Gene Information

Name : A1E_03360 (A1E_03360)
Accession : YP_001492392.1
Strain : Rickettsia canadensis McKiel
Genome accession: NC_009879
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : cytochrome c oxidase polypeptide I
Function : -
COG functional category : C : Energy production and conversion
COG ID : COG0843
EC number : -
Position : 697067 - 698665 bp
Length : 1599 bp
Strand : +
Note : COG0843 Heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 1

DNA sequence :
ATGGATATAACTACTAGCGACATTAATCACGATGACTACCATACCCCTCACGGTTGGAGACGATGGCTTTTTTCTACTAA
TCACAAAGATATCGGCATTATGTATATCATATTTGCCGTTTTTGCTGGAATTGTCGGCGGCTTATTTTCTCTTCTCTTTA
GATTAGAACTTGCAATGCCTGGCGGAACATTCCTTAATCATGATTTCCAGCTATATAACGTGCTTATCACAGCACATGCA
GTTATTATGGTATTCTTTATGATTATGCCGGCTTTATTCGGCGGATTCGGTAATTACTTTGTACCTCTATTAATAGGGGC
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TAATATGAGAGCACCAGGAATGGGGTTGTTTAAAATGCCATTATTTGTTTGGTCTATTTTAGTAACTGCATTCCTCATAA
TTCTAGCAATGCCGGTACTTGGTGGAGCTATCACTATGCTACTTACCGATCGTAACTTTGGCACTACTTTCTTTAAACCT
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GGGTTTTGGTATAGTAAGTCAGATTATCTCAACTTTTTCACGCAAACCTATATTCGGTTATCAAGGTATGGTTGGAGCTA
TGGTGATAATAGGCTTTGTCGGGTTTATTGTATGGGCTCACCATATGTTTACAGTTGGGCTTTCTTATAATGCACTTAGA
TATTTCACTGCCGGAACAATGATTATAGCAGTGCCGACAGGTATCAAAATATTTAGCTGGATAGCAACTATGTGGGGTGG
TTCTATTACGTTCCTAACACCTATGCTATTTTCAATAGGATTTATCATATTATTCACGATCGGCGGTGTAACCGGCATAA
TTCTATCAAATTCAGCACTTGATAGAGTACTGCATGATACATATTACGTTGTTGCACATTTCCATTATACGATGTCGCTC
GGTGCTTTATTTACAGCATTTGCAGGATTTTATTATTGGTTTGGTAAAATGTCAGGCAAACAATATCCAGAAGTTTTAGG
TAAAATTCATTTTTGGATTACCTTTATAGGCGTTAATTTAACTTTCTTCCCACAGCATTTCTTAGGTCTTGCGGGCATGC
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GCTGCTCTTTATTTTGTATTTATCGTTTTTTATACTTTAAAATACGGCAAAGATTGTCCAACCAATCCTTGGGGTGACGG
TGCTGATACGCTTGAGTGGACACTTACCTCTCCACCGCCATTTCATACATTTGAAACACCACCATGTATTGAAGAGTAA

Protein sequence :
MDITTSDINHDDYHTPHGWRRWLFSTNHKDIGIMYIIFAVFAGIVGGLFSLLFRLELAMPGGTFLNHDFQLYNVLITAHA
VIMVFFMIMPALFGGFGNYFVPLLIGAPDMAFPRLNNISFWLLVPAFILLIGSAFVDGGPGTGWTLYPPLSNLSGHPGAA
VDMAIFSLHLTGLSSILGSINLIVTIFNMRAPGMGLFKMPLFVWSILVTAFLIILAMPVLGGAITMLLTDRNFGTTFFKP
EGGGDPVLFQHLFWFFGHPEVYIVILPGFGIVSQIISTFSRKPIFGYQGMVGAMVIIGFVGFIVWAHHMFTVGLSYNALR
YFTAGTMIIAVPTGIKIFSWIATMWGGSITFLTPMLFSIGFIILFTIGGVTGIILSNSALDRVLHDTYYVVAHFHYTMSL
GALFTAFAGFYYWFGKMSGKQYPEVLGKIHFWITFIGVNLTFFPQHFLGLAGMPRRIPDYPKAFTGWNMVSSIGAGISML
AALYFVFIVFYTLKYGKDCPTNPWGDGADTLEWTLTSPPPFHTFETPPCIEE

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
cur_1478 YP_001800872.1 cytochrome c oxidase subunit I Not tested Not named Protein 8e-99 47