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Name : potB (CLC_0619) Accession : YP_001386500.1 Strain : Clostridium botulinum Hall Genome accession: NC_009698 Putative virulence/resistance : Unknown Product : spermidine/putrescine ABC transporter permease PotB Function : - COG functional category : E : Amino acid transport and metabolism COG ID : COG1176 EC number : - Position : 635001 - 635960 bp Length : 960 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF00528 DNA sequence : ATGTGGGGGAAATTTAGCAGTGCTTTTTCAAATATTTTTAAAAAGCAATTGCATAATAAAAATACAGATATTAGCTTAGA AAGCAAAGAAGGAATAAGAGGTAAACTAAAAAAATCTACCCCTATATTTAAAACAGTGGGGCCCGTTGCCCTATGGCTCA TTACATTTTTTATTGTTCCTTTACTTCTTGTATTAGTGGTTAGCTTTTTATCAAGAGGTGAATATGGAGATGTAACATTA CCTTTTACACTAAAAAATTATAAAAGACTCATAGATCCTATGTACGGACAAATTTTAATTAAAACTTTAATGATTTCTAT TAGTACTACTTTAGGGTGTTTGATTATAGGTTATCCTTTTGCATATTTTATTGGAAGATCAGATAAAAAATATAGAGGAC TATTATTATTATTAGTTATACTACCTTTTTGGACTAATTCTTTAGTTCGAACTTATGCATGGATAATACTTCTAAAAACA GAGGGAGTAATTAACACATATCTTATGAGATTTGGATTAATTCACTCCCCAATGCAAATGCTTTATACAGATAGTGCTGT ATTTATAGGAATGCTTTATATAATGTTGCCTTTTATGGTGCTACCTATTTATACATCTATAGAAAAATTAGATATGAGTT ATATAGAAGCTGCCAATGATCTTGGAGCATCACCTTACAAGACCTTTAAAGAAATAACATTACCTTTAACTCTACCGGGT ATTATAGCAGGATGTATGCTAGTATTTATACCAACCTTAGGTTATTTCTTTATATCTGACTTAATGGGTGGAAGTAAAAC TATGTTAATTTCAAATCTAATTAAAAACCAATTTTTAACCTCTAGAGATTGGCCCTTTGGTTCGGCTATAGCAGTAATAT TAATTATTTTAATGCTTATAGCTATAAGTTTCTATTTTAAAGGAAATAAACCAAAGAAGGGAATAAAGGAGGTTAACTAA Protein sequence : MWGKFSSAFSNIFKKQLHNKNTDISLESKEGIRGKLKKSTPIFKTVGPVALWLITFFIVPLLLVLVVSFLSRGEYGDVTL PFTLKNYKRLIDPMYGQILIKTLMISISTTLGCLIIGYPFAYFIGRSDKKYRGLLLLLVILPFWTNSLVRTYAWIILLKT EGVINTYLMRFGLIHSPMQMLYTDSAVFIGMLYIMLPFMVLPIYTSIEKLDMSYIEAANDLGASPYKTFKEITLPLTLPG IIAGCMLVFIPTLGYFFISDLMGGSKTMLISNLIKNQFLTSRDWPFGSAIAVILIILMLIAISFYFKGNKPKKGIKEVN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| potB | BAA36746.1 | - | Not tested | LIM | Protein | 1e-60 | 51 |
