|
Name : treC (CLD_2637) Accession : YP_001781551.1 Strain : Clostridium botulinum Okra Genome accession: NC_010516 Putative virulence/resistance : Unknown Product : alpha,alpha-phosphotrehalase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : 3.2.1.93 Position : 2133055 - 2134722 bp Length : 1668 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF00128; match to protein family HMM TIGR02403 DNA sequence : ATGAAAGATTTTAAAAAAAGTGTAGTCTATCAAATCTACCCAAAATCCTTTAATGATACTAATGGTGATGGATTGGGAGA TTTAAAAGGAATTACAGTTAAATTGGATTATTTAAAAACATTAGGTATAGATTATATATGGTTAACTCCTTTTTATATTT CTCCTCAAAGGGATAATGGATATGATGTAGCGGATTATTGCAATATTGATCCTCTATTTGGTACCATGGAAGATTTTGAA AATCTAGTTAGAGAAGCAAATAAAAGAGGAATTGATGTTATGCTTGATATGGTATTTAATCATACCTCTACAGAACATAA ATGGTTTAAAAATGCTCTAAGCGGCGATAAAAAATATAAAAATTATTATATATTCAAAGAACCTAAAAATAGACAGCTCC CTACTAACTGGGAATCTAAATTTGGAGGTCCCGCTTGGGAATATGTTAAAGAGCTTGATGAATATTACCTACATCTATTT GATGCTACTCAAGCAGACCTTAACTGGGAAAATGAAGAAGTTAGAACAGAAGTTTTTGATATTGTGAATTTTTGGATAAA AAAAGGTGTGAAAGGCTTTCGTTTTGATGTTATTAACCTAATTTCAAAACCAATGGAATATAAGGATGACAATAATGGAG ATGGTCGTTCATTCTACACAGATGGTCCTAATATTCATAACCATATAAAGCAACTAAATAAAGAAACCTTTGGCAGATAT AAAGATATAATTACTGTAGGTGAAATGTCCTCTACCACCATAGATAATTGCATTAAATATTCAAATCCTAGAGAAGAAGA ATTGTCTATGGTATTTAATTTTCATCATCTAAAAGTAGATTATAAAGATGGTGATAAATGGAGCTTAATGGATTTTGATT TTATAAAAGTAAAAAATATCTTTAATCATTGGCAGGTTGGAATGGAAGAAGGTAATGGCTGGAATGCAGTATTTTGGTGC AACCATGACCAACCTCGTATTGTATCTCGCTTTGGAGATGATAATAAATACCATAAAGAATCTGCAAAAATGTTAGCTAC ATCAATACATTTACTTAGAGGGACTCCTTATATTTATCAGGGAGAAGAAATCGGTATGACAAATTGTTATTATGATACAA TTAATTCCTATAAGGATGTGGAATCAATTAATTTTTATAATATACTAAAGGCTGAAGGTAAAACTGAAGAAGAAATAATT AAAATTTTACAGGCAAAATCAAGAGATAATTCCCGTAGTCCAATGCAATGGGATAACTCAAACAATGCTGGTTTTACTAA AGAAGATCCTTGGATAAAAATATGCAAAAACTATAAAGATATCAATGTAGAAAACTCCTTAAAAGATAAAGATTCAGTTT TTTATCATTATCAAAAACTGATTAAGTTAAGAAAGGAATACGATATTGTATCTTATGGAAATTTTGAATTAATATTAGAA GAAGATAAAAGTATATTTGCTTATTTAAGAAATTACAAAAATGAAAAACTACTTGTAATAAATAATTTCTATGGAAAGGA ATCCTTATTTAAATTGCCTACAGAATTAAAATTAGGTGAATATAAAAACAAAATTTTAATTTCTAATTATAAGGATTCTC CTATAGATTTTAGAAAAATTAATTTAAGACCTTATGAGTCTATAGTTTACCATCTTGAGAGAAAATAA Protein sequence : MKDFKKSVVYQIYPKSFNDTNGDGLGDLKGITVKLDYLKTLGIDYIWLTPFYISPQRDNGYDVADYCNIDPLFGTMEDFE NLVREANKRGIDVMLDMVFNHTSTEHKWFKNALSGDKKYKNYYIFKEPKNRQLPTNWESKFGGPAWEYVKELDEYYLHLF DATQADLNWENEEVRTEVFDIVNFWIKKGVKGFRFDVINLISKPMEYKDDNNGDGRSFYTDGPNIHNHIKQLNKETFGRY KDIITVGEMSSTTIDNCIKYSNPREEELSMVFNFHHLKVDYKDGDKWSLMDFDFIKVKNIFNHWQVGMEEGNGWNAVFWC NHDQPRIVSRFGDDNKYHKESAKMLATSIHLLRGTPYIYQGEEIGMTNCYYDTINSYKDVESINFYNILKAEGKTEEEII KILQAKSRDNSRSPMQWDNSNNAGFTKEDPWIKICKNYKDINVENSLKDKDSVFYHYQKLIKLRKEYDIVSYGNFELILE EDKSIFAYLRNYKNEKLLVINNFYGKESLFKLPTELKLGEYKNKILISNYKDSPIDFRKINLRPYESIVYHLERK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 3e-126 | 48 |
