Gene Information

Name : USA300HOU_1441 (USA300HOU_1441)
Accession : YP_001575329.1
Strain : Staphylococcus aureus TCH1516
Genome accession: NC_010079
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : bacteriophage tail protein
Function : -
COG functional category : R : General function prediction only
COG ID : COG3953
EC number : -
Position : 1571316 - 1577516 bp
Length : 6201 bp
Strand : -
Note : -

DNA sequence :
ATGAATGAAAAAGTAGAAGGCATGACCTTGGAGCTGAAATTAGACCATTTAGGTGTCCAAGAATGCATGAAAGGTTTAAA
GCGACAATTAGGTGTTGTTAATAGTGAAATGAAAGCTAATCTGTCAGCATTTGATAAGTCTGAAAAATCAATGGAAAAAT
ATCAGGCGAGAATTAAGGGGTTAAATGATAGGCTTAAAGTTCAAAAAAAGATGTATTCTCAAGTAGAAGATGAGCTTAAA
CAAGTTAACGCTAATTACCAAAAAGCTAAATCCAGTGTAAAAGATGTTGAGAAAGCATATTTAAAGTTAGTAGAAGCCAA
TAAAAAAGAAAAATTAGCTCTTGATAAATCTAAAGAAGCCTTAAAATCATCGAATACAGAACTTAAAAAAGCTGAAAATC
AATATAAACGTACAAATCAACGTAAACAAGATGCGTATCAAAAACTTAAACAGTTGAGAGATGCAGAACAAAAGCTTAAG
AATAGTAACCAAGCTACTACTGCACAACTAAAAAGAGCAAGTGACGCAGTACAGAAGCAGTCCGCTAAGCATAAAGCACT
TGTTGAACAATATAAACAAGAAGGCAATCAAGTTCAAAAACTAAAAGTGCAAAATGACAATCTTTCAAAATCAAATGATA
AAATTGAAAGTTCTTACGCTAAAACTAATACTAAATTAAAGCAAACAGAAAAAGAATTTAATGATTTAAACAATACTATT
AAGAATCATAGCGCTAATGTCGCAAAAGCTGAAACAGCTGTTAATAAAGAAAAAGCTGCTTTAAATAATTTGGAGCGTTC
AATAGATAAAGCTTCATCCGAAATGAAGACTTTTAACAAAGAACAAATGATAGCTCAAAGTCATTTCGGTAAACTTGCAA
GTCAAGCGGATGTCATGTCAAAGAAATTTAGTTCTATTGGAGACAAAATGACTTCCCTGGGACGTACAATGACGATGGGC
GTATCTACACCAATTACTTTAGGGTTAGGTGCAGCATTAAAAACAAGTGCAGACTTTGAAGGCCAAATGTCTCGAGTTGG
AGCGATTGCGCAAGCAAGCAGTAAAGACTTGAAAAGCATGTCTAATCAAGCAGTTGACTTAGGAGCTAAAACCAGTAAAA
GTGCTAACGAAGTTGCTAAAGGTATGGAAGAATTGGCAGCTTTAGGCTTTAATGCCAAACAAACAATGGAGGCTATGCCA
GGTGTTATCAGTGCAGCAGAAGCAAGTGGTGCAGAAATGGCTACAACTGCAACTGTAATGGCTTCAGCGATTAACTCTTT
CGGTTTAAAAGCATCTGATGCAAATCATGTTGCTGATTTACTTGCGAGATCAGCAAATGATAGTGCTGCAGATATTCAGT
