Name : lhv_1898 (lhv_1898) Accession : YP_001578042.1 Strain : Lactobacillus helveticus DPC 4571 Genome accession: NC_010080 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha Function : - COG functional category : F : Nucleotide transport and metabolism COG ID : COG0209 EC number : - Position : 1867933 - 1870122 bp Length : 2190 bp Strand : - Note : Catalyzes the rate-limiting step in dNTP synthesis DNA sequence : TTGCTGATGCAGGTGAAGACAATGACTGATAATCTTAATAATGATTCATATATTTCTTTAAATGCACTTACTAAATTTAA AGATGAAAAAGGAAATTATAATTTTAAAGCTGACAAGGAAGCTACTAAGCAATATCTTGAAAATCATATTGAACCAAGAA TGAAAAAGTTTGCTTCTTTAGAAGAAAAATTAGCTTATTTAGTTGATAATAATTACTATGATAAAAAAGTTCTAGATTTA TATACAGCTAAATTTATTAAAGAAATTTTCAAATTAGCTTATGCACAAAATTTTAGCTTTTTGAACTTTATGGGTGCAGC TAAATTCTATAAAGCATATGCCTTAAAAACAAACGATAATAAACAATTTTTAGAACGTTTTGAAGATCGGGCTGTTATGA ATGCTTTATTTTTAGCTGATGGCAATGAAGAACTGGCCTTGAATTTAGTTAAAGATATTATTAGTAATCGTTTCCAGCCA GCAACTCCGACTTTCTTGAATGCAGGTAAAAAGAGACGCGGTGAATATATTTCATGTTATTTGCTCAGAGTTGAAGACAA TATGGAATCAATTTCACGAGCAATAAGCACAAGTCTGCAATTATCTAAACGTGGTGGTGGTGTTGCTCTATGCTTAACTA ATTTGCGTGAATTAGGTGCACCTATTAAAAAAATGAAGAATTTATCTAGTGGGATAATTCCTGTAATGAAATTACTAGAA GATTCATTTTCTTATGCCAATCAATTAGGGCAAAGACAAGGTGCCGGTGCAGTTTATTTAAGTGCCCATCATCCCCAGAT TATGCAATTTTTAGATACTAAACGAGAAAACGCTGACGAAAAGGTAAGAATTAAATCTTTATCACTTGGCGTAGTGATTC CAGATATTACTTTTGAACTAGCCAAAGAAAATAAAAAGATGGCTTTGTTTTCACCATATGATATTAAACGTGAATATGGT AAACCAATGTCAGATATTTCAATTACTAAAGAATACCAAAATCTCCTTAATAATCCATGTATTAAAAAGACATTTATCAG TGCTAGAAAATTCTTCCAAACTATTGCTGAAGTTCAATTTGAATCAGGGTATCCTTATATTATGTATGAAGATACTGTCA ATCGAAGAAACCCACAAAAGAAATTGGGGCGGATCGTGATGTCTAATTTATGTTCAGAAATTGCTCAGGTTAATACGCCA AGTACCTATAATGAAGACTTAAGTTTTAATAAGACGGGCTACGATGTTTGTTGTAATTTAGGATCACTTAATATTGCAGC AGCAATGAATAGCGCTGACAAGTTAGGTAGTTTGGTTTCTGATAGTGTTCAAGCGCTTAATCGTGTTGCCAGGTCTTCAG ATTTAGATTGTGCTCCTTCAATTAAAAAGGGAAATAAAGCTAATCGAGCAATCGGTCTAGGAGCAATGAATTTACATGGC TTTTTAGCAACTAATCATATTTATTATGATTCACCAGAAGCAGTTGAATTTACAGGAATTTTCTTTTATACAATTGCATA CCATGCATTTAAAGAATCAAATAAATTAGCTGAAAAGTATGGTGCTTTTAAAGGATTCAAAGATTCATCATATGCTAGTG GTGATTATTTCAAAAAATTTATTGATGAGGAAGTCTCACCGAAAACAGACAAGATTAAAGAAATCGTAGCTAAATATAAA TTAGTTATTCCAACTAAAGAAGATTGGGAAGAATTGATTACTAAAATTAAAAAGACAGGTATAGCTAATGCTAACTTATT AGCAGTTGCACCTACTGGATCAATTAGTTATTTATCTTCATGTACACCAAGTTTGCAGCCAGTAGTAGCTCCTGTTGAAA CACGCAAAGAGGCTGCTTTGGGTCGAATTTATGTACCAGCTTATAAGATTAATAAAGACAATTATGAGTATTACGAAAAG GGTGCATATGAAGTAGGACCTAATGCTATTATTGATATTACAGCTGCTGCACAAAAGTATGTTGATCAATCAATTTCGTT AACTTTATTTCTTGAAGATAATGCAACAACAAGAGATTTAAATAAGGCTTATATTTATGCCTTTAAAAAGCGATGCAACT CAATTTATTATGTTAGAATAAGAGAAAAAGTTTTAGCTGGTAGTGAGAACTTGACTGCAGACGAATGTTTAATTCAAAAT GGTGCAGAATGCCAGAAATGTATGATTTAG Protein sequence : MLMQVKTMTDNLNNDSYISLNALTKFKDEKGNYNFKADKEATKQYLENHIEPRMKKFASLEEKLAYLVDNNYYDKKVLDL YTAKFIKEIFKLAYAQNFSFLNFMGAAKFYKAYALKTNDNKQFLERFEDRAVMNALFLADGNEELALNLVKDIISNRFQP ATPTFLNAGKKRRGEYISCYLLRVEDNMESISRAISTSLQLSKRGGGVALCLTNLRELGAPIKKMKNLSSGIIPVMKLLE DSFSYANQLGQRQGAGAVYLSAHHPQIMQFLDTKRENADEKVRIKSLSLGVVIPDITFELAKENKKMALFSPYDIKREYG KPMSDISITKEYQNLLNNPCIKKTFISARKFFQTIAEVQFESGYPYIMYEDTVNRRNPQKKLGRIVMSNLCSEIAQVNTP STYNEDLSFNKTGYDVCCNLGSLNIAAAMNSADKLGSLVSDSVQALNRVARSSDLDCAPSIKKGNKANRAIGLGAMNLHG FLATNHIYYDSPEAVEFTGIFFYTIAYHAFKESNKLAEKYGAFKGFKDSSYASGDYFKKFIDEEVSPKTDKIKEIVAKYK LVIPTKEDWEELITKIKKTGIANANLLAVAPTGSISYLSSCTPSLQPVVAPVETRKEAALGRIYVPAYKINKDNYEYYEK GAYEVGPNAIIDITAAAQKYVDQSISLTLFLEDNATTRDLNKAYIYAFKKRCNSIYYVRIREKVLAGSENLTADECLIQN GAECQKCMI |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
cur_1481 | YP_001800875.1 | ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha | Not tested | Not named | Protein | 0.0 | 57 |