Name : lctP (Abu_0033) Accession : YP_001488987.1 Strain : Arcobacter butzleri RM4018 Genome accession: NC_009850 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 41118 - 42758 bp Length : 1641 bp Strand : - Note : Pfam match to PF02652 Lactate_perm, score 950.5, E-value 6.1E-283 DNA sequence : ATGCAAACTTGGCAACAAGTATATGCACCAATTGGAGGAAGTTTAGGTTTATCTGCACTTGTAGCACTAATTCCTATCGT TTTTTTCTTTTTGGCGCTTGCAGTATTTAGAATGAAAGGTCACTATGCAGCAATCATTACATTAGCATTATCGATGATTG TAGCAGTTTTTGGATTTGAAATGCCAGTTAATATGGTATTTGCATCTGCTGAATATGGTTTCTTATTTGGTTTATGGCCA ATCGCTTGGATTATTGTCGCATCAGTATTCTTATACAAATTAACTGTAAAAAGTGGACAATTTGAAATTATTAGAAATTC GATTATTTCAATAACTGAAGATCAAAGAATTCAAGTTATCTTAATTGGTTTCTCATTTGGTGCTTTTTTAGAAGGTGCTG CTGGTTTTGGTGCACCTGTTGCAATTACAGCTGCAATTTTAGTAGGACTTGGATTTAAACCATTATATGCAGCTGGATTG TGTCTTATTGCAAATACAGCACCTGTTGCTTTTGGAGCACTTGGAGTTCCAATTATTGTTGCAGGACAAGTAACTTCAAT TGATGCTTTTACAATTGGAGCAATGGCAGGTAGACAGTTACCACTATTATCTTTAATTATTCCTTTATGGTTAGTTGCAA TAATGGACGGATGGAAAGGTATAAAAGAAGTTTGGCCAGCAGCTTTAGTTGCAGGTGCAAGTTTTGCTATTTCTCAATAT CTTACTTCAAACTTTATAGGTCCTGAATTACCAGATGTTACTTCTGCTATAGTTTCTATCGTTGCAACAACAGTATTTTT AAAATACTGGAAACCAAAAAATGTTATGAAAACAGTAGAATTAGATGAGGTTGTTTCATCATCACATACAAGTGCTCAAG TATTTAAAGCATGGTCTCCATTTATTATTCTTTCTGTAATGGTTACAATTTGGACAACAGGTTGGTTTAAAGCCTTTTTT GCAAAAGGTCAAGTTTTAGCAAGTACTATTTTCAAATTTGAATTCTCTGCTATTCATAATATGATTTTCAAAATGCCTCC AATTACTAGTGCACCAAAATCTTTTGATGTTGTATATACATTTAATCCTATTTCAGCAACAGGTACAGCTATTTTCTTAA CAGCTATTATCACTTTATTTATTTTTAGATTAAATATATCAACAGCTACAAAAACAATGGGTGAAACACTATTTGAATTA AAATGGGCTATCGTATCAATTGGTATGGTTCTTGGTTTCGCATTTGTAATGAACTATTCAGGTATGTCTTCAACTATGGC ATTAGTTTTAGCAAATACAGGTTTCTTATTCCCTTTCTTCTCTCCGTTTCTTGGATGGCTTGGAGTATTCTTAACAGGTT CAGATACTTCATCAAATGCACTTTTCTGCGGATTACAACAACAAACTGCTCAACAATTAGGGCTTAATGAAACATTAATG GTTGCAGCAAATACAACTGGTGGGGTTTGTGGAAAAATGATCTCTCCTCAATCAATTTCTATTGCTTGTGCATCAACAGG AATTGTTGGAAAAGAGTCTGATTTATTTAGATTTACAGTTAAACATAGTTTAATTCTTGTAGTAATTATGGGACTTATAA CTATGACTCAAGCTTACGTTTTAACATGGATGATTCCATAA Protein sequence : MQTWQQVYAPIGGSLGLSALVALIPIVFFFLALAVFRMKGHYAAIITLALSMIVAVFGFEMPVNMVFASAEYGFLFGLWP IAWIIVASVFLYKLTVKSGQFEIIRNSIISITEDQRIQVILIGFSFGAFLEGAAGFGAPVAITAAILVGLGFKPLYAAGL CLIANTAPVAFGALGVPIIVAGQVTSIDAFTIGAMAGRQLPLLSLIIPLWLVAIMDGWKGIKEVWPAALVAGASFAISQY LTSNFIGPELPDVTSAIVSIVATTVFLKYWKPKNVMKTVELDEVVSSSHTSAQVFKAWSPFIILSVMVTIWTTGWFKAFF AKGQVLASTIFKFEFSAIHNMIFKMPPITSAPKSFDVVYTFNPISATGTAIFLTAIITLFIFRLNISTATKTMGETLFEL KWAIVSIGMVLGFAFVMNYSGMSSTMALVLANTGFLFPFFSPFLGWLGVFLTGSDTSSNALFCGLQQQTAQQLGLNETLM VAANTTGGVCGKMISPQSISIACASTGIVGKESDLFRFTVKHSLILVVIMGLITMTQAYVLTWMIP |
Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 4e-133 | 65 |