|
Name : USA300HOU_2349 (USA300HOU_2349) Accession : YP_001576219.1 Strain : Staphylococcus aureus TCH1516 Genome accession: NC_010079 Putative virulence/resistance : Unknown Product : LctP family L-lactate permease Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 2486063 - 2487661 bp Length : 1599 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATGTTAGTAAATACGTTTAACCCATTTGATAATTTATTATTATCGTCTTTAATTGCAGCAATACCGATTGTACTGTTTTT ACTATGTTTAACTGTTTTTAAAATGAAAGGTATTTATGCAGCTATTACAACACTTGTTGTAACATTACTAATTGCAATAC CATTTTTCAAATTGCCAGTTGGTATCGCTTCTGGTGCAGTAGTCGAAGGTTTCTTCCAAGGTATCATTCCGATTGGCTAT ATCGTTATGATGGCAGTATTGTTATACAAAATTACTGTTGAATCTGGACAATTTTTAACAATTCAAGATAGTATTACAAA TATTTCACAAGACCAACGTATTCAAGTTTTACTTATTGGATTTGCATTCAACGCATTTTTAGAAGGTGCAGCAGGATTTG GTGTACCAATTGCAATTTGTGCACTTTTATTAACACAATTAGGATTTAATCCATTAAAAGCTGCGATGTTATGTTTAGTC GCAAATGCAGCGTCTGGTGCTTTTGGTGCGATTGGTATCCCTGTAGGTGTTGTAGAAACGTTGAAATTACCTGGAGATGT TTCAGTATTAGGTGTTTCTCAATCAGCAACTTTAACATTGGCAATCATAAATTTCATTATTCCATTCTTACTTATCTTTA TTATTGATGGTTTTAGAGGTGTTAAAGAAACATTACCAGCAATTTTAGTAGTTTCAATCACTTATACATTTACTCAAGGA TTATTAACTGTATTCAGTGGACCTGAATTAGCAGATATTATTCCACCGTTATTAACAATGTTAGCATTAGCAGTATTTTC TAAAAAATTCCAACCAAAACACATTTATCGTGTTAATAAAGATGAAGAAATTGAACCTGCAAAAGCACATTCTGCAAAAG CAGTATTACATGCATGGAGCCCATTCATTGTATTAACAGTCATTGTAATGATTTGGAGTGCGCCATTCTTTAAAAACTTA TTCTTACCAAATGGTGCTTTATCATCATTAGTATTTAAATTCAACTTACCTGGAACAATCAGCGAAGTTACGCATAAACC ATTAGTATTGACTTTAAATATTATTGGACAAACAGGTACAGCTATTTTATTAACTATTATTATTACAATTTTAATGTCTA AAAAGGTTAACTTTAAAGATGCAGGTAGATTATTCGGCGTTACATTTAAAGAGTTGTGGTTACCAGTTCTTACAATTTGT TTCATCTTAGCAATTTCTAAAATCACAACTTATGGTGGTTTAAGTGCAGCAATGGGTCAAGGTATTGCTAAAGCAGGTAA TGTCTTCCCAGTTCTATCACCAATTTTAGGTTGGATAGGTGTGTTTATGACAGGATCAGTTGTAAATAACAACTCATTAT TTGCACCAATTCAAGCTTCTGTTGCACAACAAATTGGAACAAGTGGTTCACTTCTTGTATCTGCTAATACAGTTGGTGGT GTAGCGGCAAAATTGATTTCACCACAATCAATTGCAATTGCAACTGCAGCAGTAAAACAAGTTGGTAAGGAATCAGAATT ATTAAAAATGACATTGAAATACAGTGTATGTTTACTAATATTCATCTGTATTTGGACTTTCATCTTGTCATTATTATAA Protein sequence : MLVNTFNPFDNLLLSSLIAAIPIVLFLLCLTVFKMKGIYAAITTLVVTLLIAIPFFKLPVGIASGAVVEGFFQGIIPIGY IVMMAVLLYKITVESGQFLTIQDSITNISQDQRIQVLLIGFAFNAFLEGAAGFGVPIAICALLLTQLGFNPLKAAMLCLV ANAASGAFGAIGIPVGVVETLKLPGDVSVLGVSQSATLTLAIINFIIPFLLIFIIDGFRGVKETLPAILVVSITYTFTQG LLTVFSGPELADIIPPLLTMLALAVFSKKFQPKHIYRVNKDEEIEPAKAHSAKAVLHAWSPFIVLTVIVMIWSAPFFKNL FLPNGALSSLVFKFNLPGTISEVTHKPLVLTLNIIGQTGTAILLTIIITILMSKKVNFKDAGRLFGVTFKELWLPVLTIC FILAISKITTYGGLSAAMGQGIAKAGNVFPVLSPILGWIGVFMTGSVVNNNSLFAPIQASVAQQIGTSGSLLVSANTVGG VAAKLISPQSIAIATAAVKQVGKESELLKMTLKYSVCLLIFICIWTFILSLL |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 2e-74 | 42 |
