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Name : treC (CLI_2054) Accession : YP_001391312.1 Strain : Clostridium botulinum Langeland Genome accession: NC_009699 Putative virulence/resistance : Unknown Product : alpha,alpha-phosphotrehalase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : 3.2.1.93 Position : 2183365 - 2185032 bp Length : 1668 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF00128; match to protein family HMM TIGR02403 DNA sequence : ATGAAAGATTTTAAAAAAAGTGTAGTCTATCAAATCTACCCGAAATCCTTTAATGATACTAATGGTGATGGATTGGGAGA TTTAAAAGGAATTACAGTTAAATTGGATTATTTAAAAACATTAGGTATAGATTATATATGGTTAACTCCTTTTTATATTT CTCCTCAAAGGGATAATGGATATGATGTAGCGGATTATTGCAATATTGATCCTCTATTTGGTACCATGGAAGATTTTGAA AATCTAGTTAGAGAAGCAAATAAAAGAGGAATTGATGTTATGCTTGATATGGTATTTAATCATACCTCTACAGAACATAA ATGGTTTAAAAATGCTCTAAGCGGCGATAAAAAATATAAAAATTATTATATATTCAAAGAACCTAAGAATAGACAGCTCC CTACTAACTGGGAATCTAAATTTGGAGGTCCCGCTTGGGAATATGTTAAAGAGCTTGATGAATATTACCTACATCTATTT GATGCTACTCAAGCAGATCTTAACTGGGAAAATGAAGAAGTTAGAACAGAAGTTTTTGATATTGTGAATTTTTGGATAAA AAAAGGTGTAAAAGGCTTTCGTTTTGATGTTATTAACCTAATTTCAAAACCAATGGAATATAAGGATGACAATAATGGAG ATGGTCGTTCATTCTACACAGATGGTCCTAATATTCATAGCCATATAAAGCAACTAAATAAAGAAACCTTTGGCAGGTAT AAAGATATAATTACTGTAGGTGAAATGTCCTCTACCACCATAGATAATTGCATTAAATATTCAGATCCTAGAGAAGAAGA ATTGTCTATGGTATTTAATTTTCATCATCTAAAAGTAGATTATAAAGATGGTGATAAATGGAGCTTAATGGATTTTGATT TTATAAAATTAAAAAATATCTTTAATCATTGGCAGGTTGGAATGGAAGAAGGTAATGGCTGGAATGCAGTATTTTGGTGC AACCATGACCAACCTCGTATTGTATCTCGCTTTGGAGATGATAATAAATACCATAAAGAATCTGCAAAAATGTTAGCTAC ATCAATACATTTACTTAGAGGGACTCCTTATATTTATCAGGGAGAAGAAATCGGTATGACAAATTGTTATTATGATACAA TTAATTCCTATAAGGATGTGGAATCAATTAATTTTTATAATATACTAAAGGCTGAAGGTAAAACTGAAGAAGAAATAATT AAAATTTTACAGGCAAAATCAAGAGATAATTCCCGTAGTCCAATGCAATGGGATAACTCAAACAATGCTGGTTTTACTAA AGAAGATCCTTGGATAAAAATATGCAAAAACTATAAAGATATCAATGTAGAAAACTCCTTAAAAGATAAAGATTCAGTTT TTTATCATTATCAAAAACTGATTAAGTTAAGAAAGGAATACGATATTGTATCTTATGGAAATTTTGAATTAATATTAGAA GAAGATAAAAGTATATTTGCTTATTTAAGAAATTACAAAAATGAAAAACTACTTGTAATAAATAATTTCTATGGAAAGGA ATCCTTATTTAAATTGCCTACAGAATTAAAATTAGGTGAATATAAAAACAAAATTTTAATTTCTAATTATAAGGATTCTC CTATAGATTTTAGAAAAATTAATTTAAGACCTTATGAGTCTATAGTTTACCATCTTGAGAGAAAATAA Protein sequence : MKDFKKSVVYQIYPKSFNDTNGDGLGDLKGITVKLDYLKTLGIDYIWLTPFYISPQRDNGYDVADYCNIDPLFGTMEDFE NLVREANKRGIDVMLDMVFNHTSTEHKWFKNALSGDKKYKNYYIFKEPKNRQLPTNWESKFGGPAWEYVKELDEYYLHLF DATQADLNWENEEVRTEVFDIVNFWIKKGVKGFRFDVINLISKPMEYKDDNNGDGRSFYTDGPNIHSHIKQLNKETFGRY KDIITVGEMSSTTIDNCIKYSDPREEELSMVFNFHHLKVDYKDGDKWSLMDFDFIKLKNIFNHWQVGMEEGNGWNAVFWC NHDQPRIVSRFGDDNKYHKESAKMLATSIHLLRGTPYIYQGEEIGMTNCYYDTINSYKDVESINFYNILKAEGKTEEEII KILQAKSRDNSRSPMQWDNSNNAGFTKEDPWIKICKNYKDINVENSLKDKDSVFYHYQKLIKLRKEYDIVSYGNFELILE EDKSIFAYLRNYKNEKLLVINNFYGKESLFKLPTELKLGEYKNKILISNYKDSPIDFRKINLRPYESIVYHLERK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 2e-126 | 48 |
