Gene Information

Name : yocR (Bsph_0617)
Accession : YP_001696370.1
Strain : Lysinibacillus sphaericus C3-41
Genome accession: NC_010382
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : neurotransmitter:Na+ symporter
Function : -
COG functional category : R : General function prediction only
COG ID : COG0733
EC number : -
Position : 629390 - 630730 bp
Length : 1341 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
GTGTCATCAAGAGATCAATTTACAACTAAAATTGGGTTTATTTTAGCTGCTGCTGGAAGTGCTATAGGACTAGGAGCCAT
TTGGAAATTCCCATATATGGCTGGTACTAATGGTGGTAGTGTCTTTATTTTATTATTCGTTTTATGTACATTCTTTATCG
GCTTACCAGTACTCATTGCAGAGTTTATGATTGGTCGTCGTGGACAAAAGGATGCTGTCACATCCTTTAAAGAACAGGCG
CCAGGAAAGCCATGGTATTTAATTGGATGGGGCGGTATGGTCATTGCGGGCCTTATCTTATCTTTCTATAGTGTTGTAGG
TGGGTGGATTTTAAGCTATTTGGGTCGTGCCTTTACTTTTAAGCTAACGAATGCAGGTTCTGACATCAATTTTGCAGATT
TATTTGGCAATATAATTGCGAGTCCATTTGAAGCAGTTCTTGTGCAAGGGCTATTTATGTTATTGACAGTAGTCATTGTG
TCAGCTGGTATTAAGGGTGGCATTGAAAAAGCCAGCACATGGATGATGCCGCTCTTGTTTATTTTCTTCATTATATTAGT
CATACGCTCTTTAACATTGGATGGAGCAATGGAAGGCGTTAAATTTATGTTTGTGCCAGATTGGTCTTACCTGAATGCCG
AAACATTTTTAATGGCATTAGGACAAGCATTTTTCTCATTAAGTGTTGGTATTGCGGTTATGATTACCTATGCTTCCTAT
CTATCGAAAACAGAAAAAATTGGTAACTCAGCCATTAATGTTGCATCTATGAACATCATCATCTCTTTACTTGCTGGTCT
TGTTATTTTCCCAGCAGTATTCGCACTTGGCTATACACCCGATCAAGGACCTGGCCTCGTATTCATTATTTTGCCGGCTG
TTTTCGAGCAACTGCCTCTCGGTGCTCTTTTCTTAACCATCTTCTTTATTTTATTACTATTTGCCACAGTTACATCTTCC
ATCTCCATGTTAGAAATTGTCGTAGCAATAGCAATCGGAGATAAGCCAGAAAAACGGAAAAAAATTGCATGGATTGGTGG
CATCATTATCTTTATTGTTGGTATTCCTAGTGCATTGTCATTTGGTATACTATCAGATGTGAAGATTTTAGACCGTTCTA
TTTTTGATTTTGTTGATTTTATGACCAACAGCATCGGAATGCCTATTGGTGCTCTGCTCATATCAATTTTTGCAGGTTAT
TATTATACAAAAGATATTTCACGTAAAGAGCTAGCCGCATCTAGTTGGATATTTACAATTTGGTACATGTTAATTCGCTA
CGTGTCCCCTATTGCTATATTAATTATTTTCATTCAGGGCATCTTACCATTATTTAAATAA

Protein sequence :
MSSRDQFTTKIGFILAAAGSAIGLGAIWKFPYMAGTNGGSVFILLFVLCTFFIGLPVLIAEFMIGRRGQKDAVTSFKEQA
PGKPWYLIGWGGMVIAGLILSFYSVVGGWILSYLGRAFTFKLTNAGSDINFADLFGNIIASPFEAVLVQGLFMLLTVVIV
SAGIKGGIEKASTWMMPLLFIFFIILVIRSLTLDGAMEGVKFMFVPDWSYLNAETFLMALGQAFFSLSVGIAVMITYASY
LSKTEKIGNSAINVASMNIIISLLAGLVIFPAVFALGYTPDQGPGLVFIILPAVFEQLPLGALFLTIFFILLLFATVTSS
ISMLEIVVAIAIGDKPEKRKKIAWIGGIIIFIVGIPSALSFGILSDVKILDRSIFDFVDFMTNSIGMPIGALLISIFAGY
YYTKDISRKELAASSWIFTIWYMLIRYVSPIAILIIFIQGILPLFK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SAR0458 YP_039907.1 sodium:neurotransmitter symporter family protein Not tested vSa¥á Protein 8e-64 47
SAS0416 YP_042543.1 sodium:neurotransmitter symporter family protein Not tested vSa¥á Protein 8e-64 47