Name : ACL_1089 (ACL_1089) Accession : YP_001621075.1 Strain : Acholeplasma laidlawii PG-8A Genome accession: NC_010163 Putative virulence/resistance : Unknown Product : surface-anchored NAD dependent sugar epimerase, putative Function : - COG functional category : M : Cell wall/membrane/envelope biogenesis COG ID : COG1086 EC number : - Position : 1124143 - 1126065 bp Length : 1923 bp Strand : - Note : this protein contains three predicted N-terminal transmembrane helix DNA sequence : ATGTGGGATATCAATATAAAAAGACATTTAAGGGGAGATTATATGTCAAGAAAAGAGAAGTTTATGGCTTTTTTAAAAGT TTATAAATATGTATTATACGATATAGCAACCATAGTTATATCCTATTACCTAACTATTTGGGTATTTAAAAACATGGGCG GAGGTATTGAACTCAATTATGACCATAAAGCACTATGGTTAGCTTTTGCATTTATCATACCAGCCAAAATTTTATTAAAC CAAATATTTGGGATTTATAGAATTATTTCTAAGTATGCTTCATTTGAGGATTTCTTTAGAATGATTCTTGTTGTAACTGG TACAAATATTTTATTAGTACTAGCAATATTCTTGTTCAATATAGAAGTGATGTCAGAGTCTGCATTTATTACAATCACAT TGATTGAAATAACCGGGATGATCATACCACGTATTATCAGACGAACAACTAGTTTGGTTGCATACCGTCTTAGATTAAAA GTTTCCCATGAAACAGGCGTTAGAACTTTGATTATTGGTGCAGGTTCTGCTGGTGAAATGGTGGTTAAAGAAATATACAA AAATAAATCTTTAAACAATGTGCTTATTGGATTTGTTGATGATGATAAAGAAAAAGTCGGAAGACAAATTATGGGTATTT CGATATTAGGTACTTTAGATAATATCAAAGAAATTGTAGGTAGATACGCAGTTCAAGAAGTCATTATCGCAATCAAAAAC TTTCCAAAACATAGATTCCATGAACTTGTAAACAGCTTGATTCAACTACACATTAAGGTTAAGAAATTAAACTTAATTGA AGATGTAAACCAAAATGAAGTATCGAAGTTAGTAGATTTAAAAGTTGAAGATTTACTCAATAGACCAGTTATTAAACTAG ATAACAAAGGAATTAGAGACTTTATCGGTGATGAAGTTGTCTTAGTCACTGGTGGCGGGGGTTCTATTGGTAGCGAGTTA TGTCGACAAATATTTGAACTGAATCCAAAACAATTAATTATTTTTGATATTTATGAAAATAATGCTTATGAAATTCAAAT GGAATTAAATCGTAAAGTGTATAAAGATTCCAGTAAACAATATCCAAAACTAGATGTACGTATTGGTAGTGTTTATAATA AAGTGAGATTAGAAGAAATCTTTAAAGAATTTAAACCAACCATTGTATTTCATGCAGCAGCTTATAAGCATGTACCTTTA ATGGAAGATAGTGCTGTAGAATCCGTTAGAACAAACGTTTTAGGTACTATGAATACAGCAAAACTTTCTACGAAGTACGG CGTTAAAAAATTCGTCTTAGTAAGTAGTGATAAAGCGGTGCGTTCTACAAACATTATGGGGGCTTCAAAACGTTTTGCTG AACTCATTATCTTTAATGAACAAAAACATAGTGAAACAAGCTTTACGGCGGTTAGATTTGGTAATGTACTAGGTTCTAAC GGTTCAGTAATTCCACTATTTAAAAAACAAATTGAAGATGGTGGCCCAGTCACTGTAACGCATAAAGAAATCACTAGATA CTTTATGACGATTCCTGAATCAGTTTCATTAATTTTACAGTGTGGTGCTTATGCTAAAAATGGTGAGTTATTTATTTTAG ATATGGGTGAACCAGTTAAAATTTATGAGTTTGCTGAAAAGATGATCCGCTTAGCAGGATACAGAGTTGATGAAGATATT AAAATTGAAGTCGTTGGTCTTCGTCCAGGTGAAAAACTTTATGAAGAACTTCTACTGGATGTAAATGATCCAAATATTCA TAAAACAGAAAACAAATTAATCTTCATTGAAAATGGTAATGGTAATCATTTAAATGTTGAATTAACAACACACTTATTAG ATAATCTAGAGTCTTTAACAAATGATGAAGTGAAACTACATGTATCACAAATAGTTTCATCATATGTTCCAAACAACAAG TAG Protein sequence : MWDINIKRHLRGDYMSRKEKFMAFLKVYKYVLYDIATIVISYYLTIWVFKNMGGGIELNYDHKALWLAFAFIIPAKILLN QIFGIYRIISKYASFEDFFRMILVVTGTNILLVLAIFLFNIEVMSESAFITITLIEITGMIIPRIIRRTTSLVAYRLRLK VSHETGVRTLIIGAGSAGEMVVKEIYKNKSLNNVLIGFVDDDKEKVGRQIMGISILGTLDNIKEIVGRYAVQEVIIAIKN FPKHRFHELVNSLIQLHIKVKKLNLIEDVNQNEVSKLVDLKVEDLLNRPVIKLDNKGIRDFIGDEVVLVTGGGGSIGSEL CRQIFELNPKQLIIFDIYENNAYEIQMELNRKVYKDSSKQYPKLDVRIGSVYNKVRLEEIFKEFKPTIVFHAAAYKHVPL MEDSAVESVRTNVLGTMNTAKLSTKYGVKKFVLVSSDKAVRSTNIMGASKRFAELIIFNEQKHSETSFTAVRFGNVLGSN GSVIPLFKKQIEDGGPVTVTHKEITRYFMTIPESVSLILQCGAYAKNGELFILDMGEPVKIYEFAEKMIRLAGYRVDEDI KIEVVGLRPGEKLYEELLLDVNDPNIHKTENKLIFIENGNGNHLNVELTTHLLDNLESLTNDEVKLHVSQIVSSYVPNNK |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
SSP0063 | YP_300153.1 | capsular polysaccharide biosynthesis protein | Not tested | SCC15305cap | Protein | 3e-76 | 42 |