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Name : potB (CLD_0188) Accession : YP_001780208.1 Strain : Clostridium botulinum Okra Genome accession: NC_010516 Putative virulence/resistance : Unknown Product : spermidine/putrescine ABC transporter permease PotB Function : - COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism COG ID : COG1176 EC number : - Position : 687374 - 688333 bp Length : 960 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF00528 DNA sequence : ATGTGGGGGAAATTTAGCAATGCTTTTTCAAATATTTTTAAAAAGCAATTGCATAATAAAAATACGGATATTATTTTAGA AGACAAAGAAGGAATAAGAGGTAAACTAAAAAAATCTACCCCTATATTTAAAACAGTGGGGCCCGTTGCCCTATGGCTCA TTACATTTTTTATTGTTCCTTTACTTCTTGTATTAGTGGTTAGTTTTCTATCAAGAGGTGAATATGGAGACGTAAGATTA CCTTTTACACTAAAAAATTATAAAAGACTCATGGATCCTATGTACGGACAAATTTTAATTAAAACTTTAATGATTTCTAT TAGTACTACTTTAGGGTGTTTGATTATAGGTTATCCTTTTGCATATTTTATTGGAAGATCAAACAAAAAATATAGAGGAA TACTATTATTATTAGTTATACTACCTTTTTGGACTAATTCTTTAGTTCGAACTTATGCATGGATAATACTTTTAAAAACA GAGGGAGTAATTAACACATATCTTATGAAATTTGGATTAATTCACTCTCCATTGCAAATGCTTTATACAGATGGTGCTGT ATTTATAGGAATGCTTTATATAATGTTACCTTTTATGGTGCTACCTATTTATACATCTATAGAAAAATTAGATATGAGTT ATGTAGAAGCTGCCAATGATCTTGGAGCATCACCTTACAAGACCTTTAAAGAAATAACGTTACCATTAACTCTACCGGGT ATTATAGCAGGATGTATGCTTGTATTTATACCAACCTTAGGTTATTTCTTTATATCTGACTTAATGGGTGGAAGTAAAAC TATGTTAATTTCAAATCTAATCAAAAATCAATTTTTAACCTCTAGAGATTGGCCCTTTGGTTCAGCTATAGCAGTAATAT TAATTATTTTAATGCTTATAGCTATAGGTTTTTATTTTAAAGGAAATAAACCAAAGAAGGGGATAAAGGAGGTTAGCTAA Protein sequence : MWGKFSNAFSNIFKKQLHNKNTDIILEDKEGIRGKLKKSTPIFKTVGPVALWLITFFIVPLLLVLVVSFLSRGEYGDVRL PFTLKNYKRLMDPMYGQILIKTLMISISTTLGCLIIGYPFAYFIGRSNKKYRGILLLLVILPFWTNSLVRTYAWIILLKT EGVINTYLMKFGLIHSPLQMLYTDGAVFIGMLYIMLPFMVLPIYTSIEKLDMSYVEAANDLGASPYKTFKEITLPLTLPG IIAGCMLVFIPTLGYFFISDLMGGSKTMLISNLIKNQFLTSRDWPFGSAIAVILIILMLIAIGFYFKGNKPKKGIKEVS |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| potB | BAA36746.1 | - | Not tested | LIM | Protein | 6e-60 | 52 |
