|
Name : Cphy_2350 (Cphy_2350) Accession : YP_001559450.1 Strain : Clostridium phytofermentans ISDg Genome accession: NC_010001 Putative virulence/resistance : Unknown Product : alpha amylase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : - Position : 2901320 - 2903071 bp Length : 1752 bp Strand : - Note : PFAM: glycoside hydrolase family 13 domain protein Ig domain protein region domain protein; alpha amylase catalytic region; SMART: alpha amylase catalytic sub domain; KEGG: gtn:GTNG_0610 neopullulanase DNA sequence : ATGAAATTTGAAGCTATTTACCACAGAACCTCTGATAATTATTGTTATCCGTTAAATGAAGAGGATCTTATTATCAATAT CAAAACGGGCCACGATATAGAGAGGGTTTTTATCTATTATGGGGATCCTTTCGAAGGTGGAATTTTAGGCGGTAATTGGA CTTGGAATGGTGTGGAAGAAGAGTTGATTTATAAAAAGAACCTAACACATCATATTTGGTGGACAACAACAGTAAAGCCA AAGTTTAAAAGGTGTAAATATTATTTTAAATTAGTTGCTAATGATACTTCTTACTATTATTTTGAAGATGGATTCTATAC AGAAGCAGAAATGAATCATCAAGACAAAAATTTAGTATATTTCACATTCCCATGGATGAATAGTATTGATATTAACAAAA CTCCTGACTGGGTAAATGATACCGTATGGTATCAGATTTTTCCGGAACGTTTTAATAACGGAGATAAAGAAAATGACCCG AAGAATGTAAAAGCTTGGGGATTTCATACAGTGAGCAATGATGAGTTTTATGGCGGAGATTTACAGGGTATTATAAATCG ATTGGATTATTTGGCGGATATAGGCATAAGCGGAATATATCTGACACCTATCTTTGAAGCAAATACCAGTCATAAATACG ATACCAAAGACTATATGAAGATTGATCCACATTTTGGTGATGAGAAAGTATTTAAAAACTTAGTTGATACAGCTCATGAA AAGGGCATTCGTATTATGCTTGATGGTGTATTTAATCATTGCGGTAATCAGTTTGCTCCATGGCTAGATGTTTTGAAGAA TGGACCTGACTCAAAGTATTTTAACTGGTTTATGATTAACAAATGGCCTTTTAACAAAGAAGATCATAATACAAATGATG GGTCATTTTATTCCTTTGCTTTTACTTCCAGAATGCCGAAGTTAAATACCAATAACCCTGAGGTTATTAAGTATTTGCTT GATGTTGTAGAATACTGGGTGAAAAACTTTGATATCGATGGTATTAGGCTTGACGTAGCGAATGAAATATCTCACAGATT CTGTAAGGATTTAAGAAAGTTGACCAAAGAGTTAAAACCCGATTTTTATATATTAGGTGAGTTATGGCATGATGCTATTA CTTGGTTACATGGAGATGAATTTGATGGAGTTATGAATTACCCATTAGCCACTTCTTTAGCAGATTATTGGGTTTATCCG GAGAAAACTAACTATGACTTTGAATGTGCCATTAATCATAACTTTACCATGTATATGCAGCAGACAAACGATGTCTTATT CAATTTATTGGATTCCCATGATACCAATAGATTGATAGATAAAGTAAAAGATATTGATATTTTTTACCAGCAGTTAGCAG TTCTATTTACCATGCCGGGTAGTCCATGTATTTATTATGGAACTGAAATAGCAATGGAAGGAAGCTATGATCCGGACTGT CGTAGATGTATGCCTTGGGAAGACATCGATGCAGGTTTGTTTAAAGATAGAATTGAAATCATAAAAGCACTGATTCATTT AAGAAAAACAAACAATGCTTTCAAAAGCAGACATTATCATTTTATTGAGGATAAGAATAATAACAGAGTAATTCACTATA TAAAAACAGACGAAGATCATAAACAGGTTGAAGTTATTTTAAATTGCTCTAAGGATAGTATCGTAGTTCAAAGGAAAGGT AATGAATTATTTAGCCTATTAAATGAAGATACTATTCTAAAACCAAAAGGTGTTTTTATTCAGCAGATATAA Protein sequence : MKFEAIYHRTSDNYCYPLNEEDLIINIKTGHDIERVFIYYGDPFEGGILGGNWTWNGVEEELIYKKNLTHHIWWTTTVKP KFKRCKYYFKLVANDTSYYYFEDGFYTEAEMNHQDKNLVYFTFPWMNSIDINKTPDWVNDTVWYQIFPERFNNGDKENDP KNVKAWGFHTVSNDEFYGGDLQGIINRLDYLADIGISGIYLTPIFEANTSHKYDTKDYMKIDPHFGDEKVFKNLVDTAHE KGIRIMLDGVFNHCGNQFAPWLDVLKNGPDSKYFNWFMINKWPFNKEDHNTNDGSFYSFAFTSRMPKLNTNNPEVIKYLL DVVEYWVKNFDIDGIRLDVANEISHRFCKDLRKLTKELKPDFYILGELWHDAITWLHGDEFDGVMNYPLATSLADYWVYP EKTNYDFECAINHNFTMYMQQTNDVLFNLLDSHDTNRLIDKVKDIDIFYQQLAVLFTMPGSPCIYYGTEIAMEGSYDPDC RRCMPWEDIDAGLFKDRIEIIKALIHLRKTNNAFKSRHYHFIEDKNNNRVIHYIKTDEDHKQVEVILNCSKDSIVVQRKG NELFSLLNEDTILKPKGVFIQQI |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SPN23F_09660 | YP_002510949.1 | alpha-amylase | Not tested | PPI-1 | Protein | 6e-102 | 46 |
