Name : nrdA (PAa_0056) Accession : YP_001798747.1 Strain : Candidatus Phytoplasma australiense Genome accession: NC_010544 Putative virulence/resistance : Unknown Product : Ribonucleotide reductase, alpha subunit Function : - COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism COG ID : COG0209 EC number : - Position : 57002 - 59572 bp Length : 2571 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTTAGAACAAAAAATCAAAATAATTTATGACGGTTTAAAAAACGGCCAAGTTTATAATATGGCGCAAAGTCTTGGTTT TGATTTCAAACATATTAGCGAATGCCAAGCAAACGCTATAGATAATGATGTTTTTTTATTAACTCGTAGTGTTAAATTTG GCGAAGTATCTCAAGAAGCGAAACTTTTTTTAGATCAAAATCGTGATAAAGTCATTGGAGTTGCTGTTTCTGGCAATAAA ACCTGGGGTCAAAATTATGGCAAAGCAGGCGATATTATTGCCTCTACTTACAACATCCCTTTAGTTTTAAAATTTGAGGG TTCAGGAATCCAAGAAGAAAGACTTTTTTTAAAAAAATGGCTTCTTAGTTACAAAAAAGAAAAAAATTCCTCATTTTCTT TCAAAAAACCATTACAAAATGATTCTAATTTTTCGGATGTTACTGTTAAAAACACAAATGAACCAACCCCTCCCACACAA AAAATTTTGCCACCCTGGATTCTTCTTAATAATCAAATTATTGATGAAAATGGCAATATTAAAGATTTAAACAAAGACCA AGAAGCTTTAACAAGTTTTTTGTTAGAAGAAGTAAAGCCAAAATTAAAACACTTTGATACTTTAAAAGAAAAATTGACTT TTTTACAAACTAACGAATATTATGAAACTGATTTTTTAAGTCAATATAACGAACAACAAATTAAAGATATTTATAAAATA GCTTATCAAAAACAATTTCGTTTTTCTACTTTTATGGGAGCTTTCAAATTTTATAACGATTATGCCTTAAAAAGCAGAGA CAAAAAGTATTATTTAGAGACTTATGAAGACAGATTGTGCGTTAATGCTTTGTATCACGCTCAAGGAGATTTTGAAATTG CTAAAAGATTGATTAAATCTTTGATTAACCAAGATTTCACCCCAGCAACCCCAACTTTATTAAATGCAGGTAAAAAACAT CGTGGTGAATTTGTTTCTTGTTTCTTGTTAGAAGCAGGTGATTCTTTAAACGATATTGCTCGCATTAATGAATTTTCAAT GCAACTTTCCAAAATTGGTGGTGGAGTTTCTATTAACATTACTAATTTGCGTGCGAAAGGTGAAAGTATTAAAGGAATTA AGGGCGTGTGCAAAGGAGTTGTTGGCGTTTGTAAATTACTCGATCATAGTTTTCGTTATGCCGATCAAATGGGTCAAAGA ACGGGTGCGGGAGCAGTTTATTTAAGTGTTTTTCATGCCGATATTGAAGATTTTTTAAGTACTAAAAAACTGAATGCTGA TGAAGATGTTCGTGTAAAAACTTTATCTCTAGGAGTTATAGTGCCTAATAAAATGATTGAATTGGCAAGAAAAAACGAAG TCATGTATACTTTTTATCCTCATACTGTTTTTTTGGAATACGAAAAAAACTTCGCTGATATTGCAGTTAACATGGATTAT TGGTATGATATTTTGGTAAGCAATCCGAAAGTTCGCAAAAAAGCTATTCAACCGCGTCAATTATTAGAATTGATTGCTCG