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Name : gabD (RMA_0633) Accession : YP_001499355.1 Strain : Rickettsia massiliae MTU5 Genome accession: NC_009900 Putative virulence/resistance : Unknown Product : succinate semialdehyde dehydrogenase Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1012 EC number : - Position : 623218 - 624696 bp Length : 1479 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGTTCGCTCGCAATGACGATTTTAGTATCCACGCAGGTAATGAGAAATATATGCACTTACTTAAAAACATTACGGGAAA GAATTATATAAACGGTGAATTTATAGAGTTTGGGCAACAAATATCCGTTATTAATCCTGCGACCTTAAAAGAAATTGCTA CAGTTCCGAATTTGGGATTATCTGAGATTAATTCAGCGATTAATAATACGGTGACTAGTTTTTCTTCATGGTCACAAAGC TCATTTGAAGCGAGAATAGCGATTCTTAGAAGATGGTATAATTTAGTAATCGAAAATATTGAGGAGTTAAGTCATATATT AACCCTAGAGCAGGGTAAAGTACTTGCTGAATCAAAAAAAGAAATTTTATATGGAGCCTCTTTTATTGATTGGTATACAT ATGCTATACATAATATTCATTCGACTATCAAACCCGGTAATAGTAAAACTCATAAAATTGTTACGCAATATGAGCCTGTA GGACCGTCTGCTGCTATAACTCCTTGGAATTTTCCAAATGCAATGATTACTCGCAAGGTAGTACCTGCAATAGCTGCGGG TTGTAGCGTTATATTAAAACCGTCAAGTCTTACGCCTCTATCAGCTTTAGTACTTGCGAAATTTGCAAGCGATGCCGGTT TGCCTGCCGGAGTATTTAATGTAATTACAGGTAGTTCAGATATTATAGGTAAGGCTTTGTGTGAAGATTTTAGGCTTCGG AAATTATCATTTACCGGCTCTACAAATGTCGGTAAAATTCTATATCAAAATGCCGCAAATACTCTAAAACGTTTATCTTT GGAACTTGGCGGCAATGCTCCTTTCATTATAACGGCAGATAATGATTTAGAGAAAGTAGTAAGTGATTTAGTAATCGCTA AAACTAGAAATAGTGGACAGTCTTGTACTTCACCTAACAGAATATTTATAGAAGAATCTATATATGAAAAATTTATAGAA ATTCTAAAGGCTAAATTTACTAAGTTTAAAGCCGGTGACGGATTTGATAAGGAATCGGATTTAGGTCCGTTAATTAATTC TGCTGCCATAGCAAAAATACAAAAGTTACTCGCTGATGCACAAAGTAAAGGAGCTAAATTAATTTGCGGCGGTAAAGCTG TTGATAATTTTATTGAGCCTACTATTATTATTGACTGTTTGGATAATATGGATATCTTTAGAACAGAAATATTCGGTCCG GTAGTTGCTGGTTATAAATTTAAAGATTTGGATGAAGTAATAGAACGTGCAAATAATACCGAATACGGCTTGCAAGGATA TGTATATTCAAATAATATATCTGTGGTACAAATGATAGCGTCTAAGCTTGATTTTGGTATGGTATCGATTAACGACCCGT TACCTGCAAATGCAAAAGCACCTTTTGCAGGACGTAAAGCTTCAGGTTTTGGAGTTGAAGGCTCATTTGAAGGGATATTT GAATATCTAAATACGAAATATATAAATTTACAGCATTAA Protein sequence : MFARNDDFSIHAGNEKYMHLLKNITGKNYINGEFIEFGQQISVINPATLKEIATVPNLGLSEINSAINNTVTSFSSWSQS SFEARIAILRRWYNLVIENIEELSHILTLEQGKVLAESKKEILYGASFIDWYTYAIHNIHSTIKPGNSKTHKIVTQYEPV GPSAAITPWNFPNAMITRKVVPAIAAGCSVILKPSSLTPLSALVLAKFASDAGLPAGVFNVITGSSDIIGKALCEDFRLR KLSFTGSTNVGKILYQNAANTLKRLSLELGGNAPFIITADNDLEKVVSDLVIAKTRNSGQSCTSPNRIFIEESIYEKFIE ILKAKFTKFKAGDGFDKESDLGPLINSAAIAKIQKLLADAQSKGAKLICGGKAVDNFIEPTIIIDCLDNMDIFRTEIFGP VVAGYKFKDLDEVIERANNTEYGLQGYVYSNNISVVQMIASKLDFGMVSINDPLPANAKAPFAGRKASGFGVEGSFEGIF EYLNTKYINLQH |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf17 | AAO17183.1 | Orf17 | Not tested | tcd island | Protein | 2e-92 | 47 |
