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Name : potB (CLK_3772) Accession : YP_001785909.1 Strain : Clostridium botulinum Loch Maree Genome accession: NC_010520 Putative virulence/resistance : Unknown Product : spermidine/putrescine ABC transporter permease PotB Function : - COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism COG ID : COG1176 EC number : - Position : 685365 - 686324 bp Length : 960 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF00528 DNA sequence : ATGTGGGGGAAATTTAGCAGTGCTTTTTCAAATATTTTTAAAAAGCAATTGCATAATAAAAATACAGATATTAGTTTAGA AGACAAAGAAGGAATAAGAGGTAAACTAAAAAAATCTACCCCTATATTTAAAACAGTGGGGCCCGTTGCCCTATGGCTCA TTACATTTTTTATTGTTCCTTTACTTCTTGTATTAGTGGTTAGCTTTTTATCAAGAGGTGAATATGGAGATGTAAGATTA CCTTTCACACTAAAAAATTATAAAAGACTCATAGATCCTATGTACGGACAAATTTTAATTAAAACTTTAATGATTTCTAT TAGTACTACTTTAGGGTGTTTGATTATAGGTTATCCTTTTGCATATTTTATTGGAAGATCAGATAAAAAACATAGAGGAC TATTATTATTATTAGTTATACTACCTTTTTGGACTAATTCTTTAGTTCGAACTTATGCATGGATAATACTTTTAAAAACA GAGGGAGTAATTAACACATATCTTATGAGATTTGGATTAATTCACTCCCCAATGCAAATGCTTTATACAGATGGTGCGGT ATTTATAGGAATGCTTTATATAATGTTACCTTTTATGGTGCTACCTATTTATACATCTATAGAAAAATTAGATATGAGTT ATATAGAAGCTGCCAATGATCTTGGAGCATCACCTTACAAGACCTTTAAAGAAATAACATTACCTTTAACTCTACCGGGT ATTATAGCAGGATGTATGTTAGTATTTATACCAACCTTAGGTTATTTCTTTATATCTGACTTAATGGGTGGAAGTAAAAC TATGTTAATTTCAAATCTAATTAAAAACCAATTTTTAACCTCTAGAGATTGGCCCTTTGGTTCCGCTATAGCAGTAATAT TAATTATTTTAATGCTTATAGCTATAAGTTTCTATTTTAAAGGAAATAAACCAAAGAAGGGAATAAAGGAGGTTAACTAA Protein sequence : MWGKFSSAFSNIFKKQLHNKNTDISLEDKEGIRGKLKKSTPIFKTVGPVALWLITFFIVPLLLVLVVSFLSRGEYGDVRL PFTLKNYKRLIDPMYGQILIKTLMISISTTLGCLIIGYPFAYFIGRSDKKHRGLLLLLVILPFWTNSLVRTYAWIILLKT EGVINTYLMRFGLIHSPMQMLYTDGAVFIGMLYIMLPFMVLPIYTSIEKLDMSYIEAANDLGASPYKTFKEITLPLTLPG IIAGCMLVFIPTLGYFFISDLMGGSKTMLISNLIKNQFLTSRDWPFGSAIAVILIILMLIAISFYFKGNKPKKGIKEVN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| potB | BAA36746.1 | - | Not tested | LIM | Protein | 5e-61 | 50 |
