Gene Information

Name : Clos_2600 (Clos_2600)
Accession : YP_001514127.1
Strain : Alkaliphilus oremlandii OhILAs
Genome accession: NC_009922
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : sodium:neurotransmitter symporter
Function : -
COG functional category : R : General function prediction only
COG ID : COG0733
EC number : -
Position : 2802038 - 2803405 bp
Length : 1368 bp
Strand : +
Note : PFAM: sodium:neurotransmitter symporter; KEGG: amt:Amet_0315 sodium:neurotransmitter symporter

DNA sequence :
ATGACAGATTTAAATCAAAAGAAAGAAAGAGATCAGTGGGGTTCCAAGCTCGGATTTATCTTCGCTGCTGCAGGATCTGC
GGTTGGTCTAGGTAACCTTTGGAAGTTCCCTTATTTAGCTGGTCAAAACGGCGGTGGGGTATTCGTTGTTATTTATCTTG
GACTTGTATTATTAATCGGTTTTACTTTAATGATGGCAGAGCTTGTTCTTGGTAGAAACACACAGTTAAGTCCAGTCGGT
GCTTTTAGAAAAATTAAGCAAAAATGGGCTTGGGTTGGTGGTATCGGTGTATTAGCATCTTTCTTAATCGTAACCTATTA
CAGTGTTATCGGTGGATGGATTATCAAGTACATCGTTTCAGCACTTACAGGTGCATTCAATACAACAGACCTTGGTACTC
TTGAAAGTGTATTTGTAAACTTTATCGGTGCTCCAGTAGAGCCCCTTATCTACCATGGTATCTTCATGTTAATTACATTA
GGTATCGTTATGGGTGGTATCAGTGGTGGTATCGAAAAAGCTTCTAAGATTCTAATGCCAGGTTTATTTATCATGATGGT
CGTATTAATGGTAAGATCTATCACACTTCCAGGAGCTATGGCTGGTGTTGAATACCTATTAAAACCAGACTTCTCAAAAT
TAAACATGGGCGTAGTTGTAAGTGCTTTAGGGCAAGTATTCTTCTCCCTAAGTCTTGGTATGGGTGTTATGGTTACTTAC
GGTAGCTACCTGCCTAAAGATGAGAACCTTGTAGAATCTTCACTGATTATTCCTGCATTGGATACAATCATCGCTTTACT
TGCAGGTTTAACAATTTTACCAGCAGTATTCGCTTTAGGATTTGATCCATCTGGTGGACCTGGACTTCTTTTCATCACAC
TACCAGGGGTATTTGCTAAGATGCCGTTCGGAAGCTTCTTCGCAGTATTATTCTTCGTGTTAGTTTTATTTGCTGCTGTT
ACTTCTTCTATTTCTCTATTAGAGGCTGCAGTATCTCTAACAGTTGACCAGTTTAAATGGGAGCGTAAAAAAGCAACAAT
TGGATTAGGTATTCTTGCATTCCTTATCGGTGTACCTTCTTCATTAGCAAATGGACCAGTTTTAGGAAATATGACTTTCA
TTGCTGGTACAAACTTCTTTGATTCAATGGGTATCATTACAGATAACCTTCTTTTACCTTTAGCTGCACTAACACTTTCA
ATCTTTGTTGGTTGGGTATGGGGTACAGATAAAGCTGTAGCAGAAGCTACAAATGGTGGAAAGGTTAAATTTGCTCTTGC
AAAGACTTGGTCTATCGCTATTAAATATGTAGCACCAATTGCGATTGGATACATTTTAATCTCTGGTCTTATCCCACTAT
TTAAATAG

Protein sequence :
MTDLNQKKERDQWGSKLGFIFAAAGSAVGLGNLWKFPYLAGQNGGGVFVVIYLGLVLLIGFTLMMAELVLGRNTQLSPVG
AFRKIKQKWAWVGGIGVLASFLIVTYYSVIGGWIIKYIVSALTGAFNTTDLGTLESVFVNFIGAPVEPLIYHGIFMLITL
GIVMGGISGGIEKASKILMPGLFIMMVVLMVRSITLPGAMAGVEYLLKPDFSKLNMGVVVSALGQVFFSLSLGMGVMVTY
GSYLPKDENLVESSLIIPALDTIIALLAGLTILPAVFALGFDPSGGPGLLFITLPGVFAKMPFGSFFAVLFFVLVLFAAV
TSSISLLEAAVSLTVDQFKWERKKATIGLGILAFLIGVPSSLANGPVLGNMTFIAGTNFFDSMGIITDNLLLPLAALTLS
IFVGWVWGTDKAVAEATNGGKVKFALAKTWSIAIKYVAPIAIGYILISGLIPLFK

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SAR0458 YP_039907.1 sodium:neurotransmitter symporter family protein Not tested vSa¥á Protein 2e-49 41
SAS0416 YP_042543.1 sodium:neurotransmitter symporter family protein Not tested vSa¥á Protein 2e-49 41