|
Name : recG (LCK_01304) Accession : YP_001728572.1 Strain : Leuconostoc citreum KM20 Genome accession: NC_010471 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent DNA helicase RecG Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG1200 EC number : 3.6.1.- Position : 1367919 - 1369949 bp Length : 2031 bp Strand : - Note : catalyzes branch migration in Holliday junction intermediates DNA sequence : ATGATGACACGTGATGATAATGTGAATGTATTGCCTGGTGTTGGGCCAAAAAGGCTCGAGGCATTACATGAAATTGGTAT TTTTACAATTGAAGATTTAGTCACTTATTTTCCTTTTCGCTATGAAGATTTAGGTGAGCGGGTGCCTTCTGAAACGTTAG ATGGGGACAAAGTGACATTTAAAGGGATTGTTAGTACACCAGCTGTAATGACACGTTTTGGCAAAAAAACACAGACACGT TTTGGATTGTTAATTGCCCATGAAAATATTCGTGTCACTTTTTTTAATCAGCCTTGGATTACGCAAAACATCATTGTTGG TGAGGAAATTGCAGTTTACGGCACATATAACGCTGCAAAAGCTGCTATGACAGGCATAAAAATGATTAATGCTTCGGTCG ATGGGCTAGATCCTATCTACCCAGCAACCAAGCAAATTGCTGCTAAAACAATTCGACATTTAATTGAAATCGCTTGGTCT GAAGTCAGGGGAACAATACCGACACTTGTGCCGGAAACTATCCGACAAAAGTATCGTTTATTGGATCGCAATACCCAGAT TGAAAATATGCATTTTCCAGTCGACATGGCTGCAGCGAAAGCAGGTCGTCGCAGTGCTGCATTTGAAGAGTTTTTCATTT TTCAAATGCGACTACAGTTACTAAAATTAGCAGACCAAAACTTTGCCGGAGAAAGTATTGATTATGATGAGACGGCGCTA GTTAATTTTGAACAAGCTTTGCCATTCGAGCTGACAGCTGCACAGCAAAAAGTTATTCAGGAAATACTTCAAGATCAAAA AAGACCGCGACACATGAACAGACTCTTACAGGGAGATGTGGGTTCAGGGAAAACAGTTGTAGCTGCTATGACCATGTACG CAGCGGTGACGGCTGGTTGTCAGGCGGCAATTATGGCACCAACAGAAATTTTAGCGCAGCAACATGCGATGAATTTAGCC CAATTATTTGATAATGCTGGTGTTAACGTACGTGTTGAATTGTTAACTAGTGGGCTAAAAGTAGCAGCTCGGCGTCATTT ATTAGAAGATCTTGAAAACGGTACAATTGACATTTTGGTTGGGACACATGCGTTACTACAACCAGATGTTGCCTTTCATC ATCTCGGTTTAGCTGTTATTGATGAGCAACACCGGTTCGGGGTTAATCAACGCGCAAAATTACGTGAAAATGGGGTTAAT CCTGATATTTTAGCCATGACGGCTACGCCTATTCCACGGACATTGTCTATTACAGCTTATGGGGAAATGGATATTTCAGT CATTGATCAATTGCCCAGTGGGCGAAAGACCATACAAACAAAACGATTGCGTCACAATCAGTTAGATACAGCACTGGACT TTGTTAAACAGCAAATTGACCTGGGTGCCCAAGCTTATATTGTCACACCGTTAATCGAGGAATCCGAATCGTTGGATGTA CAAAACGCTACTGCTATGTATGAAGCGATGCAACTTGAATTACCTCAATATCAGATTGGTTTATTGCATGGTCGTTTATC GAATGATGAAAAAAAGCAGTTAATGGAAGATTTCAAAGCTAATCGCATTCAAATTCTGGTGGCAACGACAGTCATTGAGG TAGGTGTTGATGTACCTAATGCTAGTGTGATGCTAATTTTGGATGCGGATCGTTTTGGCTTGGCGCAGTTGCATCAGTTG AGAGGGCGTGTCGGGCGTGGTAAGCGACAGTCATACACAATTCTCGTAGCTGATCCTAAAACTGATTATGGGACTGCACG TTTGGATGCTATGGTTGAAACAACCGATGGGTTTGTTTTAGCGCAACGGGATTTGGACTTGCGAGGTGCTGGCGATATTT TAGGCACGAAACAATCGGGTGTGCCAGAATTTAATGTTGGAGACCCAGTAAAAGACTTGCGAATGTTAGAGATTGCCCAA CAAGAAGCCATCGCTATCGTGAGTGATAAAACATGGGATCAAGCGCCAGCAAATCAAGCGTTGGTTAATTATTTATCTCG GACAATGGCGCAGTATCGACACTTTGATTAA Protein sequence : MMTRDDNVNVLPGVGPKRLEALHEIGIFTIEDLVTYFPFRYEDLGERVPSETLDGDKVTFKGIVSTPAVMTRFGKKTQTR FGLLIAHENIRVTFFNQPWITQNIIVGEEIAVYGTYNAAKAAMTGIKMINASVDGLDPIYPATKQIAAKTIRHLIEIAWS EVRGTIPTLVPETIRQKYRLLDRNTQIENMHFPVDMAAAKAGRRSAAFEEFFIFQMRLQLLKLADQNFAGESIDYDETAL VNFEQALPFELTAAQQKVIQEILQDQKRPRHMNRLLQGDVGSGKTVVAAMTMYAAVTAGCQAAIMAPTEILAQQHAMNLA QLFDNAGVNVRVELLTSGLKVAARRHLLEDLENGTIDILVGTHALLQPDVAFHHLGLAVIDEQHRFGVNQRAKLRENGVN PDILAMTATPIPRTLSITAYGEMDISVIDQLPSGRKTIQTKRLRHNQLDTALDFVKQQIDLGAQAYIVTPLIEESESLDV QNATAMYEAMQLELPQYQIGLLHGRLSNDEKKQLMEDFKANRIQILVATTVIEVGVDVPNASVMLILDADRFGLAQLHQL RGRVGRGKRQSYTILVADPKTDYGTARLDAMVETTDGFVLAQRDLDLRGAGDILGTKQSGVPEFNVGDPVKDLRMLEIAQ QEAIAIVSDKTWDQAPANQALVNYLSRTMAQYRHFD |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 1e-86 | 41 |
