Gene Information

Name : Bsph_3003 (Bsph_3003)
Accession : YP_001698662.1
Strain : Lysinibacillus sphaericus C3-41
Genome accession: NC_010382
Putative virulence/resistance : Resistance
Product : Na(+)-dependent symporter
Function : -
COG functional category : R : General function prediction only
COG ID : COG4147
EC number : -
Position : 2963103 - 2964656 bp
Length : 1554 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGAATATTGTATCCGTTGGTTTCTTTTTAGCTATTGTTGGTTTAACACTCGTTGTTACCTATATTGCAGCAAAGCGCAC
TTCCTCAGCAGCTGATTTTTACACAGCTGGCGGCGGATTAAAGGGATGGCAAAACGGCTTTGCCATTGCTGGTGATTATT
TATCCGCAGCGGCATTTCTTGGGGTGTCGGGTGCGATTGCTTTAACTGGCTTTGACGGTTTCTTCTTCTCAGTGGGCTAT
GTTGTAGCCAATTTAGTGCTTCTATACGTTATTGCTGAGCCTATGCGCAATTTAGGCCGCTATACACTAGCTGACATGTT
AACGGCTCGTTTTAATGAAAAGCGAATTCGTGGCGTAGCTGCATCAGGTACGATTATTATTGTGATTCTTTATATGATTG
CACAGCTTGTAGGTGCAGGCGCATTGATTAAACTACTGTTCGGCATTGAATATTGGGTTGCTGTGTTAATTGTCGGTGTA
ATGATGACTACTTATGTTTTATTCGGTGGCATGACAGCCACGTCTTGGGTGCAAATTATTAAAGCTAGTCTACTATTATT
CGGGACAGGCTTATTAGCAATATTAGTATTAGTGAAGTTTGATTTCTCTCTAATGAAAATGTTTGACACAATTGCAGTCG
ATCATGGGGAGGAATTCCTTGTACCAGGAATTAAATACACAAGCACGATTGATTCTGTCTCTATGATGATGGCCCTAGTT
TTAGGAACATCCGGTTTACCACATATATTAATGCGCTTCTTTACTGTAAAAGATGCTAAAACAGCTCGTTCTTCTATTTC
ATGGACAACTTGGATTACAGCTATCTTCTTCTCGTTAACTATATTTTTAGGATTCGGCGCGTTAAACTTTGTCGGTCTCG
ATCAAATTTTAGCTGAAAGTAAGGCTGGTAACACAGCTGCTCCACTACTCGCACATTATTTAGGCGGTGATGTGTTAATG
GCATTTATTGGGGCTGTAGCCTTTGCAACAATTTTAGCTGTCGTTTCTGGCTTAGTATTAACAGGAGCATCCGCGATGTC
ACATGATATATATGGAGAAATTATGAAAGGTGGAAAATTAACAGAAAAGCAACAGGTAGTTGCAGCACGTACAGGCTCTA
TTTCCATTGCAATTGTCTCTATTGTTTTGGCGCTGTTTGCACAAAGCTTAAACGTTTCGTTTCTAGTGTCATTTGCGTTT
TGTATTGGTGCTTCCGCAAATTTACCTGTCATTCTTTATACTATCTATTGGAAGAAATTCAATTCTACTGGTGCTGTAGC
AGCCATGCTAACAGGGTTAATTTCTTGTTTAATCTTAGGAGCGATGGGACCAAATGTATGGAGTCCTGTTGAAGGTGCAG
CTATTTTTGTTGGTAAGCCACTTGTACCACTAGCTGTTCCGGCCATTATTACCATTCCATTAGGCTTTATTGCAGGTTAT
TTGGGATCAGTCCTTTCATCTAGTAAAGTACCGACTGAAGAGGCCGAGCGTATTTATAAAGAAATTCGTGTAAAAGCGAA
TACTGGCGTTTCTGTATCTGATATTTCACATTAA

Protein sequence :
MNIVSVGFFLAIVGLTLVVTYIAAKRTSSAADFYTAGGGLKGWQNGFAIAGDYLSAAAFLGVSGAIALTGFDGFFFSVGY
VVANLVLLYVIAEPMRNLGRYTLADMLTARFNEKRIRGVAASGTIIIVILYMIAQLVGAGALIKLLFGIEYWVAVLIVGV
MMTTYVLFGGMTATSWVQIIKASLLLFGTGLLAILVLVKFDFSLMKMFDTIAVDHGEEFLVPGIKYTSTIDSVSMMMALV
LGTSGLPHILMRFFTVKDAKTARSSISWTTWITAIFFSLTIFLGFGALNFVGLDQILAESKAGNTAAPLLAHYLGGDVLM
AFIGAVAFATILAVVSGLVLTGASAMSHDIYGEIMKGGKLTEKQQVVAARTGSISIAIVSIVLALFAQSLNVSFLVSFAF
CIGASANLPVILYTIYWKKFNSTGAVAAMLTGLISCLILGAMGPNVWSPVEGAAIFVGKPLVPLAVPAIITIPLGFIAGY
LGSVLSSSKVPTEEAERIYKEIRVKANTGVSVSDISH

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cur_1523 YP_001800917.1 transporter Not tested Not named Protein 2e-85 45

• Homologs from CARD and BacMet (resistance genes)

GeneGenBank Accn Product ID of source DB Alignment Type E-val Identity
Bsph_3003 YP_001698662.1 Na(+)-dependent symporter BAC0570 Protein 3e-75 48
Bsph_3003 YP_001698662.1 Na(+)-dependent symporter BAC0564 Protein 2e-82 43