Name : polA (LCK_01127) Accession : YP_001728398.1 Strain : Leuconostoc citreum KM20 Genome accession: NC_010471 Putative virulence/resistance : Unknown Product : DNA polymerase I Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG0749 EC number : 2.7.7.7 Position : 1172091 - 1174772 bp Length : 2682 bp Strand : - Note : COG0749L DNA sequence : ATGACAAAAAAACTACTTTTAATTGATGGGAATTCATTAGCTTTTCGGGCATTTTATGCAATGTATAATCAGCTGGATCG TATGATTTCACATAAGGGTTTACACACAAATGCGCTTGTGGCCTTTAATAATTTTCTAGATCAAATTGTTGATCCCATGC AACCAGATTTGGCTGTTGTTGCATGGGATGCGGGATCAGGTAAGACAACTTTTCGTGGTGAACTGTTTTCTGAGTATAAA GATGGCCGCTCTAAAGCGCCTTCAGAATTCACTGAACAATTTCCATATCTTCGTGAAATGGTTGCATTACATGGTCTACG AAACTATGAACAACCGGGGTTGGAAGCTGATGATATCATTGGTACTTTTTCTCGTATGGGTGAACAGGCTGGTTACAATG TCATTATTGTTACGGGAGACCAAGATTTAACGCAATTGGCAACTGACAATATTACTGTTAATGTCACGAAAAAGGGTGTC ACAGAAATTGAAGCTTTTACCCCAGACTATATTATGGAAAAATTTGAACTGACGCCAAGCCAGATTATTGAGAAAAAGGC GTTAACTGGTGATACATCAGATAATTACCCAGGTGTCACTAAAATTGGTGAAAAAACAGCTTTAAAACTGTTGAAGACCT ATCACGATATTGATAACCTCTATCGTCATATCGATGATATGAAGCCTTCAAAAATGAAAGAAAACTTAATTAGCGATCAA GCATCAGCCTTTCGTGCCCGACAACTGGCAACAATTCTGACCGATGCGACGCTGGATTTGCCATTAGAAGAGTTAGAGTA CCGTGGTATCGATTATGATAAGCTTGTACCATTCTATGAAAATATTGATTTCAAAAAGCAGCTGGCTAAAATTAAAGCCA GTCAAAAGTCAGGACAATTAGTGAGCCATAATCAATCGACAGAGCGGCCCTTATCAGTTGTTACCTTAAATGAAAATAAT TTACGGGCAATCGCCATGATGGTTGATAAGGTGGCGGTTCATATTGAGATGAGTGGTTCAAATTATCATACAGCTGATAT GATTGGTTTTGTGATTGGGAATCCCGCCACTGGTTATTATGCTAGTCGAGATATGTCATTGTTACAGAAACCAGAATTAC GTGCTGTCATCGAAAATGGGGACATTAAGAAGAATGTCTTCAATGTCAAAGCACAGTTAATTCTGTTTAAACGGTTAGGG CTCACCTTAAAAGGCGCGCAATTTGACTTTTTATTAGTCGCTTATCTTCTTGATACAACAGATAATGATAATGAGATGTC TACATTAGCACAGCGATTTGACGTTTATTTGACTGAAGACGAAGAAATTTATGGTAAAGGTGCTAAATATGCTGTTCCTG ATGATGAGGAACTTGTCCTCATGCATTTAGCACATAAAGCTGATGCCTTGATACAGCTAGAAATGCCTGCTTTATCAGCA CTGCAGAGTCATCAACAAACTCATTTATATACAGAAATTGAGTTGCCTTTAGCTCATGTTCTGGCTGAGATGGAGTACCA AGGCTTTAAGATTGACCGAAAACGTTTACAAGTAATTGGCGAAGATTTAGAAGCACGTATTCATACGATAGAAGAAGCAA TCTATCTTGAAGCTGGGGAGAAATTTAATTTAAATTCACCAAAGCAGTTAGGCATACTACTCTTTGAAAAAATGGGCTTA