Gene Information

Name : C8J_0628 (C8J_0628)
Accession : YP_001482204.1
Strain : Campylobacter jejuni 81116
Genome accession: NC_009839
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : hypothetical protein
Function : -
COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism
COG ID : COG2060
EC number : -
Position : 629703 - 631394 bp
Length : 1692 bp
Strand : +
Note : -

DNA sequence :
ATGCTAGAAATTTTAATAACACTGATTATAGCTTTTATATTGGCTTTAATTTTTGGAAATTATCTTTATAAAATTGCAAG
CTGTAAAAAAACTATTTTTGATTTTATTTTTAATCCAATTGATAACTTAATTTATAAAATTTGTGCAATTGATAGAAAAA
ATATGACTTGGCAAAAATATTCTTTACATTTAATTGCTTTTAATGCCTTAGTGGCTATTTTTTCTTTCGTGATTTTTTAT
TTGCAAGATAAACTTTTTTTAAATCCCAATTTGATAAATTCTATGAAAGGGGATTTGAATTTAAATACTGTAATTAGTTT
TATTACAAATACAAACCTTCAGCATTATAGTGGAGAGAGTGCTTTAAGTTTGCTTTCCCAAAATACAGGCATTTTACTTG
CTATGTTTGTTTCAAGTGCAAGTGGATATTCTGCTTGTATGGCTTTTTGTCGTGCTTTATGTGGTATGCAAATGGGAAAT
TTTTATGAAGATTTTACGCGTATTATTACGCGTTTGATGTTGCCTTTAAGTTTTATTTTGGCTGTAATTTTTATCTCTGA
AGGCGTGGTGCAAAACTATCACGCAAATTTTAGCGTGCTTACTTTAGAAAATAAATTTCAAAGCATTGCCACAGGTCCTG
TTGCAGCTCTTGAGTCTATAAAACATTTAGGGACAAATGGGGGTGGTTTTTTTGGTGCTAATTCAAGCATGCCTTTTGAA
AATCCTACTTCACTTACAAATTTTTTACAAATTTTATCCATGATGCTTATTCCTAGCGCCTGTGTTGTAGCTTTTGGATT
GATGGTTTATCATAGAAAAGAAAGACAAGGTTTTGCTCTTATGGGAAAAGAAGGGGGAGTTATTTTTGGTGCAATGGGGA
TTATTTTTATCATTTCTTTGCTTTTAATTTATTTTAGCGAAAAAATGTCAAATCCAAATTTGGATTCTTTGGGTTTAAAT
GCAAATTTGGGAAATTTAGAAGGTAAAGAAATAAGATTTGGCACAGATGGTTCGAGTTTATTTAGTGCTGTAACTACTGC
TTTTACTACAGGAAGCGTCAATAATATGCACGATAGTTTAAATCCTTTAAGCATCAGTGCTACTTTGCTAAATATGATGT
TAAATGTGGCTTTTGGTGGCGAAGGAGTAGGGCTTATGAATATGATTATTTATGTGCTTTTAACCGTGTTTATTTGTGCA
TTAATGATAGGCAGAACTCCAGAATTCTTGGGTAAAAAAATAGAAAGCGCACAAATGAAGCTTATAGCTTTGGTAATTCT
TATCCATCCTTTATTAATCCTTGTTTTAAGTGCATTAGCTGTTGTTTTTGCAAAAGATAGTATAAGCAATCCTAGCTTTC
ATGGCTTGGCTCAAATTTTATATGAATTTAGTTCTTCGGCAGCAAATAATGGTTCAGGACTTGAAGGTTTAAAAGATGAT
AATTTATTTTGGAATTTAAGTACAGCTTTTGCTATGTTTTGTGGGCGTTATTTGGTTTTAATAGCTCAGCTTGCTATAGC
TGGATCGCTTTTGGCTAAAAATACACAAGAAAATACTGCAAATTCTTTAAAAACGGATAATTTAACTTTTATGTTTGTGC
TTGTTTGTATTATATATATTTTTACTGCACTTACTTTTTTTCCAGTGCTTACTTTATCAAGCGTTGCAGAATATTTATCT
TTATGGCATTAA

Protein sequence :
MLEILITLIIAFILALIFGNYLYKIASCKKTIFDFIFNPIDNLIYKICAIDRKNMTWQKYSLHLIAFNALVAIFSFVIFY
LQDKLFLNPNLINSMKGDLNLNTVISFITNTNLQHYSGESALSLLSQNTGILLAMFVSSASGYSACMAFCRALCGMQMGN
FYEDFTRIITRLMLPLSFILAVIFISEGVVQNYHANFSVLTLENKFQSIATGPVAALESIKHLGTNGGGFFGANSSMPFE
NPTSLTNFLQILSMMLIPSACVVAFGLMVYHRKERQGFALMGKEGGVIFGAMGIIFIISLLLIYFSEKMSNPNLDSLGLN
ANLGNLEGKEIRFGTDGSSLFSAVTTAFTTGSVNNMHDSLNPLSISATLLNMMLNVAFGGEGVGLMNMIIYVLLTVFICA
LMIGRTPEFLGKKIESAQMKLIALVILIHPLLILVLSALAVVFAKDSISNPSFHGLAQILYEFSSSAANNGSGLEGLKDD
NLFWNLSTAFAMFCGRYLVLIAQLAIAGSLLAKNTQENTANSLKTDNLTFMFVLVCIIYIFTALTFFPVLTLSSVAEYLS
LWH

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SAR0070 YP_039538.1 potassium-transporting ATPase subunit A Not tested Type-II SCCmec Protein 7e-89 48
truncated-kdpA NP_370596.1 potassium-transporting ATPase subunit A Not tested Type-II SCCmec Protein 7e-89 48
kdpA NP_373308.2 potassium-transporting ATPase subunit A Not tested Type-II SCCmec Protein 7e-89 48
kdpA YP_190030.1 potassium-transporting ATPase subunit A Not tested Type-II SCCmec Protein 7e-89 48
kdpA YP_251948.1 potassium-transporting ATPase subunit A Not tested SCCmec Protein 6e-90 48
unnamed BAB43902.1 potassium-transporting ATPase(A chain) Not tested Type-II SCCmec Protein 5e-89 48