Gene Information

Name : Amet_0315 (Amet_0315)
Accession : YP_001318204.1
Strain : Alkaliphilus metalliredigens QYMF
Genome accession: NC_009633
Putative virulence/resistance : Unknown
Product : sodium:neurotransmitter symporter
Function : -
COG functional category : R : General function prediction only
COG ID : COG0733
EC number : -
Position : 353786 - 355141 bp
Length : 1356 bp
Strand : -
Note : PFAM: sodium:neurotransmitter symporter; KEGG: cvi:CV1670 probable sodium/chloride ion channel

DNA sequence :
ATGGCAAACTTGAATAACAACACAGAAAGAGACCAATGGGGTTCAAAGGTTGGATTTATACTGGCGGCGGCAGGATCTGC
TGTTGGACTTGGTAACTTATGGCGATTCCCTGTTACAGCTGGACAAAACGGTGGGGGTGCCTTTGTACTTGTTTATTTCG
CAATTTTAATTTTAGTTGGTTTTACTTTAATGATGGCAGAGTTAGTACTGGGTAGACATACGCAATTAAATGCACTTGGT
GCCTATAAAAAAATTCGTAATAACTGGGCTTGGGTTGGAGGACTAGGTGTCCTAGCTGGATTTTTAATCCTTTCCTTCTA
CAGCGTTATCGGTGGTTGGGTAATCAACTATATGTTCAAGGCTATCACCGGCGCTTTTACAACAAGTGACCCAGAATTTC
TCGGTGGCATGTTTGGTGCCTTTATCTCCAATCCTGTTGAACCACTATTTTATCATGCAATCTTTATGATTCTTACCTTA
GGTATTGTTATTGGTGGCGTTAAGGGTGGTATCGAAAAATATGCTAAAATTCTAATGCCAGCGTTATTTGTCATGATGGT
ATTAACCATGCTTCGATCAGTTACACTACCAGGAGCCATGGAAGGAATTAAGTTCCTATTAGTTCCAGACTTCTCTATGA
TTACTGGAGCCGTGCTTTTATCAGCCCTTGGACAGGTATTCTTCTCCCTCAGTTTAGGTATGGGGGCAATGATCACCTAC
GGAAGCTACTTAAGCAAGGATGCAAACATCCCTCAAAGTTCTTTCATTATTCCATTAGTTGATACTGGTATTGCTTTATT
AGCTGGTTTAGCTATACTACCAGCGGTATTTTCCTTCGGGTTTGACCCAGCAGAGGGACCTGGATTATTATTTGTTACAT
TACCAGCAGTATTTTCTCAAATGCCTTTAGGAGGTTTATTTGGATTTGTTTTCTTCCTACTTGTATTGTTTGCTGCTCTA
ACTTCTTCTATCTCATTATTAGAAGTGTGCGTAGCCTATGTAGTAGACGAGTGGAATATGACTCGTAAAAAAGCAACAAT
CGGTTTAGCTGCTGTCATCTTCTTATTAGGAATTCCTTCTTCCTTAGGAATTGGCGTTTGGAGTCACATTAGTCCCTTCA
GAGGATTAGACATTCTAGACTCCGTTGACTTTATCGCAAGTAATGTATTAATGCCTGTTGGTGGATTCTTACTTTGTATC
TTCATCGGTTGGGTTTGGGGCTTAGAAAATGCCATCAAAGAAGCAACTAACGAAGGTACCATTCCATTTAAGCTTGCAGG
ATTCTGGTCCTTCATGATTAAGTGGGTTGCACCAATTGCCATTGCAGTTGTATTTGTTCAAGGAATTTTATCTTAA

Protein sequence :
MANLNNNTERDQWGSKVGFILAAAGSAVGLGNLWRFPVTAGQNGGGAFVLVYFAILILVGFTLMMAELVLGRHTQLNALG
AYKKIRNNWAWVGGLGVLAGFLILSFYSVIGGWVINYMFKAITGAFTTSDPEFLGGMFGAFISNPVEPLFYHAIFMILTL
GIVIGGVKGGIEKYAKILMPALFVMMVLTMLRSVTLPGAMEGIKFLLVPDFSMITGAVLLSALGQVFFSLSLGMGAMITY
GSYLSKDANIPQSSFIIPLVDTGIALLAGLAILPAVFSFGFDPAEGPGLLFVTLPAVFSQMPLGGLFGFVFFLLVLFAAL
TSSISLLEVCVAYVVDEWNMTRKKATIGLAAVIFLLGIPSSLGIGVWSHISPFRGLDILDSVDFIASNVLMPVGGFLLCI
FIGWVWGLENAIKEATNEGTIPFKLAGFWSFMIKWVAPIAIAVVFVQGILS

• Homologs from PAI DB

GeneGenBank Accn Product Virulance or Resistance PAI or REI Alignment Type E-val Identity
SAR0458 YP_039907.1 sodium:neurotransmitter symporter family protein Not tested vSa¥á Protein 3e-55 43
SAS0416 YP_042543.1 sodium:neurotransmitter symporter family protein Not tested vSa¥á Protein 3e-55 43