Gene Information

Name : A1C_03015 (A1C_03015)
Accession : YP_001493401.1
Strain : Rickettsia akari Hartford
Genome accession: NC_009881
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : cytochrome c oxidase polypeptide I
Function : -
COG functional category : C : Energy production and conversion
COG ID : COG0843
EC number : -
Position : 546881 - 548503 bp
Length : 1623 bp
Strand : -
Note : COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1

DNA sequence :
ATGAAAACAGGCAAAATAATAATTATGGATATAACTACTACCGAAATTTATCACGATGACCAGCACATCCCGAACGGTTG
GAGGCGATGGCTTTTTTCTACCAATCACAAAGATATCAGCATTATGTATATCATATTTGCCGTTTTTGCCGGAATTGTCG
GAGGGTTATTTTCTCTTCTATTTAGGTTAGAGCTTGCAATGCCCGGCGGCACTTTCTTAAATCATGATTTCCAGCTATAT
AACGTGCTTATCACAGCACATGCGGTTATTATGGTATTCTTTATGATTATGCCGGCGTTGTTTGGTGGTTTTGGTAACTA
TTTCGTACCTCTATTAATAGGGGCTCCCGATATGGCATTTCCACGCCTTAACAATATCAGTTTTTGGCTACTAATTCCTG
CTTTTTTCTTACTTATTGGTTCGGCTTTTGTTGACGGCGGACCGGGAACGGGCTGGACGCTCTACCCTCCTTTAAGTAAT
TTGAGCGGTCACCCGGGGGCAGCAGTTGATATGGCTATTTTCAGCTTACATTTAACAGGTCTATCGTCAATCCTCGGATC
AATTAACTTAATTGTTACTATCTTTAATATGAGAGCTCCAGGGATGGGTCTTTTCAAGATGCCTTTATTTGTTTGGTCTA
TCTTAGTAACTGCATTTCTGATAATCTTAGCTATGCCGGTGCTTGGCGGGGCTGTCACTATGCTCCTTACTGATCGTAAC
TTTGGTACCACTTTCTTTAAGCCTGATGGCGGCGGTGATCCTGTATTATTTCAGCATCTATTTTGGTTTTTCGGTCATCC
TGAAGTATATATCGTAATACTTCCAGGCTTTGGTATAGTAAGTCATGTTATTTCAACTTTTTCACGCAAACCTATATTTG
GTTATCAAGGTATGGTCGGAGCTATGGTAATAATCGGTTTCGTCGGATTTATCGTATGGGCTCACCATATGTTTACTGTT
GGGCTTTCTTATAATACACTTATATATTTCACTGCCGGAACGATGATTATAGCAGTTCCGACAGGCGTTAAAATATTTAG
CTGGATAGCGACTATGTGGGGCGGTTCTATTACATTCCCAACTCCTATGTTATTTTCGATAGGATTTATTATATTATTCA
CGATTGGCGGCGTAACTGGTATAATCCTATCAAATTCGGCACTTGATCGAGTTCTGCACGATACATATTATGTTGTTGCA
CATTTCCATTATACGATGTCACTCGGTGCTTTATTTACGGCATTTGCAGGCTTTTATTATTGGTTTGGAAAAATATCCGG
TAAACAATATCCAGAAATTTTAGGCAAAATCCATTTTTGGATTACATTTATTGGGGTTAATTTAACTTTCTTCCCGCAGC
ATTTCTTAGGTCTTGCGGGCATGCCAAGAAGAATACCGGATTACCCTGAAGCTTTCGGCGGCTGGAATATGGTTTCATCG
ATAGGAGCAGGTATCTCTATGGTGGCGGCTCTTTATTTTGTATTTATCGTTTTCTATACGCTAAAATATGGCAAAAATTG
TCCGGCCAATCCGTGGGGTGACGGTGCTAATACGCTTGAGTGGACGCTTACCTCACCACCGCCGTTCCATACTTTTGAAA
CACCACCGCATATTGAGGGGTAA

Protein sequence :
MKTGKIIIMDITTTEIYHDDQHIPNGWRRWLFSTNHKDISIMYIIFAVFAGIVGGLFSLLFRLELAMPGGTFLNHDFQLY
NVLITAHAVIMVFFMIMPALFGGFGNYFVPLLIGAPDMAFPRLNNISFWLLIPAFFLLIGSAFVDGGPGTGWTLYPPLSN
LSGHPGAAVDMAIFSLHLTGLSSILGSINLIVTIFNMRAPGMGLFKMPLFVWSILVTAFLIILAMPVLGGAVTMLLTDRN
FGTTFFKPDGGGDPVLFQHLFWFFGHPEVYIVILPGFGIVSHVISTFSRKPIFGYQGMVGAMVIIGFVGFIVWAHHMFTV
GLSYNTLIYFTAGTMIIAVPTGVKIFSWIATMWGGSITFPTPMLFSIGFIILFTIGGVTGIILSNSALDRVLHDTYYVVA
HFHYTMSLGALFTAFAGFYYWFGKISGKQYPEILGKIHFWITFIGVNLTFFPQHFLGLAGMPRRIPDYPEAFGGWNMVSS
IGAGISMVAALYFVFIVFYTLKYGKNCPANPWGDGANTLEWTLTSPPPFHTFETPPHIEG

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cur_1478 YP_001800872.1 cytochrome c oxidase subunit I Not tested Not named Protein 3e-94 47