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Name : hsdR (NWMN_0139) Accession : YP_001331174.1 Strain : Staphylococcus aureus Newman Genome accession: NC_009641 Putative virulence/resistance : Unknown Product : type-I restriction-modification system restriction endonuclease subunit Function : - COG functional category : V : Defense mechanisms COG ID : COG0610 EC number : - Position : 174254 - 177043 bp Length : 2790 bp Strand : + Note : - DNA sequence : ATGGCATACCAAAGTGAATACGCATTAGAAAATGAAATGATGAATCAACTTGAACAATTGGGTTACGAAAGAGTAACGAT ACGTGATAATAAGCAATTGCTTGATAATTTTAGAACGATTTTAAATGAGCGTCATGCGGACAAATTAGAAGGCAATCCCT TAACAGATAAAGAATTTCAACGTCTGTTAACGATGATTGATGGAAAAAGTATTTTCGAGAGTGCCCGTATTTTACGTGAT AAATTACCACTTAGACGTGATGATGAGTCTGAGATTTATTTGTCGTTTTTAGATACGAAAAGTTGGTGTAAAAATAAGTT TCAAGTGACGAATCAAGTATCTGTCGAGGATACATATAAAGCACGTTATGATGTAACGATATTAATCAACGGACTACCCC TTGTCCAAGTTGAATTGAAACGTCGAGGTATTGATATTAATGAGGCGTTTAACCAAGTAAAACGTTACCGCAAACAAAAT TACACAGGCTTATTCCGCTACATACAAATGTTTATCATTAGTAATGGTGTTGAAACGCGATACTTTTCTAATAATGATAG CGAACTATTGAAGAGTCACATGTTTTATTGGAGTGATAAACAGAATAACCGTATCAATACATTGCAATCGTTTGCTGAGT CATTTATGAGACCTTGTCAATTAGCTAAGATGATATCGCGCTATATGATTATTAATGAAACAGATAGAATACTGATGGCA ATGCGTCCGTATCAAGTGTATGCGGTAGAAGCACTTATTCAACAAGCGACTGAGACAGGGAATAATGGATATGTATGGCA TACAACTGGAAGTGGTAAGACGTTGACTTCTTTTAAAGCGAGTCAGATTTTATCACAGCAAGATGACATTAAGAAAGTTA TCTTTTTGGTTGACCGTAAAGACTTGGATAGTCAAACAGAAGAGGAATTTAATAAATTTGCTAAGGGTGCTGTAGACAAA ACTTTTAATACCTCGCAACTGGTACGCCAACTAAATGATAAAAGTTTGCCACTTATTGTAACGACGATTCAAAAAATGGC TAAAGCGATTCAAGGGAATGCCCCTTTATTAGAACAGTATAAAACGAATAAAGTTGTATTTATTATTGATGAGTGTCATC GCAGTCAATTTGGTGACATGCATCGTCTAGTTAAACAACATTTCAAAAATGCCCAATACTTTGGATTCACTGGTACGCCA CGTTTTCCAGAAAATAGTAGTCAAGATGGTAGAACAACTGCAGATATTTTCGGTAGATGCTTACATACGTATTTAATTAG AGATGCCATTCATGATGGTAATGTACTTGGTTTCTCAGTTGACTATATTAATACTTTTAAAAATAAAGCTTTAAAAGCAG AAGATAACAGCATGGTTGAAGCAATTGATACGGAAGAAGTATGGTTAGCGGATAAACGTGTGGAATTAGTAACACGACAT ATCATCAATAATCATGATAAATATACACGTAATCGTCAATATTCAAGTATATTTACAGTCCAAAGTATTCACGCGCTTAT TAAATATTATGAGACATTTAAGCGACTTAACAAAAAGTTGGAACAACCGTTAACGATAGCTGGTATATTTACGTTTAAAC CTAATGAAGATGATCGTGATGGTGAAGTGCCATATCATTCACGTGAAAAATTAGAGATAATGATTAGTGATTATAATAAA AAGTTCGAGACGAATTTTTCAACAGACACAACTAATGAGTATTTTAATCATATTTCAAAAAACGTTAAAAAGGGCGTTAA