Gene Information

Name : Cmaq_1771 (Cmaq_1771)
Accession : YP_001541584.1
Strain : Caldivirga maquilingensis IC-167
Genome accession: NC_009954
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : threonine synthase
Function : -
COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism
COG ID : COG0498
EC number : -
Position : 1845244 - 1846419 bp
Length : 1176 bp
Strand : +
Note : TIGRFAM: threonine synthase; PFAM: Pyridoxal-5'-phosphate-dependent protein beta subunit; KEGG: sso:SSO0878 Threonine synthase

DNA sequence :
ATGCTTATAAATAAGTTAAGTAAATCCCTTAGAGCAGGTGGGGGTTGTGGAGGAAACAGAATAGGGTTAGGTAAGTATGT
TTTCAAATGCCCTAAGTGTGGGTATGAGACCCAACCTGAGGCAGGTAAATTCACATGCCCAAGATGCGGCTCATTAATGG
AGGCTATTCTAGCCGAGTTGCCTAAGGATATTAAACTCAGGTACAGGAGAAGACTGGGTGTCTGGTCGTATTCACAGTTA
CTGCCTGAACCTAAGAATAGGGTTACGCTTAATGAAGGTGGGACACCATTAATAAGGATTAGTAAGGGATTATTCGGTAA
GTTTGAGGGTCTTAACCCAACTGGCTCATTCAAGGATAGGGGTATGGCTATTGGGGTTAGTTTAGCTAAGGCAATAGGGG
TTAGTAATATTGTGGTTGCATCCACCGGTAATACTGCAGCCTCAGCGTCAGCCTATGGTGCTAGGGCTGGGTTAAGGGCC
ATAGTTCTCCTACCCAGTGGTAAGGTGGCTAGAGGTAAGTTAGCTCAGTCAATTATCCACGGTGCAAGCATAATGAGTAT
TGATGGTTACTTTGATGATGCGTTAACTGAGGCAATGAACATGTTTAAGGCTGGTAAGGCATACTCCTTAAACTCAATAA
ACGCCTGGAGACTTGAGGGGCAGAAGAGCATTGCCTACGAGATATATGAGGACATTAAAGTACCGGATAACGTAATAGTA
CCCGTTGGTAATGCAGGCAACATATACGCCATATGGAAGGGGTTCTGGGAATTAATGCAGATTGGGTTAATAGATAAGGT
ACCTAGGATGATTGGTGTTCAAGCTGAGGGTGCATCACCACTTTATGAAACCTGGAGGAGGGGATCCAGTGAGTTAATTG
AGGTTAAGGAACCTAAGACTGTGGCATCTGCAATAAGGATTGGTAAACCAGTGAATTGGCTTAAGGCCCTTAAGGCGGTT
AATAATTCAGGTGGATTACTAGTGACGGTTAATGATAATGAGATAATGATTGCTAGAGGTAGGTTAGCTAGGAGAGGTAT
CTTTGTTGAACCAGCCAGTGCATCAACGTATGCTGCATACATTAAATTAATTAGGAACAGTGTAATAAGTAATGATGAAC
GCACCGTACTTGTATTAACTGGGCATGGTTTAAAGGACCCTGATTCAGTTAAATGA

Protein sequence :
MLINKLSKSLRAGGGCGGNRIGLGKYVFKCPKCGYETQPEAGKFTCPRCGSLMEAILAELPKDIKLRYRRRLGVWSYSQL
LPEPKNRVTLNEGGTPLIRISKGLFGKFEGLNPTGSFKDRGMAIGVSLAKAIGVSNIVVASTGNTAASASAYGARAGLRA
IVLLPSGKVARGKLAQSIIHGASIMSIDGYFDDALTEAMNMFKAGKAYSLNSINAWRLEGQKSIAYEIYEDIKVPDNVIV
PVGNAGNIYAIWKGFWELMQIGLIDKVPRMIGVQAEGASPLYETWRRGSSELIEVKEPKTVASAIRIGKPVNWLKALKAV
NNSGGLLVTVNDNEIMIARGRLARRGIFVEPASASTYAAYIKLIRNSVISNDERTVLVLTGHGLKDPDSVK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00304 YP_008207769.1 Threonine synthase Not tested AbaR25 Protein 7e-36 42
BJAB0868_00308 YP_008211634.1 Threonine synthase Not tested AbaR26 Protein 7e-36 42