQLWQLGYNANIDRINY SLSLSKLKSPGMRGDNKNVAFNISIPLNDVFNQQTVSDLHSSRNSMYAVYSMNRSDDNVWVNQVGLTGTLLEDNNLNYNI QQGYTHNGSGYSGMVYANYKGKYANIGSGYNYSNDWHEFNYSLNGGIVAHAGGITLTQPLGDTNILIKANDANNIKVENA NGILTDNNGYAVLPFASTYKNNRVSLDVNSLEENIELENTIINVVPTKGALVEANFKTNIGYRAMVTLSKKDGAIIPFGA MVVDEERSVSGIVGDNGNVFISGLAPVGRLKAKWGKMADQQCIFDYQINEKSSKEKGIYFISSTCQY |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
fim2D | AFH78429.1 | putative fimbrial usher protein | Virulence | KpGI-5 | Protein | 1e-161 | 43 |
sfaF | CAC16953.2 | SfaF protein | Virulence | PAI III 536 | Protein | 3e-163 | 42 |
Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
PMI1466 | YP_002151197.1 | fimbrial outer membrane usher protein | VFG0446 | Protein | 5e-165 | 45 |
PMI1466 | YP_002151197.1 | fimbrial outer membrane usher protein | VFG0876 | Protein | 1e-164 | 44 |
PMI1466 | YP_002151197.1 | fimbrial outer membrane usher protein | VFG1645 | Protein | 2e-163 | 42 |
PMI1466 | YP_002151197.1 | fimbrial outer membrane usher protein | VFG0912 | Protein | 7e-163 | 42 |