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Name : lpdA (SMGWSS_103) Accession : YP_001597914.1 Strain : Candidatus Sulcia muelleri GWSS Genome accession: NC_010118 Putative virulence/resistance : Unknown Product : dihydrolipoamide dehydrogenase Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1249 EC number : - Position : 95982 - 97379 bp Length : 1398 bp Strand : + Note : predicted based on similarity to COG COG1249 and related proteins in nr [COG1249; C] DNA sequence : ATGAATTATTATGATGTTGTTGTAATAGGATCTGGTCCAGGTGGATATATATCTGCAATACGTTGTTCACAATTAGGATT TAATACCGCTATTATAGAAAAATATAAATATTTTGGGGGAACTTGTCTTAATGTAGGATGTATTCCATCAAAAACACTTT TATCTTCTGCGGAAAACTATCATAAAGCTAAAAATATGTTTTATAAACATGGAATAAAATTTGATAATCTATTATTAGAT TTTACTAAAATGATGAGTATAAAAAATAATATTATTAATAAAATTTGTGAGGGTATAAAATATTTATTTATTAAATATAA TATTAAAACTTATTTAGGAACAGCTAGCTTTAAAGATAAAAATACTATTTCTATTTTAGATTCTAAAATAGAGATAATAA AATTTACTTATGCTATAATAGCTACTGGATCTAAACCAATGGAATTACCCTTTGCAAAAATAGATGGAAATAAAATTATT TCATCTACAGATATTTTATCACTTAATTATATTCCAAAAAAATTATCAATAATAGGTGGTGGGGTTATAGGTATTGAATT AGGATCATTATATAATAAAATAGGATCAGATGTAACAATAATTGAATATGAAAAAAATATAATTAGTAATCTTGATTTAG ATTTAAGTAAAGAATTAAAAAATATTTTAAAAAAAAATGGGATTAAATTTTATCTTTCAACAAAAGTAGAAAGCATAGAT ATAATTAAATCTAATGTTAAAATTAATGCTAAAATAAAGAAAAATGATGAGATAAATATTATCTGTGATTGTTGTTTATT ATCAATAGGAAGAATTCCATATACAAATAATTTAGGATTAGAAAATATTGGCATAAAAAAAGATAAAAAAGGTTTTATAT TAGTAAATAATAATTTACAAACAAATATAGAAAATATATATGCTATAGGTGATGTTATTGGAGGATTAATGCTAGCACAT AAAGCTGAAAAAGAAGGAATATTTGTCTCAGACAAGATATATGGTAATAAAAATTTTATAAATTATAATTTAATACCATC TGTAATTTATACAAATCCAGAAGTAGCTAGTGTAGGAAAAAGTGAAAAAGAATTAAAATATTTTAATATAAAATATAAAA TAGGTAAATTCCCTATTAAAGCTTTAGGTAGGGCTATTTCTAGTGGAGAAATTAATGGATTTGTAAAAATATTATCTGAT GAATTAACAGATGAAATTTTAGGAATTCATATGATAGGTCCTAGAGTCTCAGATATAATAATTGAAGCAGTTTTAGCTAT GGAGTTTAAAGCTTCATCTGAAGATTTATCATTAATATCATATGCTCATCCTACTTTTACTGAAGCTGTTAAAGAAGCAG CATTAATTGCTACAGGGAATAAACCTATACATATATAA Protein sequence : MNYYDVVVIGSGPGGYISAIRCSQLGFNTAIIEKYKYFGGTCLNVGCIPSKTLLSSAENYHKAKNMFYKHGIKFDNLLLD FTKMMSIKNNIINKICEGIKYLFIKYNIKTYLGTASFKDKNTISILDSKIEIIKFTYAIIATGSKPMELPFAKIDGNKII SSTDILSLNYIPKKLSIIGGGVIGIELGSLYNKIGSDVTIIEYEKNIISNLDLDLSKELKNILKKNGIKFYLSTKVESID IIKSNVKINAKIKKNDEINIICDCCLLSIGRIPYTNNLGLENIGIKKDKKGFILVNNNLQTNIENIYAIGDVIGGLMLAH KAEKEGIFVSDKIYGNKNFINYNLIPSVIYTNPEVASVGKSEKELKYFNIKYKIGKFPIKALGRAISSGEINGFVKILSD ELTDEILGIHMIGPRVSDIIIEAVLAMEFKASSEDLSLISYAHPTFTEAVKEAALIATGNKPIHI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SE0077 | NP_763632.1 | dihydrolipoamide dehydrogenase component of pyruvate dehydrogenase E3 | Not tested | SCCpbp4 | Protein | 2e-63 | 41 |
