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Name : treC (CLK_1441) Accession : YP_001787379.1 Strain : Clostridium botulinum Loch Maree Genome accession: NC_010520 Putative virulence/resistance : Unknown Product : alpha,alpha-phosphotrehalase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : 3.2.1.93 Position : 2238156 - 2239823 bp Length : 1668 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF00128; match to protein family HMM TIGR02403 DNA sequence : ATGAAAGATTTTAAAAAAAGTGTAGTCTATCAAATCTATCCAAAATCCTTTAATGATACTAATGGTGACGGATTGGGAGA TTTAAAAGGAATTACAGTTAAATTGGATTATTTAAAAACATTAGGCATAGATTATATATGGTTAACTCCTTTTTATATTT CTCCTCAAAGGGATAATGGATATGACGTAGCAGATTATTGCAATATTGATCCTCTATTTGGTACCATGGAAGATTTTGAA AATCTAGTTAGAGAAGCAAATAAAAGAGGAATTGATGTTATGCTTGATATGGTATTTAATCATACCTCTACAGAACATAA ATGGTTTAAAAATGCTCTAAGTGGCGATAAAAAATATAAAAATTATTATATATTCAAAAAACCTAAAAATGGACAGCTCC CTACCAACTGGGAATCTAAATTTGGAGGTCCCACTTGGGAATATGTTAAAGAGTTTGATGAATATTACCTACATCTATTT GATGCTACTCAAGCAGACCTTAACTGGGAAAATGAAGAAGTTAGAACAGAAGTTTTTGATATTGTGAATTTTTGGATAAG AAAAGGTGTAAAAGGCTTTCGTTTTGATGTTATTAACCTAATTTCAAAACCAATGGAATATAAGGATGATAATAATGGAG ATGGTCGTTCATTCTACACGGATGGTCCTAATATTCATAACTATATAAAAGAGCTCAATAAAGAAACCTTTGGCAGATAT AAAGATATAATTACTGTAGGTGAAATGTCCTCTACCACCATAGATAATTGCATTAAATATTCAAATCCTAAAGAAGAAGA ATTGTCTATGGTATTTAATTTTCATCATCTAAAAGTAGATTATAAAGATGGTGATAAATGGAGCTTAATGGATTTTGATT TTATAAAATTAAAGAATCTCTTTAATCATTGGCAGGTTGGAATGGAAGAAAGTAATGGTTGGAATGCAATATTTTGGTGC AACCATGACCAACCTCGTATTGTATCTCGCTTTGGAGATGATAATAAATACCATAAAGAATCTGCAAAAATGTTAGCTAC ATCAATACATTTACTTAGAGGAACACCTTATATCTATCAAGGAGAAGAAATAGGTATGACAAATTGTTATTATGATACAA TTAATTCCTATAGGGATGTGGAATCAATTAATTTTTATAATATACTAAAATCTGAAGGTAAAACTAAAGAAGAAATAATT AAAATTCTACAATCGAAATCTAGAGATAATTCCCGTAGTCCAATGCAATGGGATAACTCAAACAATGCTGGTTTTACTAA AGAAGATCCTTGGATAAAAGTATGCAAAAACTATAAAGATATTAATGTAGAAAACTCCTTAAAAGATAAAGATTCAATTT TTTATCATTATAAAAAATTGATTAAGTTAAGAAAAGAGTGTGATGTTATATCTTATGGAGATTTTGAATTAATATTAGAA GAAGATAAAAGTATATTTGCTTATTTAAGAAATTACAAAAATGAAAAACTACTTGTAATAAATAATTTCTATGGAAAGGA ATCCTTATTTAAATTGCCTACAGAATTAAAATTAGATGAATATAAAAACAAAATTTTGATTTCTAATTATAAGAATTCTC CTATAAACTTTAGAAAAATTAATCTAAGACCTTATGAGTCTATAGTTTACCATCTTGAGAGAAAATAA Protein sequence : MKDFKKSVVYQIYPKSFNDTNGDGLGDLKGITVKLDYLKTLGIDYIWLTPFYISPQRDNGYDVADYCNIDPLFGTMEDFE NLVREANKRGIDVMLDMVFNHTSTEHKWFKNALSGDKKYKNYYIFKKPKNGQLPTNWESKFGGPTWEYVKEFDEYYLHLF DATQADLNWENEEVRTEVFDIVNFWIRKGVKGFRFDVINLISKPMEYKDDNNGDGRSFYTDGPNIHNYIKELNKETFGRY KDIITVGEMSSTTIDNCIKYSNPKEEELSMVFNFHHLKVDYKDGDKWSLMDFDFIKLKNLFNHWQVGMEESNGWNAIFWC NHDQPRIVSRFGDDNKYHKESAKMLATSIHLLRGTPYIYQGEEIGMTNCYYDTINSYRDVESINFYNILKSEGKTKEEII KILQSKSRDNSRSPMQWDNSNNAGFTKEDPWIKVCKNYKDINVENSLKDKDSIFYHYKKLIKLRKECDVISYGDFELILE EDKSIFAYLRNYKNEKLLVINNFYGKESLFKLPTELKLDEYKNKILISNYKNSPINFRKINLRPYESIVYHLERK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 1e-126 | 48 |