ACATGGGAGATGCATTGAAGTATGCTGGTACTCCTGCAAAAGCATTAGGAGTTTCAATAGAGGACACTTCCGCAGCAATT
GAAGTTTTATCTAACTCAGGTTTAGAGGGTTCTCAAGCAGGTACTGCCCTAAGAGCTTCATTTATCAGGCTAGCTAATCC
AAGTAAAAATACAGCTAAGGAAATGAAAAAATTAGGTATTCATTTGTCTGATGCTAAAGGTCAATTTGTTGGCATGGGTG
AATTGATTAGACAGTTCCAAGATAATATGAAAGGCATGACGAGAGAACAAAAACTAGCTACAGTGGCTACAATAGTTGGT
ACTGAAGCAGCAAGTGGATTTTTAGCCTTGATTGAAGCGGGACCAGATAAAATTAATAGCTATAGTAAATCCTTAAAGAA
TTCCAATGGCGAAAGTAAAAAAGCAGCAGATTTGATGAAAGATAATCTCAAAGGCGCTCTGGAACAATTAGGTGGCGCTT
TTGAATCATTAGCAATCGAAGTCGGTAAAGATTTAACGCCTATGATTAGAGCAGGAGCGGAAGGTTTAACAAAATTAGTT
GATGGATTTACACATCTCCCTGGTTGGGTTAGAAAAGCTTCAGTAGGATTAGCACTTTTTGGTGCAGCAATTGGACCTGC
AGTTCTTGCTGGAGGGTTATTAATACGTACAGTTGGAAGTGCTGCTAAAGGATATGCGTCATTAAATAGACGTATTGCTG
AAAATACAATCCTTTCAAATACTAATTCAAAAGCAATGAAATCTTTAGGTCTTCAAACATTATTTCTTGGTTCTACAACA
GGAAAAACGTCAAAAGGCTTTAAAGGGTTAGCCGGAGCTATGATGTTTAATTTAAAACCTATAAATGTTTTGAAAAATTC
TGCAAAGCTAGCAATTTTACCGTTCAAACTTTTGAAAAACGGTTTAGGATTAGCTGCAAAATCTTTATTTGCAGTAAGTG
GAGGCGCAAGATTTGCGGGTGTAGCCTTAAGGTTTTTAACAGGACCTATAGGTGCTACAATAACTGCTATTACAATTGCG
TATAAAGTTTTTAAAACCGCATATGATCGTGTGGAATGGTTCAGAAACGGTATTAACGGTTTAGGAGAAACTATAAAGTT
TTTTGGTGGTAAAATTATTGGCGGCGCTGTTAGAAAGCTAGGAGAGTTTAAAAACTATCTTGGAAGTATCGGCAAAAGCT
TCAAAGAAAAGTTTTCAAAAGATATGAAAGATGGTTATAAATCATTAAGCGACGATGACCTTCTCAAAGTAGGAGTCAAC
AAGTTTAAAGGATTTATGCAAACCATGGGCACAGCTTCTAAAAAAGCGTCTGATACTGTAAAAGTGTTAGGGAAAGGTGT
TTCAAAAGAAACAGAAAAAGCTTTAGAAAAATATGTGCATTATTCTGAAGAAAATAGCAGAATCATGGAAAAAGTACGTT
TAAACTCGGGTCAGATATCAGAAGACAAAGCAAAAAAACTTTTGAAAATTGAAACGGATTTATCTAATAACCTTATAGCT
GAAATAGAAAAAAGAAATAAAAAGGAACTCGAAAAAACTCAAGAACTTATTGATAAGTATAGTGCATTCGATGAACAAGA
AAAGCAAAACATTTTAACTCGAACTAAAGAAAAAAATGACTTGCGAATTAAAAAAGAGCAAGAACTCAATCAGAAAATCA
AAGAATTGAAAGAAAAAGCTTTGAGTGATGGTCAGATTTCAGAAAATGAAAGAAAAGAAATTGAAAAGCTTGAAAATCAA
