Gene Information

Name : LCK_01184 (LCK_01184)
Accession : YP_001728455.1
Strain : Leuconostoc citreum KM20
Genome accession: NC_010471
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : major facilitator superfamily permease
Function : -
COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism
COG ID : COG2814
EC number : -
Position : 1232740 - 1234119 bp
Length : 1380 bp
Strand : -
Note : COG0477GEPR

DNA sequence :
ATGACAAATCAATCAACAAAAAAAATTTCAAGTACGTATATCTATTTCTTTGGTGCATTTGGTGGGATTCTCTTCGGCTA
TGACATCGGTGTCATGACAGGCGCGTTACCATTTTTACAACGAGACTGGCATTTGACAGACGCTGGTGTCATTGGTTGGA
TCACTTCTGCTCTCATGCTAGGTGCTATCGCTGGTGGTGCTTTAGCTGGACAATTATCAGATAAACTCGGGCGTCGACGT
ATGATCTTAGCGTCATCATTTGTATTTGCGATTGGTGCCCTTATGGCTGGCTTATCGCCTCACAACGGTGTTGCTTGGTT
GTTAATCGCACGTGTATTGCTAGGTATAGCTGTTGGTGCCGCTTCCGCATTGGTACCTTCTTATATGTCAGAAATGGCAC
CAGCCAAAACAAGAGGCCGGTTATCTGGATTGAATCAATTAATGATTGTCTCAGGGATGCTACTATCTTACATTGTCGAT
TTCCTACTGCAAGGATTGCCACATGGGATGGCGTGGCGTTTAATGCTTGGGTTGGCTGCTGTGCCGGCAATAATTCTCTT
TCTTGGCGTGTTGAAGTTGCCAGAATCACCACGTTTCTTAGTAAAAATAAATGATTTAGCTGCAGCAAGACATGTTTTGA
CCTTTATTAGGCGAGACAATGAAATTGAACCTGAATTAGTTGAGATACAAAGAACAGTGTCAATGGAATCAAGCGCACAG
AAAAACGTCACCTTAGCGACACTTTTCTCGAGTAAGTATCGCTATCTTGTAACCGCTGGTATTGGTGTTGCAGCTTTCCA
GCAGTTCATGGGTGCTAATGCCATTTTCTACTACATTCCATTAATTGTTGAAAAAGCAAGTGGGCAAGCAGCATCTAGCG
CATTATTATGGCCAATCGTACAAGGTGTGATTTTAGTGCTAGGCGCTATTCTATACATGGTTATTGCTGATAAATTTAAG
CGACGGACTTTGTTGATGATTGGTGGTACAGTGATGGCGCTATCATTTCTTATGCCAGCAGCACTAAATGCTTTGGTAGG
CGAACATCATTTACCACCAATGCTGATTGTTGTTTTCTTATCAATATTTGTGGCTTTCTACTCTTTCACTTGGGCACCAT
TAACTTGGGTATTGGTTGGCGAAGTCTTTCCTTTAGCTATTCGTGGCCGGGCAAGTGGCCTAGCTTCTTCGTTTAATTGG
CTTGGTTCATTTGCGGTTGGTTTGTTATTCCCAATCATGACGGCAATGATGCCTCAGGCATCCGTCTTTGCTATCTTTGG
TGTCATCTCAATTATTGCGGTATTGTTCATTAAATTTGCGGTACCAGAAACGCATGGTAGAACATTAGAAGAAATTGAAG
CACAGGGTACAAACCATTAA

Protein sequence :
MTNQSTKKISSTYIYFFGAFGGILFGYDIGVMTGALPFLQRDWHLTDAGVIGWITSALMLGAIAGGALAGQLSDKLGRRR
MILASSFVFAIGALMAGLSPHNGVAWLLIARVLLGIAVGAASALVPSYMSEMAPAKTRGRLSGLNQLMIVSGMLLSYIVD
FLLQGLPHGMAWRLMLGLAAVPAIILFLGVLKLPESPRFLVKINDLAAARHVLTFIRRDNEIEPELVEIQRTVSMESSAQ
KNVTLATLFSSKYRYLVTAGIGVAAFQQFMGANAIFYYIPLIVEKASGQAASSALLWPIVQGVILVLGAILYMVIADKFK
RRTLLMIGGTVMALSFLMPAALNALVGEHHLPPMLIVVFLSIFVAFYSFTWAPLTWVLVGEVFPLAIRGRASGLASSFNW
LGSFAVGLLFPIMTAMMPQASVFAIFGVISIIAVLFIKFAVPETHGRTLEEIEAQGTNH

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SH0071 YP_251986.1 hypothetical protein Not tested SCCmec Protein 8e-58 42