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Name : HSM_1217 (HSM_1217) Accession : YP_001784541.1 Strain : Haemophilus somnus 2336 Genome accession: NC_010519 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-fucose transporter Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0738 EC number : - Position : 1374864 - 1376156 bp Length : 1293 bp Strand : + Note : TIGRFAM: L-fucose transporter; PFAM: major facilitator superfamily MFS_1; KEGG: hso:HS_0750 fucose permease DNA sequence : ATGAAAAATATTCAACAAATGCCCGATGGTTATCTCAATAAAACACCTATTTTCCAATTTATTTTGCTTTCTTGTTTATT CCCACTTTGGGGAGCAGCAGCCAGCTTAAATGATATTTTAATCACTCAGTTTAAAAGTGTATTTACGCTGAGTGATTTTG CCAGTGCTTTAGTACAAAGTGCATTTTATGGAGGATATTTTTTAATTGCGATACCTGCATCATTGGTGATCAAAAAAACC AGCTATAAAATTGCTATTTTAATTGGCTTAATGCTATATATCGGTGGTTGTTCACTGTTCTATCCAGCCTCGCATATGGC AACATACACAATGTTTTTAGTGGCTATTTTCTCTATTGCGATTGGGTTAAGTTTCTTGGAAACCTCTGCGAATACTTATA GTTCAATGATTGGACATAAAGATCATGCAACATTGAGATTAAATATAAGCCAGACTTTCTATCCAGTTGGTGCTATTTCA GGTATTTTATTAGGTAAATACCTCATCTTCCAAGAAGGTGCCAGTCTTGAAGAACGAATGGTAGGAATGACACCGGAACA GTTGCATTCATTTAAATTATCAATGTTAGAACATACGTTATCGCCATATAAATACTTAATCTTCATATTGATTGCGGTTA CTTTTTTATTCGTAATTACCTCTTTTCCTAAATGTAAAGCAGTTACACAAACAGGTAAATCAGAAGTGAAATTTACCGAT ACGCTAAAATATCTAGCAAGTAATACAAAATTTAAAAAGGGAATTGTTGCTCAATTTCTCTACGTTGGTATGCAAGTTGC CGTATGGTCATTTACTATTCGTTTGGCACTCAATTTAAGTGATATGAATGAACGTGAAGCCTCAAATTTTATGATTTATA GCTTTATTGGATTCTTTATTGGCAAATTTGTCGCTAATTTCTTAATGACTAAATTTAAGTCAGATCTCGTTTTACTTTGG TATTCCATTTTAGGTGTGATCACTCTAGCTTATACCTCTTTTGTTCATGATTTTTCTGCTGTTTATGCGGCTATTTTCGC CAGTTTGTTGTTTGGTCCTTGCTGGGCAACAATCTATGCCTCCGTACTGGATACTGTTAAGCAAGAGCATAGAGAAGTGG GTGGGGCTGTTGTCGTCATGTCTATTATCGGTGCAGCTGTTGTTCCCGCAATTCACGGTTATGTCTCAGATACATTAGGA TCTCTCCAACTTGCATTTATTGTACCTTTATTCTGTTTTGCTTATGTTGGCTATTATTTTTATGGAAAATTAAAAGAAAA CAAGGAGAAATAG Protein sequence : MKNIQQMPDGYLNKTPIFQFILLSCLFPLWGAAASLNDILITQFKSVFTLSDFASALVQSAFYGGYFLIAIPASLVIKKT SYKIAILIGLMLYIGGCSLFYPASHMATYTMFLVAIFSIAIGLSFLETSANTYSSMIGHKDHATLRLNISQTFYPVGAIS GILLGKYLIFQEGASLEERMVGMTPEQLHSFKLSMLEHTLSPYKYLIFILIAVTFLFVITSFPKCKAVTQTGKSEVKFTD TLKYLASNTKFKKGIVAQFLYVGMQVAVWSFTIRLALNLSDMNEREASNFMIYSFIGFFIGKFVANFLMTKFKSDLVLLW YSILGVITLAYTSFVHDFSAVYAAIFASLLFGPCWATIYASVLDTVKQEHREVGGAVVVMSIIGAAVVPAIHGYVSDTLG SLQLAFIVPLFCFAYVGYYFYGKLKENKEK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| deoP | ADD91723.1 | permease DeoP | Not tested | PAI-I AL862 | Protein | 5e-148 | 72 |
| unnamed | CAE85172.1 | hypothetical protein | Not tested | PAI V 536 | Protein | 2e-147 | 71 |
