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Name : coxA (RMA_0570) Accession : YP_001499310.1 Strain : Rickettsia massiliae MTU5 Genome accession: NC_009900 Putative virulence/resistance : Unknown Product : cytochrome c oxidase polypeptide I Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG0843 EC number : - Position : 562834 - 564456 bp Length : 1623 bp Strand : - Note : - DNA sequence : ATTAAAACAGGCAGAATAATAATTATGGATATAACTACTACCGCAATTTATCACGCTGACCACCACACCCCACACGGTTG GAGGCGATGGCTTTTTTCTACCAATCACAAAGATATCGGCATTATGTATATCATATTTGCCGTTTTTGCTGGAATTGTCG GAGGTTTGTTCTCACTGCTTTTTAGGTTAGAGCTTGCAATGCCCGGCGGCACTTTCTTAAATCATGATTTCCAGCTATAT AACGTGCTTATCACAGCACATGCGGTTATTATGGTATTCTTTATGATTATGCCGGCTTTGTTCGGTGGCTTTGGTAACTA TTTCGTACCTCTGTTAATAGGGGCTCCCGATATGGCATTTCCACGCCTTAACAATATCAGTTTTTGGCTACTAGTTCCTG CTTTTCTTTTACTTATGGGATCAGCTTTTGTTGACGGTGGGCCGGGAACGGGCTGGACGCTCTACCCTCCTTTAAGTAAT TTAAGTGGTCACCCCGGTGCAGCCGTTGATATGGCTATTTTCAGTTTACATTTAACCGGTTTATCGTCAATCCTTGGATC AATTAACTTAATCGTTACTATCTTTAATATGAGAGCTCCGGGAATGGGGCTTTTCAAGATGCCGTTATTCGTTTGGTCTA TTTTAGTTACCGCATTTCTAATAATTCTTGCTATGCCGGTACTTGGTGGAGCTATTACTATGCTACTTACAGATCGTAAT TTTGGAACTACTTTCTTTAAGCCTGACGGCGGCGGTGATCCTGTATTATTTCAGCATCTATTTTGGTTTTTTGGTCATCC TGAAGTATATATCGTAATACTTCCAGGCTTTGGTATAGTAAGTCAAGTTATTTCAACTTTTTCACGCAAACCTATATTCG GCTATCAAGGTATGGTCGGGGCTATGGTGATAATAGGCTTTGTTGGATTTATCGTATGGGCTCACCATATGTTTACTGTT GGGCTTTCTTATAATGCACTTATATATTTCACTGCCGGAACGATGATTATAGCAGTTCCGACGGGTATTAAAATATTTAG CTGGATAGCGACTATGTGGGGTGGTTCGATTACATTCCCAACTCCTATGCTATTTTCGATAGGATTTATTATATTATTCA CGATCGGCGGCGTAACCGGCATAATCCTATCAAATTCGGCACTTGATAGAGTTCTGCACGATACATATTATGTTGTTGCA CATTTCCATTATACGATGTCGCTCGGTGCTTTATTTACGGCATTTGCAGGCTTTTATTATTGGTTTGGCAAAATATCCGG TAAACAATATCCGGACATTTTAGGCAAAATTCATTTTTGGATTACCTTTATAGGTGTTAATTTAACTTTCTTCCCGCAGC ATTTCTTAGGTCTTGCGGGTATGCCAAGAAGAATACCGGACTACCCTGAAGCTTTCGCCGGCTGGAATATGGTTTCGTCG ATAGGAGCAGGTATTTCTATGTTTGCTGCCCTTTATTTTGTATTTATCGTTTTCTATACGCTAAAATACGGCAAAGATTG TCCAAACAATCCTTGGGGAGAAGGAGCAGACACATTAGAGTGGACACTTACCTCACCACCGCCGTTCCATACTTTTGAAA CACCACCGCATATTGAGGGGTAA Protein sequence : MKTGRIIIMDITTTAIYHADHHTPHGWRRWLFSTNHKDIGIMYIIFAVFAGIVGGLFSLLFRLELAMPGGTFLNHDFQLY NVLITAHAVIMVFFMIMPALFGGFGNYFVPLLIGAPDMAFPRLNNISFWLLVPAFLLLMGSAFVDGGPGTGWTLYPPLSN LSGHPGAAVDMAIFSLHLTGLSSILGSINLIVTIFNMRAPGMGLFKMPLFVWSILVTAFLIILAMPVLGGAITMLLTDRN FGTTFFKPDGGGDPVLFQHLFWFFGHPEVYIVILPGFGIVSQVISTFSRKPIFGYQGMVGAMVIIGFVGFIVWAHHMFTV GLSYNALIYFTAGTMIIAVPTGIKIFSWIATMWGGSITFPTPMLFSIGFIILFTIGGVTGIILSNSALDRVLHDTYYVVA HFHYTMSLGALFTAFAGFYYWFGKISGKQYPDILGKIHFWITFIGVNLTFFPQHFLGLAGMPRRIPDYPEAFAGWNMVSS IGAGISMFAALYFVFIVFYTLKYGKDCPNNPWGEGADTLEWTLTSPPPFHTFETPPHIEG |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cur_1478 | YP_001800872.1 | cytochrome c oxidase subunit I | Not tested | Not named | Protein | 6e-95 | 47 |
