|
Name : Spea_1941 (Spea_1941) Accession : YP_001501798.1 Strain : Shewanella pealeana ATCC 700345 Genome accession: NC_009901 Putative virulence/resistance : Unknown Product : hypothetical protein Function : - COG functional category : R : General function prediction only COG ID : COG1033 EC number : - Position : 2355585 - 2357888 bp Length : 2304 bp Strand : + Note : PFAM: Patched family protein; KEGG: slo:Shew_1808 hypothetical protein DNA sequence : ATGTTAGATAAATTAGTTAATGGATTCGAATCTTATCTATTCCGTCATAGAGCTTTCGTTATATTACTGTTTGCGGTAAC GACTATCTTCCTTGGAATTCAAGCGAGTAACCTGAAAATGGATGCCGCATTTGTTAAAAACATTCCACTTAACCACAACT ACATGCAAACCTATCTGAAGCACCAGAAACAGTTTGGTGGTGCCAACAGCATCATGGTGGCAGTAGAAGATACGAGCGGG AACATTTTCAATCCAAATTTCTTTGATGCACTTAAAAATGTACATGATCAGCTATTTTTTATACCTGGTGTAGACAGAGC ACAAGTTAAATCACTGTTCTCGCCATCTACGCGCTTTACTGAAGTCGTTGAAGACGGCTTTGCTGGTGGTCCTGTCATTC CCGCGGATTTTTCTACCACAGAGCAAGGCTTAAAAACTGTTCGAGGTAATATCGAAAAAGCAGGTATTGTCGGCCGTTTG ATTGCTGAAGACTACTCGGCAGCCATGGTGAGTACGCAGTTAATGGATTTCGATCCGCAAACTGGCGAACCCTTAGATAC TTTGGCGTTTGCAGCACAGTTAGAAGAGCAGTTACGTGAACAGTATGAAACCGATGAAATAAAAATTCATATCATTGGTT TTGCTAAGATGGCCGGAGATGTTGCCGACGGTGCAAAAGGAGTGCTGCTGTTTTTCCTTATTGCTATCTTAGTGACTGCA GTGATGGTTTACTTTTTCTCTAAGTCGGTAGCGCTAACAATTTTGCCGTTAGTATGTAGTTTGATTGCAGTTGTTTGGCA ATTAGGGTTATTAACCGTCATCGGATTTGGTTTAGACCCTATGTCTATTCTTATTCCATTTTTGGTGTTTGCCATTGGTG TAAGTCACAGCGTACAGATGATTAATGCGGTAAGACGACGCGTTACCGATGGACAAACGACAAAGGCAGCCGCGGCACTG GCATTTAGAAGTCTGCTTATTCCAGGTGGTGTTGCGCTGTTGTCTGACACCATAGGTTTTATGACGCTATTAGCCATCGA CATTGGTATCATTCGAGAGCTCGCGATTTCAGCTTCTTTAGGTGTTGCTGTGATAATTTTAACAAACCTAATCTTATTGC CGCTGGTGATCTCTTTTACAACAGTGACGCCTCGTAAAGATAATAAGCCAAACCCTGTAAATAACATCTGGCTTAAGCTA TCTAATTTCGCTACGCCAAAATACGCGATTTGGGTCTTGATTGTGACAGGATTGCTCTATGCGGTTGGCTTACAGCAAGC GAATAAGATGAAAATTGGCGATCTACAAGGCGGAGCTCCCGCGCTGCATTTAGACTCTCGTTATAATCAAGACACTTTCT TTATTACTGATAAGTTCTCTATTACAACAGATGTGATGACAGTGATTGTTGAGGCATTCCCTGAAGCCTGTACGTATCAT TCTGTATTGACTCAAATTGATGAGTTTGAGTGGCAGGTTAGTAACACACCTGGAGTCGAGGCTACGGCGAGTTTGGCATC GGTGGCAAAGCGTGTAAATTCTGGCTTTAATGAAGGCAATCCAAAGTGGAGTGTTTTGCCACGCACCACAGCAAGCTTGG TTCAGGCGGTTGGTCGCGTACCGACAACTTCAGGGTTACTCAATAGCGATTGCTCTGTGATGCCGGTTTATCTGTTCCTA AAAGATCATAAAGCTGAAACCATTGAATTGGTTATCGATAAGGTTAATAAGTTACAAAAAGAGCTCGATAACGACAAAAT CCAGTTTAAGTTAGCATCGGGCCCTGTCGGCGTCATGGCGGCAACCAATGAAGCAGTTGCAGAAGCACAGCTACCTATGA TGCTTTATGTCTACGGCGCGGTGTTTATTCTATGTCTTATCAGTTTCCGGTCACTAAGAGCGACGATAGCAGTGATTTTG CCTCTGTATGTGGTGTCCACATTGGCGCAGGCGTTAATGACTCAGCTCGATATTGGACTGGCCGTGAGTACCTTACCCGT GATTGCGCTAGGTGTGGGTATTGGTGTTGATTACGGTATTTATATCTTATCGACCATGGCTGTACGTCTAAGAGATGGGA TGCCGGTACAAAAAGCTTATTATGAGGCACTAGTCGAACGTGGAAGTGCGGTGATTTTCACTGGACTGACATTAGCGATT GGTGTGAGTACTTGGTTCTTCTCGGCTCTTAAGTTCCAAATGGATATGGGGATTTTGCTTACATTCATGTTTTTGGTAAA TATGTTGGGGGCAATAATTATCCTACCAGCCATAGCTGCCATGTTTTGGCGGCAGCCCAAGTAG Protein sequence : MLDKLVNGFESYLFRHRAFVILLFAVTTIFLGIQASNLKMDAAFVKNIPLNHNYMQTYLKHQKQFGGANSIMVAVEDTSG NIFNPNFFDALKNVHDQLFFIPGVDRAQVKSLFSPSTRFTEVVEDGFAGGPVIPADFSTTEQGLKTVRGNIEKAGIVGRL IAEDYSAAMVSTQLMDFDPQTGEPLDTLAFAAQLEEQLREQYETDEIKIHIIGFAKMAGDVADGAKGVLLFFLIAILVTA VMVYFFSKSVALTILPLVCSLIAVVWQLGLLTVIGFGLDPMSILIPFLVFAIGVSHSVQMINAVRRRVTDGQTTKAAAAL AFRSLLIPGGVALLSDTIGFMTLLAIDIGIIRELAISASLGVAVIILTNLILLPLVISFTTVTPRKDNKPNPVNNIWLKL SNFATPKYAIWVLIVTGLLYAVGLQQANKMKIGDLQGGAPALHLDSRYNQDTFFITDKFSITTDVMTVIVEAFPEACTYH SVLTQIDEFEWQVSNTPGVEATASLASVAKRVNSGFNEGNPKWSVLPRTTASLVQAVGRVPTTSGLLNSDCSVMPVYLFL KDHKAETIELVIDKVNKLQKELDNDKIQFKLASGPVGVMAATNEAVAEAQLPMMLYVYGAVFILCLISFRSLRATIAVIL PLYVVSTLAQALMTQLDIGLAVSTLPVIALGVGIGVDYGIYILSTMAVRLRDGMPVQKAYYEALVERGSAVIFTGLTLAI GVSTWFFSALKFQMDMGILLTFMFLVNMLGAIIILPAIAAMFWRQPK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| unnamed | AAK01517.1 | transport protein | Not tested | PAGI-1 | Protein | 2e-129 | 41 |
