Gene Information

Name : lctP (Abu_0033)
Accession : YP_001488987.1
Strain : Arcobacter butzleri RM4018
Genome accession: NC_009850
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : L-lactate permease
Function : -
COG functional category : C : Energy production and conversion
COG ID : COG1620
EC number : -
Position : 41118 - 42758 bp
Length : 1641 bp
Strand : -
Note : Pfam match to PF02652 Lactate_perm, score 950.5, E-value 6.1E-283

DNA sequence :
ATGCAAACTTGGCAACAAGTATATGCACCAATTGGAGGAAGTTTAGGTTTATCTGCACTTGTAGCACTAATTCCTATCGT
TTTTTTCTTTTTGGCGCTTGCAGTATTTAGAATGAAAGGTCACTATGCAGCAATCATTACATTAGCATTATCGATGATTG
TAGCAGTTTTTGGATTTGAAATGCCAGTTAATATGGTATTTGCATCTGCTGAATATGGTTTCTTATTTGGTTTATGGCCA
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CTTACTTCAAACTTTATAGGTCCTGAATTACCAGATGTTACTTCTGCTATAGTTTCTATCGTTGCAACAACAGTATTTTT
AAAATACTGGAAACCAAAAAATGTTATGAAAACAGTAGAATTAGATGAGGTTGTTTCATCATCACATACAAGTGCTCAAG
TATTTAAAGCATGGTCTCCATTTATTATTCTTTCTGTAATGGTTACAATTTGGACAACAGGTTGGTTTAAAGCCTTTTTT
GCAAAAGGTCAAGTTTTAGCAAGTACTATTTTCAAATTTGAATTCTCTGCTATTCATAATATGATTTTCAAAATGCCTCC
AATTACTAGTGCACCAAAATCTTTTGATGTTGTATATACATTTAATCCTATTTCAGCAACAGGTACAGCTATTTTCTTAA
CAGCTATTATCACTTTATTTATTTTTAGATTAAATATATCAACAGCTACAAAAACAATGGGTGAAACACTATTTGAATTA
AAATGGGCTATCGTATCAATTGGTATGGTTCTTGGTTTCGCATTTGTAATGAACTATTCAGGTATGTCTTCAACTATGGC
ATTAGTTTTAGCAAATACAGGTTTCTTATTCCCTTTCTTCTCTCCGTTTCTTGGATGGCTTGGAGTATTCTTAACAGGTT
CAGATACTTCATCAAATGCACTTTTCTGCGGATTACAACAACAAACTGCTCAACAATTAGGGCTTAATGAAACATTAATG
GTTGCAGCAAATACAACTGGTGGGGTTTGTGGAAAAATGATCTCTCCTCAATCAATTTCTATTGCTTGTGCATCAACAGG
AATTGTTGGAAAAGAGTCTGATTTATTTAGATTTACAGTTAAACATAGTTTAATTCTTGTAGTAATTATGGGACTTATAA
CTATGACTCAAGCTTACGTTTTAACATGGATGATTCCATAA

Protein sequence :
MQTWQQVYAPIGGSLGLSALVALIPIVFFFLALAVFRMKGHYAAIITLALSMIVAVFGFEMPVNMVFASAEYGFLFGLWP
IAWIIVASVFLYKLTVKSGQFEIIRNSIISITEDQRIQVILIGFSFGAFLEGAAGFGAPVAITAAILVGLGFKPLYAAGL
CLIANTAPVAFGALGVPIIVAGQVTSIDAFTIGAMAGRQLPLLSLIIPLWLVAIMDGWKGIKEVWPAALVAGASFAISQY
LTSNFIGPELPDVTSAIVSIVATTVFLKYWKPKNVMKTVELDEVVSSSHTSAQVFKAWSPFIILSVMVTIWTTGWFKAFF
AKGQVLASTIFKFEFSAIHNMIFKMPPITSAPKSFDVVYTFNPISATGTAIFLTAIITLFIFRLNISTATKTMGETLFEL
KWAIVSIGMVLGFAFVMNYSGMSSTMALVLANTGFLFPFFSPFLGWLGVFLTGSDTSSNALFCGLQQQTAQQLGLNETLM
VAANTTGGVCGKMISPQSISIACASTGIVGKESDLFRFTVKHSLILVVIMGLITMTQAYVLTWMIP

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
glcA CAE85240.1 GlcA protein, putative glycolate permease Not tested PAI V 536 Protein 4e-133 65