|
Name : Cbei_2061 (Cbei_2061) Accession : YP_001309185.1 Strain : Clostridium beijerinckii NCIMB 8052 Genome accession: NC_009617 Putative virulence/resistance : Unknown Product : ammonium transporter Function : - COG functional category : P : Inorganic ion transport and metabolism COG ID : COG0004 EC number : - Position : 2399301 - 2400545 bp Length : 1245 bp Strand : + Note : TIGRFAM: ammonium transporter; PFAM: Rh family protein/ammonium transporter; KEGG: llm:llmg_0910 ammonium transporter AmtB DNA sequence : ATGGAAATTAATTTAGGCGATTGCAGTTTTATATTAATCTGTTCAGCACTTGTACTTTTAATGACACCAGGACTCGCATT TTTTTATGGTGGAATGGTTCGTAGGAAAAATGTTTTAAATACATTGATGTCTTCATTCTTTGTTTGTGGATTAGCATCAA TAATGTGGGTTTTAGTAGGTTATTCATTGTCTTTTGGTAATGATTTTCATGGGATAATAGGTGGACTTAATTTCTTAGGT TTTAATGGGGTAGGAGCAGAGCCTTCAGCATATGCACCTACAATACCTCAAGAGCTTTTTGCTGCATTTCAAATGATGTT TGCAATAATTACTCCAGCGCTTATAACTGGAGCTTTAGTAGAAAGAATGAAGTTTTCAGCATTGTTCATATTTGTAGCTA TATGGTCACTTTTAGTATATTATCCAATGGCACATATGGTATGGGGAGCTGGTGGATTAATAAGTTCTTTAGGTGCCGTT GATTTTGCAGGAGGAAATGTAGTTCATATAAGCTCAGGTATTTCGGGCCTTGTAGCTTGTATTATGTTAGGTAAGAGACA TGGACATGGAATTATGGCATATAGACCACATAATATTCCATTTGTAGTTCTTGGAGTAGCATTACTTTGGTTTGGGTGGT TTGGATTTAATGCAGGTAGTGCGCTCGGAGCTGGTCCACTTGCTGTACATGCATTCATGACAACAAATACTGCAGCAGCT GCAGCTATGCTTTCATGGATGTTAATTGAAAAAGTAAAACATGGTAAGCCAACATTACTTGGAGCAGCAACAGGAGCAGT ATTAGGGTTAGTTGCAATTACACCAGGAGCAGGGTTTGTTCCACTTTGGTCATCAATTATAATTGGTATGGCAGTATCTC CAATTTGTTTCTTCTTTGTGGAAAAAGTAAAAGCTAAGTTTGGATATGATGATGCACTTGATGCTTTTGGATGTCATGGA ATCGGTGGAATTTGGGGTGGTATTGCAACTGGAATTTTTGGACAAACTGCAATTAATCCTGTAGCACAATGGAATGGTCT TTTCTATGGAGATGTTAAACTTTTCATTGCACAAATAATGAGTATTGTAATAACAATAATATTTGCAGGTGGGATGACTT TCTTAATTATAAAAGTTATGAAAATGTTTATGGATATTAGAGTTGATAGCTCAGAAGAAGCTGATGGACTTGATGTAGCT GAACATGGGGAATCTGCTTATCCATCATTTAATGGATTAGACTAG Protein sequence : MEINLGDCSFILICSALVLLMTPGLAFFYGGMVRRKNVLNTLMSSFFVCGLASIMWVLVGYSLSFGNDFHGIIGGLNFLG FNGVGAEPSAYAPTIPQELFAAFQMMFAIITPALITGALVERMKFSALFIFVAIWSLLVYYPMAHMVWGAGGLISSLGAV DFAGGNVVHISSGISGLVACIMLGKRHGHGIMAYRPHNIPFVVLGVALLWFGWFGFNAGSALGAGPLAVHAFMTTNTAAA AAMLSWMLIEKVKHGKPTLLGAATGAVLGLVAITPGAGFVPLWSSIIIGMAVSPICFFFVEKVKAKFGYDDALDAFGCHG IGGIWGGIATGIFGQTAINPVAQWNGLFYGDVKLFIAQIMSIVITIIFAGGMTFLIIKVMKMFMDIRVDSSEEADGLDVA EHGESAYPSFNGLD |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| BJAB07104_00287 | YP_008207752.1 | Ammonia permease | Not tested | AbaR25 | Protein | 4e-63 | 48 |
| BJAB0868_00291 | YP_008211617.1 | Ammonia permease | Not tested | AbaR26 | Protein | 4e-63 | 48 |