AGATAGTAAAATTGATATCTTAATCGTTGTTAATATGTTCTTAACTGGTTTTGATAGTAAAGTACTGAACACTTTATATG TTGATAAGAATTTAATGTATCATGATTTAATTCAAGCGTATTCACGTACAAATAGGGTTGAAAAAGAATCAAAGCCATTT GGTAAAATTGTAAACTATCGTGACTTGAAAAAAGAGACAGACGATGCACTGAGAGTATTCTCACAAACAAATGATACGGA TACAATTTTAATGCGCAGTTATGAAGAGTATAAAAAAGAATTTATGGACGCTTATCGTGAGCTTAAAATGATTGTGCCGA CACCACACATGGTTGATGACATTCAAGATGAAGAAGAGCTAAAGCGCTTTGTTGAAGCTTATCGTTTATTAGCTAAAATA ATATTACGTTTAAAAGCATTTGACGAGTTTGAGTTTACAATTGATGAAATTGGAATGGATGAACAAGAGAATGAAGACTA TAAAAGTAAATATTTAGCTGTGTACGATCAAGTAAAAAGAGCGACGGCTGAGAAAAATAAAGTATCCATTTTAAATGATA TTGATTTCGAAATAGAAATGATGCGTAATGATACGATTAATGTGAATTATATTATGAATATATTGAGACAAATTGATCTT GAAGACAAAGCGGAACAACGTCGTAACCAAGAACAAATTAGACGCATTTTAGATCATGCAGATGATCCGACATTGAGGTT AAAACGAGATCTAATTAGAGAATTCATCGACAATGTTGTACCTTCTTTAAATAAGGATGATGATATCGATCAAGAATATG TTAATTTCGAAAGTATTAAAAAAGAAGCGGAGTTCAAAGGATTTGCTGGAGAGAGATCTATCGATGAACAAGCCCTAAAA ACAATTTCAAATGACTACCAGTATAGTGGTGTTGTAAACCCACATCACCTTAAAAAAATGATTGGTGATTTGCCATTGAA AGAAAAGCGTAAAGCAAGAAAAGCCATTGAATCTTTCGTGGCAGAAACAACTGAAAAATACGGTGTGTAA Protein sequence : MAYQSEYALENEMMNQLEQLGYERVTIRDNKQLLDNFRTILNERHADKLEGNPLTDKEFQRLLTMIDGKSIFESARILRD KLPLRRDDESEIYLSFLDTKSWCKNKFQVTNQVSVEDTYKARYDVTILINGLPLVQVELKRRGIDINEAFNQVKRYRKQN YTGLFRYIQMFIISNGVETRYFSNNDSELLKSHMFYWSDKQNNRINTLQSFAESFMRPCQLAKMISRYMIINETDRILMA MRPYQVYAVEALIQQATETGNNGYVWHTTGSGKTLTSFKASQILSQQDDIKKVIFLVDRKDLDSQTEEEFNKFAKGAVDK TFNTSQLVRQLNDKSLPLIVTTIQKMAKAIQGNAPLLEQYKTNKVVFIIDECHRSQFGDMHRLVKQHFKNAQYFGFTGTP RFPENSSQDGRTTADIFGRCLHTYLIRDAIHDGNVLGFSVDYINTFKNKALKAEDNSMVEAIDTEEVWLADKRVELVTRH IINNHDKYTRNRQYSSIFTVQSIHALIKYYETFKRLNKKLEQPLTIAGIFTFKPNEDDRDGEVPYHSREKLEIMISDYNK KFETNFSTDTTNEYFNHISKNVKKGVKDSKIDILIVVNMFLTGFDSKVLNTLYVDKNLMYHDLIQAYSRTNRVEKESKPF GKIVNYRDLKKETDDALRVFSQTNDTDTILMRSYEEYKKEFMDAYRELKMIVPTPHMVDDIQDEEELKRFVEAYRLLAKI ILRLKAFDEFEFTIDEIGMDEQENEDYKSKYLAVYDQVKRATAEKNKVSILNDIDFEIEMMRNDTINVNYIMNILRQIDL EDKAEQRRNQEQIRRILDHADDPTLRLKRDLIREFIDNVVPSLNKDDDIDQEYVNFESIKKEAEFKGFAGERSIDEQALK TISNDYQYSGVVNPHHLKKMIGDLPLKEKRKARKAIESFVAETTEKYGV |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| SSP0054 | YP_300144.1 | type I site-specific restriction-modification system restriction subunit | Not tested | SCC15305cap | Protein | 0.0 | 75 |