AGACGTGATATCACTGTTAAAGAATTGAGTAAGACTGAAAAAGAGCAAGAGCGTATTTTAGTAAGAATGCAAAGAAACAG
AAATGCTTATTCAATAGACGAAGCGAGCAAAGCAATTAAAGAAGCAGAAAAAGCAAGAAAAGCAAGAAAAAAAGAAGTGG
ACAAGCAATATGAAGATGATGTCATTGCTATAAAAAATAACGTCAACCTTTCTAAGTCTGAAAAAGATAAATTGTTAGCT
ATTGCTGATCAAAGACATAAAGATGAAGTAAGAAAAGCAAAATCTAAAAAAGATGCTGTAGTAGATGTTGTTAAAAAGCA
AAATAAAGATATTGATAAAGAAATGGATTTATCCAGTGGACGTGTATATAAAAATACTGAAAAGTGGTGGAATGGCCTTA
AAAGTTGGTGGTCTAACTTTAGAGAAGACCAAAAGAAAAAAAGCGATAAATACGCTAAAGAACAAGAAGAAACAGCTCGT
AGAAACAGAGAAAATATAAAGAAATGGTTTGGAAATGCTTGGGACGGCGTAAAAAGTAAAACTGGCGAAGCCTTTAGTAA
AATGGGCAGAAATGCTAATCATTTTGGCGGCGAAATGAAAAAAATGTGGAGCGGAATCAAAGGGATTCCAAGCAAATTAA
GTTCAGGTTGGAGCTCAGCCAAAAGTTCTGTAGGATACCACACTAAGGCTATAGCTAATAGTACTGGTAAATGGTTTGGA
AAAGCTTGGCAATCTGTTAAATCGACAACAGGAAGTATTTACAATCAAACTAAGCAAAAGTATTCAGATGCTTCAGATAA
AGCTTGGGCGCATTCAAAATCTATTTGGAGAGGCACATCAAAATGGTTTAGCAATGCATATAAAAGTGCAAAGGGCTGGC
TAACGGATATGGCTAATAAATCTCGCGCGAAATGGGATAATATTTCTAGTACAGCTTGGTCGAATGCAAAATCCGTTTGG
AAAGGAACATCGAAATGGTTTAGTAACTCATACAAATCTTTAAAAGATTGGACTGGGGATATGTATTCAAGAGCCCACGA
TCGTTTTGATGCAATTTCAAGTTCGGCATGGTCTAACGCTAAATCAGTATTTAATGGTTTTAGAAAATGGCTATCCAAAA
CATATGATTGGATTAGAGATATTGGTAAAGACATGGGAAGAGCTGCGGCTGATTTAGGTAAAAATGTTGCTAATAAAGCT
ATTGGCGGTTTGAATAGCATGATTGGCGGTATTAATAAAATATCTAAAGCCATTACTGATAAAAATCTCATCAAGCCAAT
ACCTACATTGTCTACTGGTACTTTAGCAGGAAAGGGTGTAGCTACCGATAATTCGGGAGCATTAACGCAACCGACATTTG
CTGTATTAAATGATAGAGGTTCTGGAAACGCCCCAGGTGGTGGAGTTCAAGAAGTAATTCACAGGGCTGACGGAACATTC
CATGCACCCCAAGGACGAGATGTGGTTGTTCCACTAGGAGTTGGGGATAGCGTAATAAATGCTAATGACACTCTGAAGTT
ACAGCGTATGGGTGTTTTACCAAAGTTTCATGGAGGTACGAAAAAGAAAGATTGGCTAGACCAACTTAAAGGTAATATAG
GTAAAAAAGCAGGAGAATTTGGAGCTACAGCTAAAAACACAGCGCATAATATCAAAAAAGGTGCAGAAGAAATGGTTGAA
GCAGCAGGCGATAAAATCAAAGATGGTGCATCTTGGTTAGGCGATAAAATCGGCGATGTGTGGGATTACGTACAACATCC
AGGGAAACTAGTAAATAAAGTAATGTCAGGTTTAAATATTAATTTTGGAGGCGGAGCTAACGCTACAGTAAAAATAGCTA
