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Name : lctP (JJD26997_0087) Accession : YP_001397338.1 Strain : Campylobacter jejuni 269.97 Genome accession: NC_009707 Putative virulence/resistance : Unknown Product : L-lactate permease Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1620 EC number : - Position : 90721 - 92403 bp Length : 1683 bp Strand : - Note : identified by match to protein family HMM PF02652; match to protein family HMM TIGR00795 DNA sequence : TTGGAGCAAATTTTAACATGGCAACAAATTTATGACCCTTTTTCAAACATTTGGCTAAGTGCTTTAGTAGCATTTTTACC TATACTATGTTTTTTAGTTTGTTTGGTTGTTTTAAAACTTAAAGGCTATCAAGCAGGTTTTTTAACTGTCGTATTTGCGA CCTTTATAGCTTTATCTGCTTACAAAATGCCTTGGAATTTAGTGGGTGCAAGTTTTATTCAAGGCTTTACAAATGGTATG TGGCCTATAGCTTGGATTATCATCGCGGCAATCTTTCTTTACAAACTTTCTATCAAATCAGGTTCTTTTGAAATCATTAA AAAAAGCGTGATGAGTATTACTCCAGATCATAGAATTCAAGTGATTTTAATAGGTTTTTGTTTTGGTTCATTTCTAGAGG GTGCTATAGGTTTTGGTGGCCCTGTAGCTATAACTGCTGCACTTTTAGTAGGGCTTGGCTTGCGTCCTTTGCAAGCTGCA GGTCTTTGTCTTATCGCAAATACCGCTCCTGTCGCTTTTGGTGCGGTGGGAATTCCTATTATTGCTATGGCAAATCTTGT CGGCATAGAACAGCATTCAGTCTCTGCAATGGTTGGTAGAATGCTAGTTCCTTTAAGCCTTACCATACCTTTTTTTATAG TTTTTTTAATGGATGGATTTAAAGGTGTTAAAGAAACTTTTCCAGCTATTTTAGTTGCGGCACTAAGTTTTACAACTACT CAATTTTTAAGCTCAAATCACTTAGGAGCAGAATTACCTGATATTATTTCAGCTGTAGTTTCTTTAGCAGTTACAACTAT ATTTTTAAAATTTTGGAAACCAAAAAATATTTTTAGATTTGATAATGAAAGCAATTTCACTCAAGATAACACCCTAAGCT TTAATCAAGTTCTAAAAGCTTGGTCGCCTTTTATTTTGCTTATTGTTTGTATTATCATTTGGACACAACCTTGGTTTAAA GGTCTTTTTGATAAAGATGGTATTTTAAGTTATACAAGCATTACTTTACAATTTAGCAATATCACAACTGGAATTTTAAG CCCTTCTATCACAAGCATAGGAGAAGCTAAGCCTTTATCTTTGACCTTAGGTGTAGATTTGATCAATGGAAAAACCGTAG CTCAAGGCGGAACAGCAATTTTACTTGCTGCCTTTTTAACTATAGCTATTTTAAAAATCAAAGCCCAAGATGCAGCAGAA TGCTTTTGGGCTACTTTAAAAGAAATGGCTATACCTTGCATCACTATAGGTTTAGTTGTAGCTTTTGCTTTTATTTCTAA AAATAGTGGTATGAGTACTACTTTAGGACTTGCTTTTGCACACACAGGTGATGCTTTTTCTTTCTTTTCACCAATCATTG GCTGGATAGGAGTATTTTTAACAGGTTCTGATACAAGTGCTAATTTACTTTTTGGAACCTTACAACAAGTAAGTGCTCAA AAGCTAGGTATCAGCGAAGCTTTATTTTTAGCAGCTAATTCAGTAGGCGGAGTCGTTGGAAAAATGATTAGTCCACAAAG TATTGCTATAGCTTGTGCAGCAGTTGGACTTGTGGGAAAAGAATCTGATCTTTTTAAATTTACATTAAAATATTCTGTAG CTTTTATTGTTTTAATAGGAATTTGGACTTGCATTATAGCTTTTTTCTTACAAGGAATCATTCCTGAAGTTATAGTAAAA TAA Protein sequence : MEQILTWQQIYDPFSNIWLSALVAFLPILCFLVCLVVLKLKGYQAGFLTVVFATFIALSAYKMPWNLVGASFIQGFTNGM WPIAWIIIAAIFLYKLSIKSGSFEIIKKSVMSITPDHRIQVILIGFCFGSFLEGAIGFGGPVAITAALLVGLGLRPLQAA GLCLIANTAPVAFGAVGIPIIAMANLVGIEQHSVSAMVGRMLVPLSLTIPFFIVFLMDGFKGVKETFPAILVAALSFTTT QFLSSNHLGAELPDIISAVVSLAVTTIFLKFWKPKNIFRFDNESNFTQDNTLSFNQVLKAWSPFILLIVCIIIWTQPWFK GLFDKDGILSYTSITLQFSNITTGILSPSITSIGEAKPLSLTLGVDLINGKTVAQGGTAILLAAFLTIAILKIKAQDAAE CFWATLKEMAIPCITIGLVVAFAFISKNSGMSTTLGLAFAHTGDAFSFFSPIIGWIGVFLTGSDTSANLLFGTLQQVSAQ KLGISEALFLAANSVGGVVGKMISPQSIAIACAAVGLVGKESDLFKFTLKYSVAFIVLIGIWTCIIAFFLQGIIPEVIVK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| glcA | CAE85240.1 | GlcA protein, putative glycolate permease | Not tested | PAI V 536 | Protein | 9e-99 | 50 |
