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Name : Cphy_2342 (Cphy_2342) Accession : YP_001559442.1 Strain : Clostridium phytofermentans ISDg Genome accession: NC_010001 Putative virulence/resistance : Unknown Product : alpha amylase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : - Position : 2887378 - 2888994 bp Length : 1617 bp Strand : - Note : PFAM: alpha amylase catalytic region; SMART: alpha amylase catalytic sub domain; KEGG: cbe:Cbei_0735 alpha amylase, catalytic region DNA sequence : GTGGTAAAAAAATGGTGGCACAGTTCAGTTGTGTATCAGATATATCCAAGAAGTTTTAATGACAGCAATGGAGATGGAAT AGGTGATCTAAAAGGTATTATTGAAAAATTAGATTATCTTAAAAATTTGGGGATTGATGTAATTTGGTTAAGTCCTGTTT TTAAGTCACCAAATGATGATAACGGCTATGATATCAGCGATTATGAAGATATTATGGACGAATTTGGTACTTTGGAAGAT ATGGAACTTCTTTTAAAGGAAGCGAACAATAGAGGTATTAAAATTCTTATGGACTTAGTTGCCAACCATACTTCTGATGA GCATAAATGGTTTATTGAGTCTAGGAAATCAAAAGATAATGCTTATAGGGACTATTATATATGGAGAGATCCAGTAGATG GTCATGAACCGAATGATTTAGGTTCTACTTTCTCCGGAAGTGCTTGGGAATGGGATGAAGCGACAGGGCAATATTATTTG CATTTATTTAGCAAGAAGCAGCCAGATTTGAACTGGGAAAATCCTATCGTCAGAGAAGAAGTCTGGAAGTCTATGAATTT TTGGATTGATAAGGGTATCGGTGGTTTTAGAATGGATGTTATTGAGCTTCTTGGTAAGATTCCAGATGAAAAAATTATTA GTAACGGACCTATGCTCCATGAATATATTCGAGAGATGAACAGGAATAGCTTTGGGGATAAGGATTTATTAACGGTAGGT GAATGCTGGGGTGCAACTCCTGAAATAGCTAAAATGTATTCTAATCCTGACGGTAGTGAATTAAGTATGGTATTTCAGTT TGAGCATATTGGGCTGGATCAGATACCGGGAAAAGATAAATGGGATTTACAACCTCTGAACTTAATTGACCTTAAGAATG TATTTCATAAATGGCAAACCTGTTTTCATGACGATGGATGGAATAGTTTGTTCTGGAATAACCATGACACACCAAGAATT GTATCCAGATGGGGAAATGATAAGGTATACAAGATTGAAAGTGCTAAGATGTTAGCAACACTTCTGCATGGGCTTAAGGG TACCCCTTATATATATCAGGGTGAGGAATTAGGAATGGCCAATATTAAGTTTAAAGATATCAATCAATATAAAGATATAG AAACTCTTAATATGTATAAAGACCGCTTAAATAAAGGTTATAAGCACGAAGATATTATGGAATCCATATATGCTAAGGGC AGAGATAATGCCAGAACCCCTATGCAGTGGAGTGATGAGATAGATGGCGGATTTACAACCGGTACACCTTGGATCGAGGT AAATCCAAACTTTACAGAGATAAATGCAAAAGAACAGGTAAGTAATCCAAACTCCATTTATAATTATTATAAAAAATTGA TAGAGATAAGAAAGAACAATGAAGTAATTGTATATGGTGATTTTGAAATGTTACTTCCGGAAGACAAAAATATATTTGCA TATGTTAGAACCTTAAAAGATTCCAAAATAGTAGTAGTATGCAACTTCTATGAAAATGAAGTGGAATATAACATACCAAA GGAATACGAAGAAAAGAAAGAAGTTCTTATTTCTAATTATGGTTTAAGTTTAACGGGCAGATTAAGACCTTTTGAAGCGA TTATGTATAGGGTATAG Protein sequence : MVKKWWHSSVVYQIYPRSFNDSNGDGIGDLKGIIEKLDYLKNLGIDVIWLSPVFKSPNDDNGYDISDYEDIMDEFGTLED MELLLKEANNRGIKILMDLVANHTSDEHKWFIESRKSKDNAYRDYYIWRDPVDGHEPNDLGSTFSGSAWEWDEATGQYYL HLFSKKQPDLNWENPIVREEVWKSMNFWIDKGIGGFRMDVIELLGKIPDEKIISNGPMLHEYIREMNRNSFGDKDLLTVG ECWGATPEIAKMYSNPDGSELSMVFQFEHIGLDQIPGKDKWDLQPLNLIDLKNVFHKWQTCFHDDGWNSLFWNNHDTPRI VSRWGNDKVYKIESAKMLATLLHGLKGTPYIYQGEELGMANIKFKDINQYKDIETLNMYKDRLNKGYKHEDIMESIYAKG RDNARTPMQWSDEIDGGFTTGTPWIEVNPNFTEINAKEQVSNPNSIYNYYKKLIEIRKNNEVIVYGDFEMLLPEDKNIFA YVRTLKDSKIVVVCNFYENEVEYNIPKEYEEKKEVLISNYGLSLTGRLRPFEAIMYRV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 7e-138 | 54 |
