Gene Information

Name : RrIowa_0660 (RrIowa_0660)
Accession : YP_001649930.1
Strain : Rickettsia rickettsii Iowa
Genome accession: NC_010263
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : cytochrome c oxidase polypeptide I
Function : -
COG functional category : C : Energy production and conversion
COG ID : COG0843
EC number : 1.9.3.1
Position : 549054 - 550655 bp
Length : 1602 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGGATATAACTACTACCGAAATTTATCACGATAGCCACCACACCCCACACGGTTGGAGGCGATGGCTTTTTTCTACCAA
TCACAAAGATATCGGCATTATGTATATCATATTTGCCGTTTTTGCCGGAATTGTCGGAGGTTTGTTCTCACTGCTTTTTA
GGTTAGAGCTTGCAATGCCCGGCGGCACTTTCTTAAATCATGATTTCCAGCTATATAACGTACTTATCACAGCACATGCG
GTTATTATGGTATTCTTTATGATTATGCCGGCTTTGTTCGGTGGCTTTGGTAACTATTTCGTACCTCTATTAATAGGGGC
TCCCGATATGGCATTTCCACGCCTTAACAATATCAGTTTTTGGCTACTAGTGCCTGCTTTTCTTTTACTTATGGGATCAG
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TAATATGAGAGCTCCGGGAATGGGACTTTTCAAGATGCCGTTATTCGTTTGGTCTATTTTAGTTACCGCATTTCTAATAA
TTCTTGCGATGCCGGTACTTGGTGGAGCTATTACTATGCTACTTACAGATCGTAATTTTGGAACTACTTTCTTTAAGCCT
GACGGCGGCGGTGATCCTGTATTATTTCAGCATCTATTTTGGTTTTTCGGTCATCCTGAAGTATATATCGTAATACTTCC
AGGCTTTGGTATAGTAAGTCAAGTTATTTCAACTTTTTCACGCAAACCTATATTCGGCTATCAAGGTATGATCGGGGCTA
TGGTGATCATAGGCTTTGTTGGATTTATCGTATGGGCTCACCATATGTTTACTGTCGGGCTTTCTTATAATGCACTTATA
TATTTCACTGCCGGAACGATGATTATAGCAGTTCCTACGGGTATTAAAATATTTAGCTGGATAGCGACTATGTGGGGTGG
TTCGATTACATTCCCAACTCCTATGCTATTTGCGATAGGATTTATTATATTATTCACGATCGGCGGCGTAACCGGCATAA
TCCTATCAAATTCGGCACTTGATAGAGTTCTGCACGATACATATTATGTTGTTGCACATTTCCATTATACGATGTCGCTG
GGTGCTTTATTTACGGCATTTGCAGGCTTTTATTATTGGTTTGGCAAAATATCTGGTAAACAATATCCGGACATTTTAGG
CAAAATTCATTTTTGGATTACCTTTATAGGCGTTAATTTAACTTTCTTCCCGCAGCATTTCTTAGGTCTTGCGGGCATGC
CAAGAAGAATACCGGACTACCCTGAAGCTTTCACCGGCTGGAATATGGTTTCGTCGATAGGAGCAGGTATTTCTATGTTT
GCTGCCCTTTATTTTGTATTTATCGTTTTCTATACGCTAAAATACGGCAAAGATTGTCCAAACAATCCTTGGGGAGAAGG
AGCAGACACATTAGAGTGGACACTTACCTCACCACCGCCGTTCCATACTTTTGAAACACCACCGCATATTGAGGGGTCAT
AG

Protein sequence :
MDITTTEIYHDSHHTPHGWRRWLFSTNHKDIGIMYIIFAVFAGIVGGLFSLLFRLELAMPGGTFLNHDFQLYNVLITAHA
VIMVFFMIMPALFGGFGNYFVPLLIGAPDMAFPRLNNISFWLLVPAFLLLMGSAFVDGGPGTGWTLYPPLSNLSGHPGAA
VDMAIFSLHLTGLSSILGSINLIVTIFNMRAPGMGLFKMPLFVWSILVTAFLIILAMPVLGGAITMLLTDRNFGTTFFKP
DGGGDPVLFQHLFWFFGHPEVYIVILPGFGIVSQVISTFSRKPIFGYQGMIGAMVIIGFVGFIVWAHHMFTVGLSYNALI
YFTAGTMIIAVPTGIKIFSWIATMWGGSITFPTPMLFAIGFIILFTIGGVTGIILSNSALDRVLHDTYYVVAHFHYTMSL
GALFTAFAGFYYWFGKISGKQYPDILGKIHFWITFIGVNLTFFPQHFLGLAGMPRRIPDYPEAFTGWNMVSSIGAGISMF
AALYFVFIVFYTLKYGKDCPNNPWGEGADTLEWTLTSPPPFHTFETPPHIEGS

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cur_1478 YP_001800872.1 cytochrome c oxidase subunit I Not tested Not named Protein 2e-95 47