|
Name : ABAYE3500 (ABAYE3500) Accession : YP_001715257.1 Strain : Acinetobacter baumannii AYE Genome accession: NC_010410 Putative virulence/resistance : Unknown Product : general secretion pathway protein Function : - COG functional category : N : Cell motility COG ID : COG1450 EC number : - Position : 3556775 - 3559051 bp Length : 2277 bp Strand : - Note : Evidence 3 : Function proposed based on presence of conserved amino acid motif, structural feature or limited homology; Product type pt : transporter DNA sequence : ATGGCTTTATTGAATCATCAACGTCCACTTTGGGCATTACTTGCAGCAGCCCCATTGATTGCGACAGTAAGTAGCAGTGC CTATGCCCAAACATGGAAGATCAATTTACGTGATGCTGACTTAACTGCCTTTATTAATGAAGTTGCAGACATTACAGGAA AGAACTTCGCTGTAGATCCGAGAGTACGTGGTAATGTCACGGTTATTTCTAATAAGCCATTAAATAAAGATGAAGTTTAT GACCTATTTCTTGGGGTCTTAAATGTAAACGGGGTGGTTGCAATTCCTTCTGGTAATACCATTAAGCTTGTACCGGATAG CAATGTTAAAAACTCGGGAATTCCTTATGATTCTAGAAATAGGGTCCGTGGTGATCAAATCGTTACACGTGTGATTTGGC TGGAAAATACTAATCCAAATGACTTAATTCCAGCACTCCGTCCCTTAATGCCGCAATTTGCACATATGGCGGCAATTGCA GGAACCAATGCACTTATTGTTTCTGATAGAGCTGCGAATATTTATCAACTTGAAAATATTATTCGTAACTTGGATGGAAC TGGGCAAAATGATATTGAAGCGATCACGCTTCAGTCGAGCCAAGCAGAAGAAATTATTACCCAGCTTGAAGCGATGAGCG CAACAGGCGCATCTAAAGATTTTAGTGGTGCCCGTATTCGTATTATTGCTGATAATCGGACAAACCGTATTTTAATAAAA GGTGATCCGCAAACACGTAAACGTATTCGTCATATGATTGAGATGCTGGATGTACCTTCGGCAGATCGTTTAGGTGGCTT AAAAGTTTTCCGTTTGAAATATGCCAGTGCTAAAAACTTGTCTGAAATTTTGCAAGGCTTAGTCACAGGACAGGCAGTAT CTTCATCGAATAATAGTAATAATTCATCTAACTCATCGAATCCGATTAATAGTTTAATTGGTAATAACCAGAATTCTGGT TCAAATACATCGGGTTCAAATGGTGCCTCAATTTCAACTCCTGCAATTAACCTAAACGGTAATTCGAACAGTAGTAATCA GAATAATATCACCAGCTTTAATCAAAACGGTGTGAGTATTATTGCAGATAATGCTCAGAACTCATTAGTAGTTAAAGCTG ATCCCCAATTAATGCGTGAAATTGAATCAGCGATTCAACAACTAGATGTTCGTCGTCAACAAGTGCTTATTGAGGCCGCA ATTATTGAAGTCTCTGGAGATGATGCAGATCAACTTGGAATTCAATGGGCACTCGGTGATTTATCTAGTGGGATTGGTTT ACTTAGCTTTAGTAATGTAGGGGCGAGTTTATCTTCTATCGCTGCTGGTTATTTATCGGGTGGTTCGGCTGGAGCTGCAT CTGCTATCGCTAATGGAGCTAATAAAGGTAATGGTGCGACTTTAGGATTGGGCAATTTTGATAATTCTCGTAAGGCATAT GGTGCACTAATTCAGGCTCTCAAAACCAATACTAAATCAAACTTACTTTCGACACCGTCCATTGTGACGATGGATAATGA AGAAGCTTATATTGTTGTAGGTCAGAACGTTCCATTTGTCACAGGGTCGGTTACTACCAATAGTACAGGTATCAATCCCT ATACAACTGTTGAGCGTAAAGATGTCGGTGTGACCTTGAAAGTTGTTCCACATATCGGTGAAGGGGGTACTGTTCGTTTA GAAGTAGAGCAAGAAGTTTCTGCTGTTCAAGATAGCCGTGGGCAAGCAGCTGACTTGGTGACAAGTAAACGCGCTATTAA AACAGCTGTTTTAGCCGAGCATGGGCAGACTGTGGTGCTAGGTGGATTGGTGTCGGATGACACTTCGCTTTCAAGACAAG GTATACCTGGTTTAAGTAGTATTCCTTATGTTGGGCGATTGTTCCGATCAGATAACAGAAGCAATGTAAAACGTAACCTT CTCGTTTTTATTCACCCAACAATTGTGGGCGATGCAAATGATGTACGCCGTTTATCTCAGCAGCGCTATAATCAACTTTA TAGCTTGCAATTGGCTATGGATAAAAATGGCAACTTTGCAAAATTACCTGAGCAAGTTGATGATATTTATAACCAAAAAA TGACCCCGCCGAGTATTGCCTCTAAGCCAAAAAATTACCAACAGGTTCCATCAGGTGGTAAAAGTTCGACCATAACTACG CCGGTAGCTGTAGAACCTACCGTCCAAAAGCAAACACTACAGTTGCCTGATCCTGAAATTAATCGTACTAAAAATACAGT AACAACAACGACACTGCGTCCAAGCACAGCGCCGTAG Protein sequence : MALLNHQRPLWALLAAAPLIATVSSSAYAQTWKINLRDADLTAFINEVADITGKNFAVDPRVRGNVTVISNKPLNKDEVY DLFLGVLNVNGVVAIPSGNTIKLVPDSNVKNSGIPYDSRNRVRGDQIVTRVIWLENTNPNDLIPALRPLMPQFAHMAAIA GTNALIVSDRAANIYQLENIIRNLDGTGQNDIEAITLQSSQAEEIITQLEAMSATGASKDFSGARIRIIADNRTNRILIK GDPQTRKRIRHMIEMLDVPSADRLGGLKVFRLKYASAKNLSEILQGLVTGQAVSSSNNSNNSSNSSNPINSLIGNNQNSG SNTSGSNGASISTPAINLNGNSNSSNQNNITSFNQNGVSIIADNAQNSLVVKADPQLMREIESAIQQLDVRRQQVLIEAA IIEVSGDDADQLGIQWALGDLSSGIGLLSFSNVGASLSSIAAGYLSGGSAGAASAIANGANKGNGATLGLGNFDNSRKAY GALIQALKTNTKSNLLSTPSIVTMDNEEAYIVVGQNVPFVTGSVTTNSTGINPYTTVERKDVGVTLKVVPHIGEGGTVRL EVEQEVSAVQDSRGQAADLVTSKRAIKTAVLAEHGQTVVLGGLVSDDTSLSRQGIPGLSSIPYVGRLFRSDNRSNVKRNL LVFIHPTIVGDANDVRRLSQQRYNQLYSLQLAMDKNGNFAKLPEQVDDIYNQKMTPPSIASKPKNYQQVPSGGKSSTITT PVAVEPTVQKQTLQLPDPEINRTKNTVTTTTLRPSTAP |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| BJAB07104_00335 | YP_008207800.1 | Type II secretory pathway, component PulD | Not tested | AbaR25 | Protein | 0.0 | 100 |
| BJAB0868_00339 | YP_008211665.1 | Type II secretory pathway, component PulD | Not tested | AbaR26 | Protein | 0.0 | 100 |
