Gene Information

Name : Swoo_2139 (Swoo_2139)
Accession : YP_001760518.1
Strain : Shewanella woodyi ATCC 51908
Genome accession: NC_010506
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : R : General function prediction only
COG ID : COG1033
EC number : -
Position : 2619311 - 2621623 bp
Length : 2313 bp
Strand : +
Note : KEGG: sse:Ssed_2477 hypothetical protein

DNA sequence :
ATGTTAGATAAAATAGTCAATGGATTTGAATCCTTCCTATTTCGGCACAGGATTTTTGTCATACTCCTGTTTATGCTGAC
CACCCTATTTTTGGGGTTTCAAGCAAGTAACTTAAAGATGGATGCGGCGTTTATTAAGAATATTCCGCTAAATCATAGTT
ATATGCAGACCTATTTAAAACACCAGAAGCAGTTTGGTGGCGCCAACAGCATTATGGTGGCGGTAGAGGACACCAGCGGT
GATATCTTCAACGAGACATTTTTCGATGCGTTGAAAAATGTTCACGATCAACTTTTCTTTATCCCCGGAGTGGATAGGGC
GCAGGTTAAATCTCTTTTCTCCCCCTCAACACGCTTTACCGAAGTGGTGGAAGATGGATTTGCCGGTGGTCCAGTGATCC
CCGCAGATTTCTCAACCACAGAGCTGGGACTGTCTGTGGTTAGAGGGAATATTGAGAAAGCGGGCATTGTTGGACGTTTA
ATTGCTGAAGATTATTCCGCAGCGATGGTGTCAGCACAGTTGATGGATTTTGACCCTCAAACAGGGGAGCCTCTAGATAC
ACTCGCGTTTGCAGAACAGTTAGAGCAGGAGCTAAGAACTCAGTTTGAAAATGATGAGATAAAAATCCATATTATTGGTT
TTGCCAAGATGGCGGGTGATGTGGCTGAAGGTGCCAAAGGCGTTATGCTTTTCTTCCTTATTGCCATCTTAGTTACCGCG
GTAATGGTGTACCTGTTTTCAAAATCATTAGTACTGACTTTTTTACCTTTGGCTTGTAGTTTAATTGCGGTAATTTGGCA
ATTAGGTTTGCTAACGGTTGTGGGCTTTGGCTTAGACCCAATGTCCATCTTGATCCCTTTCCTGGTGTTTGCCATTGGCG
TGAGCCACAGTGTGCAGATGATCAATGCGGTGAGGAGAAGGGTAGCCGATGGTGAGTCAACTAAAGCAGCATCAGCTTCC
GCTTTTCGTAGCCTACTCATTCCAGGTGGTATCGCTTTACTCTCAGATACAGTGGGTTTCTTAACCTTACTGGCTATTGA
TATTGGTATTATTCGTGAGCTAGCTATCTCAGCGTCATTGGGCGTCGGGGTGATTATCCTGACTAACTTGATCTTACTAC
CTTTAGTTATCTCATTTACTAAAGTATCAGTGGCTAACACCTCTAAAGATCCAGCTGAAAGTAAAATTAATCAGCTCTGG
AGAAAACTCTCTCTTTTTGCTACGCCTAAGTATGCAACTTGGGTGTTGATAATTACCGCTGTACTTTATGGGGTAGGTGT
TCAGCAAGCGAGTTTGATGAAGGTGGGCGATCTACAAGGCGGGGCACCTGCACTGCACTTTGATTCAAGGTACAACCAAG
ATACCTTTTACATTACCGATAAATTCTCAATAACCACAGATGTCATGACTGTGATTGTAGAGGCGTTTCCCGAAGCCTGT
ACCTATCACTCAGTGCTTAATCAAATTGATGAGTTTGAATGGATCATTGGTAACACACCTGGGGTTGAGTCAACGGCGAG
TTTAGCGTCAGTGGCCAAAAGGGTGAATGCTGGGTTTAATGAGGGTAATCCTAAGTGGCAGGTATTACCTAGAACAACAG
CTAGCTTAGTTCAAGCGGTTGGCCGAGTGCCTACAACTTCAGGACTGTTAAACAGTAATTGCTCTGTGATGCCTGTTTAT
CTGTTTTTGAAAGATCATAAAGCAGAAACTATTGAGTTAGTTATTGAGCGAGTTAAAGCGCTCTCTGCTGAGATGGACAA
TGATAAGATCCAATTTAAGCTCGCATCAGGCCCTGTAGGGGTGATGGCTGCAACCAATGAAGCGGTGGCTGAAGCACAGT
TCCCAATGATGCTTTATGTTTATGGTGCGGTTTTTGTCCTTTGTTTGATTAGCTTTAGATCGTTAAGAGCAACAATCTCA
GTTATCTTGCCTCTTTATGTCGTTTCAACGTTGGCTCAGGCTCTAATGACTCAGCTCGATATTGGCCTGGCGGTGAGTAC
TTTGCCTGTTATTGCATTGGGGGTGGGAATTGGTGTTGATTACGGCATCTATATCTTGTCTACAATGGCGGTGAGGTTAA
GGGACGGTATGCCGGTTCAAGAAGCATATTTCGAAGCACTCGTTGAGCGAGGAAGCGCAGTGATATTTACTGGTCTGACC
TTAGCTATTGGTGTGAGTACTTGGTTTTTCTCTGCCTTGAAGTTCCAGATGGACATGGGGATCTTGCTCACATTTATGTT
TTTAGTAAATATGTTGGGTGCCATAATTATTTTACCCGCTATCGGGGCATTTTTCTGGCGAAAACCCAGATAG

Protein sequence :
MLDKIVNGFESFLFRHRIFVILLFMLTTLFLGFQASNLKMDAAFIKNIPLNHSYMQTYLKHQKQFGGANSIMVAVEDTSG
DIFNETFFDALKNVHDQLFFIPGVDRAQVKSLFSPSTRFTEVVEDGFAGGPVIPADFSTTELGLSVVRGNIEKAGIVGRL
IAEDYSAAMVSAQLMDFDPQTGEPLDTLAFAEQLEQELRTQFENDEIKIHIIGFAKMAGDVAEGAKGVMLFFLIAILVTA
VMVYLFSKSLVLTFLPLACSLIAVIWQLGLLTVVGFGLDPMSILIPFLVFAIGVSHSVQMINAVRRRVADGESTKAASAS
AFRSLLIPGGIALLSDTVGFLTLLAIDIGIIRELAISASLGVGVIILTNLILLPLVISFTKVSVANTSKDPAESKINQLW
RKLSLFATPKYATWVLIITAVLYGVGVQQASLMKVGDLQGGAPALHFDSRYNQDTFYITDKFSITTDVMTVIVEAFPEAC
TYHSVLNQIDEFEWIIGNTPGVESTASLASVAKRVNAGFNEGNPKWQVLPRTTASLVQAVGRVPTTSGLLNSNCSVMPVY
LFLKDHKAETIELVIERVKALSAEMDNDKIQFKLASGPVGVMAATNEAVAEAQFPMMLYVYGAVFVLCLISFRSLRATIS
VILPLYVVSTLAQALMTQLDIGLAVSTLPVIALGVGIGVDYGIYILSTMAVRLRDGMPVQEAYFEALVERGSAVIFTGLT
LAIGVSTWFFSALKFQMDMGILLTFMFLVNMLGAIIILPAIGAFFWRKPR

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
unnamed AAK01517.1 transport protein Not tested PAGI-1 Protein 4e-128 42