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Name : nrdE (LCK_01557) Accession : YP_001728824.1 Strain : Leuconostoc citreum KM20 Genome accession: NC_010471 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha Function : - COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism COG ID : COG0209 EC number : 1.17.4.1 Position : 1634125 - 1636296 bp Length : 2172 bp Strand : - Note : Catalyzes the rate-limiting step in dNTP synthesis DNA sequence : ATGCCGTTAAAAGAGATTAACATAGATGAAGTAACATATTTTGACCTAAATAATCAGGTTAATATACCCAAGAATAATCA AATACAGTTAGATAAAGATCAAGAGGCGCTAGATGCCTTTTTGAAAGAAAATGTCTGGCCAAATGTTTTGAAATTTGATT CATTAGCTCAACGATTTGATTGGCTGTTTGATAATCAATTCATTGAACGAGAATTTATCGCACAATATGATTTGTCATTT ATTGAAAAATTATATGCTTATCTTGAAGGTGAACATTTTAATTTCAAGTCTTTTATGGCTGCTTTTAAGTTTTATAATCA GTATGCACTAAAAACAAATGATGGCCAATACTATGTCGAAACATATGTAGACCGTGTGGCTATGAATGCTTTGTATTATG CTAACGGTCAAGAGTCATTGGCACTTAAGTTGGCTGATGAAATGATTCATCAACGTTATCAACCAGCAACCCCTAGCTTT TTAAATGCTGGTCGTGCACGGCGAGGTGAGTTGGTATCTTGCTTTATCATTCAAACATCTGATGATATGAATTCAATTGG ACGTACAATTAATTCAGCATTGCAGTTATCTAAGATGGGTGGCGGGGTTGGTATTAATGTTTCCAATGTTCGCGAGGCTG GGGCACCTGTTATGGGCATTGCTAATTCAGCTGGTGGTGTTGTACCCATTATGAAATTGTTAGAAGATTCATTTACATTT TCATCGCAGGTTGGTGCTCGTCAAGGTGCTGGTGTTGTCTACTTATCTATTTTCCACCCAGACATTATGGCCTTTTTGTC AACAAAAAAAGAAAATGCTGATGAAAAAGTGCGTGTGAAGACACTATCTTTGGGGCTTACGGTACCAGATAAATTCTACG AATTAGTTCGCCAAAATAAGACAATGTACTTGTTTAGCCCAGTTGATGTGGAAAAAGTGTATGGCCAATCATTCAATTAT GTTGATATAACAGCGGAATACGATAATATGGTTGAAAATGATGCAATTACCAAGTATCGTGTTGATGCACGCATGTTAGA AGAAGAAATTTCAAAACTTCAGCAAGAGTCTGGGTATCCTTATATTATCAACATTGATGTAGCTAATAGAGAAAACCCAA TTGCAGGTAAAATTGTCTCTTCTAACCTCTGTTCTGAAATTTTACAAGTGCAAAGACCTTCAGACATTGATAATGGGCAG CAGTATACGCGTTTAGGGTCAGATGTCAGTTGTAACTTGGGATCCATCAATATCGTTAATATGATGGCAACGCAAGATTT TGATACATCTGTTGATACAATGGTGCGTGCCTTGACATTTGTATCAGACACATCTAATCTTGATGTGGTACCTTCAATTG ATAAAGGTAATAAAGAAAAGCATGCTATTGGGCTTGGCGCAATGGGATTAGCAGCTTATTTTGCACAAAATCAAATGTAC TATGGTGATGAAGAAGCGCTGGACTTTACAACAACTTTCTTTATGACGCTGAATTATTATTCTATTAAGTCATCTATGCG CATTGCAAAAGAGCGTCACGAAACATTTTATGAGTTTGAGAAGTCAACGTATGCAAACGGTGCCTACTTTGATAAGTATA TTAACAATGATTGGCAGCCTAAAACGCAAAAGGTTGCGCAAGCTTTTGCGCCACACCATCTGCCAACTAAAAATGATTGG TTGACATTGAAAGACGACGTTGCAAAATATGGCATGTATCATGCATACCGCCATGCGATTGCACCAACAGGTTCTATTTC ATACGTTAACGACACAACGGCAACGTTATTACCTATTGTGAATAAGATCGAAGAACGTCAAGAAGGGATGATTGGTAAGG TATATTATCCAGCGCCTGGTTTAAGTGATGAAACTATGCCATATTACGTATCGGCCTATGACACGGATATGCGTAAAGTA ATAGATGTCTATGCTGCTGCACAAGAGCATATTGATCAAGGAATGGCGTTGACATTATTTATGCGTTCAACACTTTCTGA TAAGCTTTACGAATGGAAAAAAGGTAGAACGGATAAAATGACAACGCGCGATTTAACTATTTTGCGTCACTATGCCTTTA ATAAGGGTATCAAGTCGTTATATTATGTACGTACTTTTACAGACGACAACCAAGAGTCTGGTGTTAATGAATGTGAAAGT TGCTCAATCTAA Protein sequence : MPLKEINIDEVTYFDLNNQVNIPKNNQIQLDKDQEALDAFLKENVWPNVLKFDSLAQRFDWLFDNQFIEREFIAQYDLSF IEKLYAYLEGEHFNFKSFMAAFKFYNQYALKTNDGQYYVETYVDRVAMNALYYANGQESLALKLADEMIHQRYQPATPSF LNAGRARRGELVSCFIIQTSDDMNSIGRTINSALQLSKMGGGVGINVSNVREAGAPVMGIANSAGGVVPIMKLLEDSFTF SSQVGARQGAGVVYLSIFHPDIMAFLSTKKENADEKVRVKTLSLGLTVPDKFYELVRQNKTMYLFSPVDVEKVYGQSFNY VDITAEYDNMVENDAITKYRVDARMLEEEISKLQQESGYPYIINIDVANRENPIAGKIVSSNLCSEILQVQRPSDIDNGQ QYTRLGSDVSCNLGSINIVNMMATQDFDTSVDTMVRALTFVSDTSNLDVVPSIDKGNKEKHAIGLGAMGLAAYFAQNQMY YGDEEALDFTTTFFMTLNYYSIKSSMRIAKERHETFYEFEKSTYANGAYFDKYINNDWQPKTQKVAQAFAPHHLPTKNDW LTLKDDVAKYGMYHAYRHAIAPTGSISYVNDTTATLLPIVNKIEERQEGMIGKVYYPAPGLSDETMPYYVSAYDTDMRKV IDVYAAAQEHIDQGMALTLFMRSTLSDKLYEWKKGRTDKMTTRDLTILRHYAFNKGIKSLYYVRTFTDDNQESGVNECES CSI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 6e-171 | 48 |
