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Name : lhv_1394 (lhv_1394) Accession : YP_001577679.1 Strain : Lactobacillus helveticus DPC 4571 Genome accession: NC_010080 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ATP-dependent DNA helicase RecG Function : - COG functional category : L : Replication, recombination and repair COG ID : COG1200 EC number : - Position : 1379094 - 1381124 bp Length : 2031 bp Strand : - Note : catalyzes branch migration in Holliday junction intermediates DNA sequence : ATGATAGAAAACGCATTATTTGCTCCTGTAACAGATTTAAAAGGTGTAGGGACAAAAACTGCGGCTGATTTAGGTAGCTT AGGCATTTATAGTATTTATGATTTGCTCTTTTATTTTCCTTTTCGCTATGACGAATTGCAGACGTTGCCTTTAGATCAAA TCATGGATGGTCAAAAGGTAGTGCTAAAGGGATTTGTAGCAACTGAACCATTTGTTAGTCGTTTTGGCTATAAAAAGAGC CGCCTAAGTTTCAAGATGAGAATTGACCATGATGTAATCATGGTCAATTTCTTTAATCAGCCATGGCTTAAGAGCAAGAT TGAAATTGGCGAAGAAGTAGCCATTTATGGCAAATATAATGTTGCTCGGCAAAGTCTTTCGGCTTTTAAGTTTATTGCAG CCAAAGAAAATGACAGTGGCATGGCGCCAATTTATCCGGTTAATCGGCATGTTAAACAAAAAAAGCTAGTTAGTTTAATT AACTTAGCAATAGATGTTTTTTTAGATCAAGTTCGTGATATTGTTCCTGAAAATATCAGAGAAAAATATCGCTTATTAAC TGATCAAGAGATTATTCAAAAAATGCATCATCCTAAAAATAGTACTGAAGCAAATTTAGCTAAAAGAAGTGCTATTTTTC GAGAATTTTTCATTTTTGAATTACAGCTGGCACTTTTGGCTAATCATGATGGCAAACAAGCAGGCTATCCTAAGAATTAT GATTTAAAGGAAATAGCTCAATTGACGTCTTCTTTGCCATTTGAATTATCAGATGATCAAAAAGAAGTTGTTAATGAAAT ATTTGCGGATATGCACTCATCTGGTCAGATGCGTCGCTTGTTGCAGGGGGATGTAGGATCAGGTAAAACGGTTGTAGCTG TTTATGCTATCTTTGCAGCAATTACTGCAGGCTATCAAGTTGCCTTGATGGTGCCAACCGAAATTTTGGCTACGCAGCAT TTTAAAAAAATTGATGAATTGCTTCGCCCATTGGGTGTAAGAGTGGCTTTGTTAACAGGTAATACCAAAACATTAGAGCG CAGAGAAATTTATCGCGAATTGATGGATGGTACGATTAATGTGATGATTGGTACACATGCTTTAATTCAAGAAAATGTCA TTTTTAAGAAGCTGGGTTTGGTAATTATTGATGAGCAGCACCGTTTTGGCGTTGGACAAAGACAAGCTTTAATCAATAAA GGCGATCAACCTGATATTTTAGCAATGACAGCTACGCCAATTCCACGTACGCTTGCTTTAACAGTATATGGGGACATGAC TGTTTCTGAAATTCATCACATGCCCGCTGGTAGAAAACCTATTATTTCATCTTGGAAAACTAGCACTCAGATGAAAGATG TTTATCAAAAAATGCAGGATCAACTTGATCAAGGCTTTCAAATTTATGCTGTTACGCCGCTGATTACTGAATCTGAAACA TTAGATTTAAAGAATGCTGAAGAATTGCATGCTAAATTAAGTCATGATTTTCCAGATCAAAAGGTGGTTTTGCTTCATGG GCAAATGCCAGGGCCTAAAAAAGATGAGATTATGATTGCTTTTGCAAGTGGAGAGATCAATATCTTAGTGACAACCAGTG TAATTGAAGTTGGAGTCGATGTAGCTAATGCCAATATGATGGTCATTTATAATGCAGATCGTTTTGGATTAAGCCAGCTG CACCAGCTTCGCGGTAGAATTGGTCGTGGCAAGACGCAAAGTTACTGCGTATTTGTAGCCGACCCTAAAACTGATTCTGG TAAGGCAAGAATGAAAATAATTGCCGCCACTAATGATGGCTTTAAATTAGCAGAAGAAGATCTTAAAATGCGTGGTGAGG GTGATCTTTTTGGTAAAGCTCAATCCGGATTGCCGGAATTTCGCGTGGGGGATGTAGTTAATAACTACAATACCTTGGTG GTTGCACAAAAAGTAGCCCGAGATCTAGTTCAACAAGATCCTAAATTAGCTGATTATCCAACGCTTAAACAAGTGCTAGA ATATAAACAATTAGAACAAAATAGAATTTAA Protein sequence : MIENALFAPVTDLKGVGTKTAADLGSLGIYSIYDLLFYFPFRYDELQTLPLDQIMDGQKVVLKGFVATEPFVSRFGYKKS RLSFKMRIDHDVIMVNFFNQPWLKSKIEIGEEVAIYGKYNVARQSLSAFKFIAAKENDSGMAPIYPVNRHVKQKKLVSLI NLAIDVFLDQVRDIVPENIREKYRLLTDQEIIQKMHHPKNSTEANLAKRSAIFREFFIFELQLALLANHDGKQAGYPKNY DLKEIAQLTSSLPFELSDDQKEVVNEIFADMHSSGQMRRLLQGDVGSGKTVVAVYAIFAAITAGYQVALMVPTEILATQH FKKIDELLRPLGVRVALLTGNTKTLERREIYRELMDGTINVMIGTHALIQENVIFKKLGLVIIDEQHRFGVGQRQALINK GDQPDILAMTATPIPRTLALTVYGDMTVSEIHHMPAGRKPIISSWKTSTQMKDVYQKMQDQLDQGFQIYAVTPLITESET LDLKNAEELHAKLSHDFPDQKVVLLHGQMPGPKKDEIMIAFASGEINILVTTSVIEVGVDVANANMMVIYNADRFGLSQL HQLRGRIGRGKTQSYCVFVADPKTDSGKARMKIIAATNDGFKLAEEDLKMRGEGDLFGKAQSGLPEFRVGDVVNNYNTLV VAQKVARDLVQQDPKLADYPTLKQVLEYKQLEQNRI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| recG | CAJ77039.1 | ATP-dependent DNA helicase | Not tested | AbaR1 | Protein | 3e-97 | 42 |
