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Name : treC (CLC_1934) Accession : YP_001387788.1 Strain : Clostridium botulinum Hall Genome accession: NC_009698 Putative virulence/resistance : Unknown Product : alpha,alpha-phosphotrehalase Function : - COG functional category : G : Carbohydrate transport and metabolism COG ID : COG0366 EC number : 3.2.1.93 Position : 2053984 - 2055651 bp Length : 1668 bp Strand : + Note : identified by match to protein family HMM PF00128; match to protein family HMM TIGR02403 DNA sequence : ATGAAAGATTTTAAAAAAAGTGTAGTCTATCAAATCTACCCAAAATCCTTTAATGATACTAATGATGATGGATTGGGAGA TTTAAAAGGAATTACAGTTAAATTGGATTATTTAAAAACATTAGGTATAGATTATATATGGTTAACTCCTTTTTATATCT CCCCTCAAAGGGATAATGGATATGATGTAGCGGATTATTGCAATATTGATCCTCTATTTGGTACCATGGAAGATTTTGAA AATCTAGTTAGAGAAGCAAATAAAAGAGGAATTGATGTTATGCTTGATATGGTATTTAATCATACCTCTACAGAACATAA ATGGTTTAAAAATGCTCTAAGCGGCGATAAAAAATATAAAAATTATTATATATTCAAAGAACCTAAAAATAAACAGCTCC CTACTAACTGGAAATCTAAATTTGGAGGTCCCGCTTGGGAATATGTTAAAGAGCTTGATGAATATTACCTACATCTATTT GATGCTACTCAAGCAGACCTTAACTGGGAAAATGAAGAAGTTAGAACAGAAGTTTTTGATATTGTGAATTTTTGGATAAA AAAAGGTGTAAAAGGCTTTCGTTTTGATGTTATTAACCTAATTTCAAAACCAATGGAATATAGGGATGACAATAATGGAG ATGGTCGTTCATTCTACACAGATGGTCCTAATATTCATAACCATATAAAGCAACTAAATAAAGAAACCTTTGGCAGATAT AAAGATATAATTACTGTAGGTGAAATGTCCTCTACCACCATAGATAATTGCATTAAATATTCAAATCCTAAAGAAGAAGA ATTGTCTATGGTATTTAATTTTCATCATCTAAAAGTAGATTATAAAGATGGTGATAAATGGAGCTTAATGGATTTTGATT TTATAAAATTAAAAAGTATCTTTAATCATTGGCAGGCTGGAATGGAAGAAGGTAATGGCTGGAATGCAGTATTTTGGTGC AACCATGACCAACCTCGTATTGTATCTCGCTTTGGAGATGATAATAAATACCATAAAGAATCTGCAAAAATGTTAGCTAC ATCAATACATCTACTTAGGGGAACTCCTTATATTTATCAGGGAGAAGAAATCGGTATGACAAATTGTTATTATGATACAA TTAATTCCTATAGGGATGTGGAATCAATTAATTTTTATAATATACTAAAGTCTGAAGATAAAACTGAAGAAGAAATAATT AAAATTTTACAGGCAAAATCAAGAGATAATTCCCGCAGTCCAATGCAATGGGATAACTCAAACAATGCTGGTTTTACTAA AGAAGAGCCGTGGATAAAAGTATGCAAAAACTATAAAGATATCAATGTAGAAAACTCCTTAAAAGATAAAGATTCAGTTT TTTATCATTATCAAAAACTGATTAAGTTAAGAAAGGAATACGATATTATATCTTATGGAAATTTTGAATTAATACTAAAA GAAGACAAAAGTATATTTGCTTATTTAAGAAACTACAAAAATGAAAAACTACTTGTAATAAATAATTTTTATGGAAAGGA AATCTTATTTAAATTGCCTACAGAATTAAAATTAGGTGAATATAAAAACAAAATTTTAATTTCTAATTATAAGGATTCCC CTATAGACTTTAGAAAAATTAATTTAAGACCTTATGAGTCTATAGTTTACCATCTTGAGAGAAAATAA Protein sequence : MKDFKKSVVYQIYPKSFNDTNDDGLGDLKGITVKLDYLKTLGIDYIWLTPFYISPQRDNGYDVADYCNIDPLFGTMEDFE NLVREANKRGIDVMLDMVFNHTSTEHKWFKNALSGDKKYKNYYIFKEPKNKQLPTNWKSKFGGPAWEYVKELDEYYLHLF DATQADLNWENEEVRTEVFDIVNFWIKKGVKGFRFDVINLISKPMEYRDDNNGDGRSFYTDGPNIHNHIKQLNKETFGRY KDIITVGEMSSTTIDNCIKYSNPKEEELSMVFNFHHLKVDYKDGDKWSLMDFDFIKLKSIFNHWQAGMEEGNGWNAVFWC NHDQPRIVSRFGDDNKYHKESAKMLATSIHLLRGTPYIYQGEEIGMTNCYYDTINSYRDVESINFYNILKSEDKTEEEII KILQAKSRDNSRSPMQWDNSNNAGFTKEEPWIKVCKNYKDINVENSLKDKDSVFYHYQKLIKLRKEYDIISYGNFELILK EDKSIFAYLRNYKNEKLLVINNFYGKEILFKLPTELKLGEYKNKILISNYKDSPIDFRKINLRPYESIVYHLERK |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| malL | YP_251987.1 | oligosaccharide alpha-1,6-glucosidase | Not tested | SCCmec | Protein | 2e-127 | 48 |