TATGCAAGGTGAGTCAGGCTATCCTTATTTAATGTTTTGCGATAACGTTAATCAAAACAACACCTCTCATTTACAAGTTA AATTTTCTAACTTATGCACAGAAATTCTTCAACCAACTATCACTTCTCATTATACTGATTACAACCACACCCAAGAAGAT AAAATTGGAATGGATGTATCTTGTAATTTAGCATCCGGTCACATGTCTAATATGATTAATAACAACACCATCAAAGAAAC TGTTTTTATGGCGATGGAAGTGATGAATACAGTTTCCATGAAAACAAATATCAATTATGTTCCTGCAGTGGCCAAAGCTA ATCGATTAAACCGAAGTGTTGGTTTTGGAATCATGGGTCATCATGGTTTTCTAGCTCAAAATTACATTGCTTTTGGCAGT GAAGAAAACAAAGATTTGATTGATGTTTTTTTTAATGCTATTAATTATTATAGTCTCTTGCATTCTTGTCAAAAAGCCAA AAAAACAGGACAAAAATTTTATCTTTTTGAAAAATCTCATTATGCGGATGGATCTTATTTTAAAGGCCGTGGAGAAATTT TACCAAAAACTGATAAAATCAAAAAAATGTTTGCCAATATTCCTTTGCCAAGTGAAAAAGATTGGCAACAACTTAAAAAA GATGTTCAACAATTTGGTCTTTTTAATTCTCATCGTCTAGCTGTTGCACCTAATGGCACAATTGGTTATATTATGGGAAC AACTCCTTCTTTAACACCAATTAAACAATTAGTAGAAGAACGTACATATGGAAATTCCAAAACTTATTGTCCAATGCCTG GATTAAAAGAAACCTCTTTTATGTATGTTACTGCTTACAAGATGAATAAATACCAATTAATTGATGTTATTGCTACCGCT CAAAAACATGTTGATCAAGGGATTTCCTTTGAACTTGGGATAACTTCTGATATTACAACACGTGAATTGCAAAGATATTA TCTTTACGCTCATCATAAAGGTATAAAAACACTTTATTATACTCGCACACAAAAATTAAAAGTTGATGAATGTGAAGCTT GTGGTGTTTAA Protein sequence : MLEQKIKIIYDGLKNGQVYNMAQSLGFDFKHISECQANAIDNDVFLLTRSVKFGEVSQEAKLFLDQNRDKVIGVAVSGNK TWGQNYGKAGDIIASTYNIPLVLKFEGSGIQEERLFLKKWLLSYKKEKNSSFSFKKPLQNDSNFSDVTVKNTNEPTPPTQ KILPPWILLNNQIIDENGNIKDLNKDQEALTSFLLEEVKPKLKHFDTLKEKLTFLQTNEYYETDFLSQYNEQQIKDIYKI AYQKQFRFSTFMGAFKFYNDYALKSRDKKYYLETYEDRLCVNALYHAQGDFEIAKRLIKSLINQDFTPATPTLLNAGKKH RGEFVSCFLLEAGDSLNDIARINEFSMQLSKIGGGVSINITNLRAKGESIKGIKGVCKGVVGVCKLLDHSFRYADQMGQR TGAGAVYLSVFHADIEDFLSTKKLNADEDVRVKTLSLGVIVPNKMIELARKNEVMYTFYPHTVFLEYEKNFADIAVNMDY WYDILVSNPKVRKKAIQPRQLLELIARMQGESGYPYLMFCDNVNQNNTSHLQVKFSNLCTEILQPTITSHYTDYNHTQED KIGMDVSCNLASGHMSNMINNNTIKETVFMAMEVMNTVSMKTNINYVPAVAKANRLNRSVGFGIMGHHGFLAQNYIAFGS EENKDLIDVFFNAINYYSLLHSCQKAKKTGQKFYLFEKSHYADGSYFKGRGEILPKTDKIKKMFANIPLPSEKDWQQLKK DVQQFGLFNSHRLAVAPNGTIGYIMGTTPSLTPIKQLVEERTYGNSKTYCPMPGLKETSFMYVTAYKMNKYQLIDVIATA QKHVDQGISFELGITSDITTRELQRYYLYAHHKGIKTLYYTRTQKLKVDECEACGV |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 1e-123 | 42 |