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Name : lysU (PAa_0536) Accession : YP_001799121.1 Strain : Candidatus Phytoplasma australiense Genome accession: NC_010544 Putative virulence/resistance : Virulence Product : Lysyl-tRNA synthetase (class II) Function : - COG functional category : J : Translation, ribosomal structure and biogenesis COG ID : COG1190 EC number : - Position : 534950 - 536443 bp Length : 1494 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGAATAAAAAAATGACAGAACAAGAAGGAATTAGACACCAAAAAATAGAAGAATTGAAAAAATTAAAAACTGAACCTTT TGGTAAAAATTTCACTTGTTCGCACACAATTGAAAACATTATTTTAAATTATCAAAACATTGATCAAGAATGGTTCGAAG AAAACAAAGTTAATGTAAAAATTGCAGGAAGAATTATTTTAAAAAGAGGACAAGGAAAAGCCGGATTTTTACATCTACAA GATTTTAATTTTAAAATTCAAGTTTATCTTAGATCTGATTTATTAGGGGATGCTTTCCTTCTTTATCAAAATTGTGATTT AGGTGATATCGTAGGGATTAAAGGTTTTTTGTTTAAAACTAAAACAAAAGAGCTCACAATTAAAGCTCTAGATTTTATCC ATTTAACTAAATCTTTAAAACCATTACCAGATAAATTTCATGGTTTGCAAAACCGCGAAGAGATGAGAAAAAAACGTTAT TTAGATCTTATGGTTAATGAAAAAAGCCGACAAGTTTTTTTAACTCGTAGTTTAATTATCAAATCAATTCGTAATTTTTT TGATAATGAGGGCTTTTTGGAGGTAGAAACCCCCATTTTGCAACCTTCTTTGGGCGGAGCTTCTGCCAAGCCATTTATTA CTAGCCATAACGCTTTAAATTCTGATTTTTATTTAAGGATAGCTACCGAACTGCCTTTAAAAAAGTTAATTGTTGGTGGT ATGCCAAAAGTTTATGAAATTGGTCGAATTTTCCGTAATGAAGGAATGGATGCAACCCATAACCCGGAATTTAGCACTAT AGAGGCTTATCAGGCTTATTCTGATATACAAGGAATGATGGAATTAACTCAAAAATGTCTTCAGTATATTTGTCAAACTG TTTTAAAAAGTTTAGAAATCAATTACCAAAATAAAAAAATTAGTTTTCAAACTTTTCAAAAAATTAGCATGACAGATGCT ATCAAAAAAGAAACAGGCATTGATTTCCAAAAAAAATTATCTCAAGAAACTTGTTTGCAATTAGCAAAACAACATGATAT CAACGTCATGTCTCATTTTAGCCAAGGTCATATTATTGAAGTTTTTTTTGAAAAATACGTTGAACATAAATTAATCCAGC CTACTTTTATTTACGGCCATCCTTTAGAAATTAGTCCTTTAGCCAAAAAAAATCTTAATAACCCTCGTTTTACTGATCGT TTTGAACTTTTTATCGCTGGAAAAGAATTTGTGAATGCTTTTAGCGAATTAAACGACCCCATCGAACAAGAAAAACGTTT TTTAAATCAATTAAAACAAAAAGAATTAGGTGACGATGAGGCTTGTGAAATGGATTATGATTTTTTAGATGCCTTAAGTT ACGGTATGCCTCCCACTGGTGGGCTCGGAATGGGAATTGATCGAATAGTGATGCTTTTAACCGATACTCCCAATATCCGT GATGTTATTTTATTTCCTCATTTCAAAAATAAAAACATTATTAAGAAAAAATAA Protein sequence : MNKKMTEQEGIRHQKIEELKKLKTEPFGKNFTCSHTIENIILNYQNIDQEWFEENKVNVKIAGRIILKRGQGKAGFLHLQ DFNFKIQVYLRSDLLGDAFLLYQNCDLGDIVGIKGFLFKTKTKELTIKALDFIHLTKSLKPLPDKFHGLQNREEMRKKRY LDLMVNEKSRQVFLTRSLIIKSIRNFFDNEGFLEVETPILQPSLGGASAKPFITSHNALNSDFYLRIATELPLKKLIVGG MPKVYEIGRIFRNEGMDATHNPEFSTIEAYQAYSDIQGMMELTQKCLQYICQTVLKSLEINYQNKKISFQTFQKISMTDA IKKETGIDFQKKLSQETCLQLAKQHDINVMSHFSQGHIIEVFFEKYVEHKLIQPTFIYGHPLEISPLAKKNLNNPRFTDR FELFIAGKEFVNAFSELNDPIEQEKRFLNQLKQKELGDDEACEMDYDFLDALSYGMPPTGGLGMGIDRIVMLLTDTPNIR DVILFPHFKNKNIIKKK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | CAD66193.1 | putative lysil-tRNA synthetase LysU | Not tested | PAI III 536 | Protein | 5e-92 | 45 |
| Gene | GenBank Accn | Product | ID of source DB | Alignment Type | E-val | Identity |
| lysU | YP_001799121.1 | Lysyl-tRNA synthetase (class II) | VFG1668 | Protein | 3e-92 | 45 |