AAGGCGCATACTCATTGCTCAAAAAGAAATTAGTAGACAAAGTAAAATCGTGGTTTGAAGATTTCGGTGGTGGAGGCGAT
GGAAGCTATCTATTTGAATATCCAATCTGGCAAAGATTTGGACGCTACACAGGTGGACTTAACTTTAATGGCGGTCGTCA
CTATGGTATAGACTTTGGTATGCCTTCTGGAACAAACGTTTATGCCGTTAAAGGTGGTATAGCAGATAAGGTATGGACTG
ATTACGGTGGCGGTAATTCTATACAAATTAAGACTGGTGCTAATGAATGGAACTGGTATATGCATTTATCTAAGCAATTA
GCAAGACAAGGCCAACGTATTAAAGCTGGTCAACTGATAGGGAAATCAGGTGCTACAGGTAATTTCGTTAGAGGAGCACA
CTTACATTTCCAATTGATGCAAGGGTCACATCCAGGGAATGATACAGCTAAAGATCCAGAAAAATGGTTGAAGTCACTTA
AAGGTAGTGGCGTTCGAAGTGGTTCAGGTGTTAATAAGGCTGCATCTGCTTGGGCAGGCGATATACGTCGTGCAGCAAAA
CGAATGGGTGTTAATGTTACTTCGGGTGATGTAGGAAATATTATTAGCTTGATTCAACACGAATCAGGAGGAAATGCAGG
TATAACTCAATCTAGTGCGCTTAGAGACATCAACGTTTTACAGGGCAATCCAGCAAAAGGATTGCTTCAATATATCCCAC
AAACATTTAGACATTATGCTGTTAGAGGTCACAACAATATATATAGTGGTTACGATCAGTTATTAGCGTTCTTTAACAAC
AGATATTGGCGCTCACAGTTTAACCCAAGAGGTGGTTGGTCTCCAAGTGGTCCAAGAAGATATGCGAATGGTGGTTTGAT
TACAAAGCATCAACTTGCTGAAGTGGGTGAAGGAGATAAACAGGAGATGGTTATCCCTTTAACTAGACGTAAACGAGCAA
TTCAATTAACTGAACAGGTTATGCGCATCATCGGTATGGATGGCAAGCCAAATAACATCACTGTAAATAATGATACTTCA
ACAGTTGAAAAATTGTTGAAACAAATTGTTATGTTAAGTGATAAAGGAAATAAATTAACAGATGCATTGATTCAAACTGT
TTCTTCTCAGGATAATAACTTAGGTTCTAATGATGCAATTAGAGGTTTAGAAAAAATATTGTCAAAACAAAGTGGGCATA
GAGCAAATGCAAATAATTATATGGGAGGTTTGACTAATTAA

Protein sequence :
MNEKVEGMTLELKLDHLGVQECMKGLKRQLGVVNSEMKANLSAFDKSEKSMEKYQARIKGLNDRLKVQKKMYSQVEDELK
QVNANYQKAKSSVKDVEKAYLKLVEANKKEKLALDKSKEALKSSNTELKKAENQYKRTNQRKQDAYQKLKQLRDAEQKLK
NSNQATTAQLKRASDAVQKQSAKHKALVEQYKQEGNQVQKLKVQNDNLSKSNDKIESSYAKTNTKLKQTEKEFNDLNNTI
KNHSANVAKAETAVNKEKAALNNLERSIDKASSEMKTFNKEQMIAQSHFGKLASQADVMSKKFSSIGDKMTSLGRTMTMG
VSTPITLGLGAALKTSADFEGQMSRVGAIAQASSKDLKSMSNQAVDLGAKTSKSANEVAKGMEELAALGFNAKQTMEAMP
GVISAAEASGAEMATTATVMASAINSFGLKASDANHVADLLARSANDSAADIQYMGDALKYAGTPAKALGVSIEDTSAAI