CCGATTATTAAAAAAACTAAAACAGGCTATTCTACAGCTGTTGATGTGTTGGAAAAACTGGCATCACAAGCACCAATTGT CGAGCATATTTTGCAGTACCGTCAATTAGCTAAGATAAAGTCTACTTATGTTGAAGGGTTATTAGCAGTTGTTCACACGG AAGATAGTAAAATTCATACGCGTTTTTTACAAACATTGACGCAAACAGGGCGACTATCTTCTGTTGATCCTAATTTACAA AATATCCCTATGCGTACGGAAGAGGGCCGTCAAATAAGACGTGCGTTTGTCCCTAGTCAACCTAACTGGCAGATTTTTGG TGCTGATTATTCACAGATTGAGTTGCGCGTATTAGCACATATTACCGGAGACCAGAATATGCAGCGTGCCTTTTTGAATG GCGAAGATATCCATGCTGAAACGGCACGTGCGGTTTTTGGCTTAGATAATAATGCGCCAGTTGATCCTTTGATGCGACGA ACTGCTAAAGCTGTTAATTTTGGTATTGTTTATGGTATTTCCGACTATGGTCTGTCAAACAACTTAGGTATCTCTCGTGC TGAAGCCAAAAGATTTATTGAGACGTATTTCAAGGAATTCCCACAAATCCATGAATGGATGACAAAAATTAAAGCACAGG CACACGAACAGGGTTATGTTGAAACCATTGCTAAGCGCAGACGCTATTTACCTGAAATTAAATCAAAAAACTTTAACTTA CGGAGTTTTGCGGAGCGTACTGCGATGAACTCGCCTATTCAAGGTTCAGCTGCTGATATCATTAAAATTGCTATGATAAA GGTTGCTGATGCTCTGAAAGACAATCAATTACAAGCAAATATTCTACTACAGGTTCACGATGAACTTATTTTTGAAGCAC CAGAAGATGAGATTGAAACGCTACGAGACATTGTGACACGAGTAATGGATTCAGCGGTTGCTTTGGATGTGCCGATGCAA GTTGATAGCCATTATGGTAATACTTGGTATGATGCCAAATAA Protein sequence : MTKKLLLIDGNSLAFRAFYAMYNQLDRMISHKGLHTNALVAFNNFLDQIVDPMQPDLAVVAWDAGSGKTTFRGELFSEYK DGRSKAPSEFTEQFPYLREMVALHGLRNYEQPGLEADDIIGTFSRMGEQAGYNVIIVTGDQDLTQLATDNITVNVTKKGV TEIEAFTPDYIMEKFELTPSQIIEKKALTGDTSDNYPGVTKIGEKTALKLLKTYHDIDNLYRHIDDMKPSKMKENLISDQ ASAFRARQLATILTDATLDLPLEELEYRGIDYDKLVPFYENIDFKKQLAKIKASQKSGQLVSHNQSTERPLSVVTLNENN LRAIAMMVDKVAVHIEMSGSNYHTADMIGFVIGNPATGYYASRDMSLLQKPELRAVIENGDIKKNVFNVKAQLILFKRLG LTLKGAQFDFLLVAYLLDTTDNDNEMSTLAQRFDVYLTEDEEIYGKGAKYAVPDDEELVLMHLAHKADALIQLEMPALSA LQSHQQTHLYTEIELPLAHVLAEMEYQGFKIDRKRLQVIGEDLEARIHTIEEAIYLEAGEKFNLNSPKQLGILLFEKMGL PIIKKTKTGYSTAVDVLEKLASQAPIVEHILQYRQLAKIKSTYVEGLLAVVHTEDSKIHTRFLQTLTQTGRLSSVDPNLQ NIPMRTEEGRQIRRAFVPSQPNWQIFGADYSQIELRVLAHITGDQNMQRAFLNGEDIHAETARAVFGLDNNAPVDPLMRR TAKAVNFGIVYGISDYGLSNNLGISRAEAKRFIETYFKEFPQIHEWMTKIKAQAHEQGYVETIAKRRRYLPEIKSKNFNL RSFAERTAMNSPIQGSAADIIKIAMIKVADALKDNQLQANILLQVHDELIFEAPEDEIETLRDIVTRVMDSAVALDVPMQ VDSHYGNTWYDAK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
polA | YP_281523.1 | DNA polymerase I | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 52 |