|
Name : Mevan_0450 (Mevan_0450) Accession : YP_001322969.1 Strain : Methanococcus vannielii SB Genome accession: NC_009634 Putative virulence/resistance : Unknown Product : RNA-binding S1 domain-containing protein Function : - COG functional category : K : Transcription COG ID : COG2183 EC number : - Position : 502775 - 504943 bp Length : 2169 bp Strand : + Note : PFAM: RNA binding S1 domain protein; SMART: Resolvase RNase H domain protein fold; KEGG: mmp:MMP1127 RNA binding S1 DNA sequence : ATGGATATTTTTCAAAAATTACAAAAAGAATTTAATTTAAAACCATTTCAGGTTGAAAATACCGTTAATTTAATTGACGA AGGAAATACAATTCCATTTATTGCAAGATATCGAAAAGAAGTAACGGGCTCACTTGATGACGTTACTTTGAGGAATTTTT TTGAGAAATTAAATTATTTAAGAAATTTAGAAGATAAAAAAGCTCAGACTATTAAATTAATAGATGTTTTAGGCAAATTA ACTTTAGAAGTTAAACAAAAAATTGAAAATTCAGAAACTTTAACTGAAATTGAGGATATTTATAGACCATTTAGACCAAA AAGGAAAACAAGGGCAATAATTGCTGAAAGTAAGGGTTTAAAACCACTTTCAGAAGTTATTTTAAAACAAAAACTGGAAA AACCAGTTGAAGAACTTGCTAAAGAATTTTTAAACCCAAAACTTGAAGTAAATTCGATAGAAGATGCAATTTTTGGAGCA CAGGATATTATTGCAGAAGAAATTTCAGATAATCCAGATTATCGGAAATTTATTCGTGAAAAAACATATTCTAAAGGAAT AATCACTGTAAAAGCAAAGGACAAAGATTTAAAGTCAGTTTACGAAATGTATTATGAATATAATGAACAGTTAAGTAAAA TTCCACGACACAGGATTCTTGCAATAAATCGGGGGGAAAAGGAAAAGATACTTAGCGTAAAAATTGAACCTCCTGTTGAA TTAATTTTAAATTGGCTAAATGGCCAGATAATAATTGAAAATTCAGAAACGGCCAGTATTTTAAAAGATACCATAATAGA TGGATATAAACGATTAATTTCGCCCTCAATTGAACGAGAAATTAGAAATAGCTTAACAGAAAAGGCAGAAGAAGGGGCAA TTTCAGTATTTTCAAAAAATTTAAAGCAGCTGCTACTTCAACCGCCAATAAAAGGAAAAGTTGTTTTGGGCTGGGATCCA GCATTTAGAACTGGCTGTAAATTGGCAGTTGTTGATGAAACCGGAAAATTATTGGATAAAGACGTAGTTTACCCGACAGA GCCACATAATAAAACTTTAGAAACAAAAAAGACTGTTAAGGAACTGGTAAATAATTACAATATAGATATAATTGCAATTG GGAATGGAACTGCTTCAAGGGAATCCGAAATTATTGTATCCGAACTTTTAAAAGAACTTGATCGTAATTTAAAATATGTT ATTGTAAATGAAGCGGGAGCATCTGTATATTCTGCGTCAGAACTCGGTTTTGAAGAATTTCCAGAATATGACGTTGGAGT TAGAAGTGCAGCATCTATTGCAAGACGACTTCAAGACCCTTTAGCAGAATTGGTAAAAATTGACCCTAAATCAATCGGCG TTGGACAGTACCAACATGATATGAACCAGAAAAAATTATCAGAAAGTTTGGGCGCAGTTGTTGAATCGTGTGTAAACTCG GTTGGTGTTGATTTAAATACTGCATCAGTTTCACTTTTAAATTATGTTTCTGGAATTAACAAAGAAATTGCAAAAAATAT TGTAAATTATAGAATTAAAAACGGAAAATTTAATTCAAGAAAAGAACTTTTAAATGTTAAAAAACTAGGTAAAAAAGCGT TTGAGCAGTGTGCCGGATTTTTAAGGATCCAAAATGGTAAAAACCTGCTTGATAATACAAGCGTACATCCTGAGTCGTAT AAAATTGCTGAAAATTTACTTAATGAGTTAAATCTTTCCTTAAACGAAATTAACTATAATAAAATGAATAAAATTTCCGA AAAAATTGAAAGTATTAAAGATATTAAAAATATTGAAAAATTGGCAGATAAATTAAATACTGGCATTCCAACACTATTGG ATATTATTCGTGAACTTGAAAAACCAGGAAGAGACCCAAGAGACGATGTAGAAAAACCAGTTTTAAGGAGCGATGTCTTA AAATTTGAAGATTTAAAGGAAGGAATGATTTTAAAAGGAACGATTAGGAATATTGTTGATTTTGGCGCTTTTGTAGACAT AGGGGTACATCATGACGGGCTTATCCACATTTCTGAAGTTTCGGACAGATTTATAAAGCATCCTCTTGAAGTAATTTCAG TTGGCGATGTTGTTAACGTTTTCGTATTGGGTATTGACTTTGAAAAAAATCGGGTATCTCTTTCAATTAAAAAGGCAATT AATTTTTAA Protein sequence : MDIFQKLQKEFNLKPFQVENTVNLIDEGNTIPFIARYRKEVTGSLDDVTLRNFFEKLNYLRNLEDKKAQTIKLIDVLGKL TLEVKQKIENSETLTEIEDIYRPFRPKRKTRAIIAESKGLKPLSEVILKQKLEKPVEELAKEFLNPKLEVNSIEDAIFGA QDIIAEEISDNPDYRKFIREKTYSKGIITVKAKDKDLKSVYEMYYEYNEQLSKIPRHRILAINRGEKEKILSVKIEPPVE LILNWLNGQIIIENSETASILKDTIIDGYKRLISPSIEREIRNSLTEKAEEGAISVFSKNLKQLLLQPPIKGKVVLGWDP AFRTGCKLAVVDETGKLLDKDVVYPTEPHNKTLETKKTVKELVNNYNIDIIAIGNGTASRESEIIVSELLKELDRNLKYV IVNEAGASVYSASELGFEEFPEYDVGVRSAASIARRLQDPLAELVKIDPKSIGVGQYQHDMNQKKLSESLGAVVESCVNS VGVDLNTASVSLLNYVSGINKEIAKNIVNYRIKNGKFNSRKELLNVKKLGKKAFEQCAGFLRIQNGKNLLDNTSVHPESY KIAENLLNELNLSLNEINYNKMNKISEKIESIKDIKNIEKLADKLNTGIPTLLDIIRELEKPGRDPRDDVEKPVLRSDVL KFEDLKEGMILKGTIRNIVDFGAFVDIGVHHDGLIHISEVSDRFIKHPLEVISVGDVVNVFVLGIDFEKNRVSLSIKKAI NF |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| NMB0075 | NP_273139.1 | transcriptional accessory protein Tex | Not tested | IHT-A | Protein | 3e-135 | 44 |