EVLSNSGLEGSQAGTALRASFIRLANPSKNTAKEMKKLGIHLSDAKGQFVGMGELIRQFQDNMKGMTREQKLATVATIVG
TEAASGFLALIEAGPDKINSYSKSLKNSNGESKKAADLMKDNLKGALEQLGGAFESLAIEVGKDLTPMIRAGAEGLTKLV
DGFTHLPGWVRKASVGLALFGAAIGPAVLAGGLLIRTVGSAAKGYASLNRRIAENTILSNTNSKAMKSLGLQTLFLGSTT
GKTSKGFKGLAGAMMFNLKPINVLKNSAKLAILPFKLLKNGLGLAAKSLFAVSGGARFAGVALRFLTGPIGATITAITIA
YKVFKTAYDRVEWFRNGINGLGETIKFFGGKIIGGAVRKLGEFKNYLGSIGKSFKEKFSKDMKDGYKSLSDDDLLKVGVN
KFKGFMQTMGTASKKASDTVKVLGKGVSKETEKALEKYVHYSEENSRIMEKVRLNSGQISEDKAKKLLKIETDLSNNLIA
EIEKRNKKELEKTQELIDKYSAFDEQEKQNILTRTKEKNDLRIKKEQELNQKIKELKEKALSDGQISENERKEIEKLENQ
RRDITVKELSKTEKEQERILVRMQRNRNAYSIDEASKAIKEAEKARKARKKEVDKQYEDDVIAIKNNVNLSKSEKDKLLA
IADQRHKDEVRKAKSKKDAVVDVVKKQNKDIDKEMDLSSGRVYKNTEKWWNGLKSWWSNFREDQKKKSDKYAKEQEETAR
RNRENIKKWFGNAWDGVKSKTGEAFSKMGRNANHFGGEMKKMWSGIKGIPSKLSSGWSSAKSSVGYHTKAIANSTGKWFG
KAWQSVKSTTGSIYNQTKQKYSDASDKAWAHSKSIWRGTSKWFSNAYKSAKGWLTDMANKSRAKWDNISSTAWSNAKSVW
KGTSKWFSNSYKSLKDWTGDMYSRAHDRFDAISSSAWSNAKSVFNGFRKWLSKTYDWIRDIGKDMGRAAADLGKNVANKA
IGGLNSMIGGINKISKAITDKNLIKPIPTLSTGTLAGKGVATDNSGALTQPTFAVLNDRGSGNAPGGGVQEVIHRADGTF
HAPQGRDVVVPLGVGDSVINANDTLKLQRMGVLPKFHGGTKKKDWLDQLKGNIGKKAGEFGATAKNTAHNIKKGAEEMVE
AAGDKIKDGASWLGDKIGDVWDYVQHPGKLVNKVMSGLNINFGGGANATVKIAKGAYSLLKKKLVDKVKSWFEDFGGGGD
GSYLFEYPIWQRFGRYTGGLNFNGGRHYGIDFGMPSGTNVYAVKGGIADKVWTDYGGGNSIQIKTGANEWNWYMHLSKQL
ARQGQRIKAGQLIGKSGATGNFVRGAHLHFQLMQGSHPGNDTAKDPEKWLKSLKGSGVRSGSGVNKAASAWAGDIRRAAK
RMGVNVTSGDVGNIISLIQHESGGNAGITQSSALRDINVLQGNPAKGLLQYIPQTFRHYAVRGHNNIYSGYDQLLAFFNN
RYWRSQFNPRGGWSPSGPRRYANGGLITKHQLAEVGEGDKQEMVIPLTRRKRAIQLTEQVMRIIGMDGKPNNITVNNDTS
TVEKLLKQIVMLSDKGNKLTDALIQTVSSQDNNLGSNDAIRGLEKILSKQSGHRANANNYMGGLTN

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SAUSA300_1393 YP_494090.1 phiSLT ORF2067-like protein, phage tail tape measure protein Not tested ¥ÕSa2 Protein 0.0 100
MW1390 NP_646207.1 hypothetical protein Not tested ¥ÕSa2 Protein 0.0 99