Gene Information

Name : amtB (Abu_1151)
Accession : YP_001490080.1
Strain : Arcobacter butzleri RM4018
Genome accession: NC_009850
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : ammonium transporter
Function : -
COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism
COG ID : COG0004
EC number : -
Position : 1156461 - 1157780 bp
Length : 1320 bp
Strand : +
Note : Pfam match to PF00909 Ammonium_transp, score 471.1, E-value 1.3E-138

DNA sequence :
ATGAAAAAGTGGGTTTTATTAACTTCACTAATGAGTTCTTTAGCTTTTGCTGAAGAGGTAACGGAGCCAGCTGTATTAAA
TACAGGAAATACTGCTTGGATGATGATGTCAACTGCATTGGTATTTTTAATGACACCAATTGGTTTAGCATTATTCTACT
CTGGTATGACAAGAGTAAAAAATGTTTTAAATACATATTTAATGGTATTTGGTGCATTTACTATTTCGTTTATAGCATGG
ATTATAGCAGGTTTTTCAATCGGATTTGGAACAGTAGAGGGATCATTAAATGAATTCATTGGTGGATTTTCTCACATAAT
GTTAAGTGGTATTAGTTGGTCTGACCTTTCAGCTGAAACAGGACAAACATATCCAAAGTTTGTGTTCATTGTATTTCAAG
GTACTTTTGCAGCTATTACAATAGCAATTGCAGCTGGTTCAGTTATTGAAAGAATGAAGTTTTCTACTTGGATGATTTTT
GCATTTATTTGGACGATAGTTGTTTATGCTCCAATTGTACACATGGTTTGGGGTGGAGGATACCTATTTAATGAAGGTGC
TTTAGACTTTGCTGGTGGAACAGTTGTTCATATGAATGGTGGTTTAGCTGGTTTAGTTCTTGCAATTTTACTTGGTAAAA
GAAATGATTATCCAAAAACTGCGATGAAACCTGCAAGTATCATCTTAACGGCTGTTGGTGCAGGTTTATTATGGTTTGGA
TGGTATGGATTTAATGGTGGTTCAGCATTTGGTGCAAATGAAATAGCTGGTCTTGCTTACCTTACAACAACTATAGCAAC
GTCAATTGCAGCTATTACTTGGTTGATTATTGAAACAATTATATTTAAAAAAGCTACTCTTTTAGGTGCAGCTTCAGGTG
CAATAGCAGGTTTAGTAGCTATTACTCCAGCAGCAGGATTTGTTGATGTTAGTGGTTCTTTAATAATAGGTATAGTTGGT
TCTATTGTAGCATTCTTTGGAGTTGCTATGTTGAAGAAAAAACTTGGATATGATGATAGTTTAGATGCATTTGGTATTCA
CTTCCTTGCTGGTATGTGGGGAGCAGTTGCAACAGGAATCTTTGCTCTAAATGATAAAGATCTTTTATGGTCTGGTCCAT
TAAAAGATGCTGATGATAGATTAGCTCAAATTTTTGTTCAATTTGAATCAATAGCAGTTGTAGGTATCTATACATTAATC
GGAACAATAGTTGTTTACTATATAGCTTCAATGTTAACAAAAGGTGCAAGAGTTACTGAAGAAGAAGAAAGACAAGGTCT
TGATGAGTCGTTACACGGTGAACGTGGATTTAACCTATAA

Protein sequence :
MKKWVLLTSLMSSLAFAEEVTEPAVLNTGNTAWMMMSTALVFLMTPIGLALFYSGMTRVKNVLNTYLMVFGAFTISFIAW
IIAGFSIGFGTVEGSLNEFIGGFSHIMLSGISWSDLSAETGQTYPKFVFIVFQGTFAAITIAIAAGSVIERMKFSTWMIF
AFIWTIVVYAPIVHMVWGGGYLFNEGALDFAGGTVVHMNGGLAGLVLAILLGKRNDYPKTAMKPASIILTAVGAGLLWFG
WYGFNGGSAFGANEIAGLAYLTTTIATSIAAITWLIIETIIFKKATLLGAASGAIAGLVAITPAAGFVDVSGSLIIGIVG
SIVAFFGVAMLKKKLGYDDSLDAFGIHFLAGMWGAVATGIFALNDKDLLWSGPLKDADDRLAQIFVQFESIAVVGIYTLI
GTIVVYYIASMLTKGARVTEEEERQGLDESLHGERGFNL

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
BJAB07104_00287 YP_008207752.1 Ammonia permease Not tested AbaR25 Protein 3e-53 48
BJAB0868_00291 YP_008211617.1 Ammonia permease Not tested AbaR26 Protein 3e-53 48