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Name : PsycPRwf_0250 (PsycPRwf_0250) Accession : YP_001279155.1 Strain : Psychrobacter sp. PRwf-1 Genome accession: NC_009524 Putative virulence/resistance : Virulence Product : polysaccharide biosynthesis protein CapD Function : - COG functional category : M : Cell wall/membrane/envelope biogenesis COG ID : COG1086 EC number : - Position : 290754 - 292751 bp Length : 1998 bp Strand : - Note : PFAM: NAD-dependent epimerase/dehydratase; 3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase; polysaccharide biosynthesis protein CapD; Male sterility C-terminal domain DNA sequence : ATGCGAAACAATCATAAAAGCAATCATAGCAATAAAGATTCTGATAACTACCTAGGTAGCGCTTCTCATTCATCTCCTAA GTGGAGTGGAATCGCAGAAACACTATTAAGTTTACCAAGACCAGTAAAGCAGGCTGTTTTATTAGTTGGTGATTATATCA TCTCTATTGTTTGCCTATTTTTAGCACTATCACTTCGTCAAGGCGTGCTCGATGTTAATGCCAGCCCTTTACTGGTCGCT TTATATGCCCTCGTACCGATTTTAGGCTTATATGTGGTTGGATTTTACCGCGGTGTGACTCGTATCTTCTTCGATACTGA TATGCGCCGCGTGCTTAAGCTATTTATCATTATTTTAATTGTCTTTACTGTTGTCTACCTATTTGACTTTATTACCAGTA TCCCGCGTTCAGTGCCGCTATTGTATTTGTTTATGCTGTTTATCTGGCTATGGGGTAGCCGACTATTTCTACGTGACTTA TTACTGCGCTTACAGGGCAAACCCATCTATCAAGACTTAAGTAAAAGCTCTATCGAGCGTGATAATGTGCTTGTCTATGG TGCTGGTTCTTCAGGTACTGCATTATTAGAAGCCTTACAAGACTCTCCTCGCTATCAAGTGGCTGCCTTTATTGATGATG ATAATCGCTTAACTGGTGGCCATATCTTAAATAAAAAAATCTATCCCGCCACACAGATTGAAAGCTTGGTTGAAGAGCTA AACATCGCTCAAGTGTTTCTCGCTATGCCTTCGGTCAATCGTCAGCGTCGTCGTGAGATTATCAACGATTTAACCAATCT GTCTGTAAAAATCAAAGAGCTACCTAGCCTGCAGGATATCGCTGAGGGTAAAGTAACGGTTAGCACCATGCGTCGCGTTG ATATCTTAGATGTATTAGACCGTCAGACCGTTGATCCTAATCCTGTCTTATTAGCCAAGAATATTGAAGGCAAAAATGTT TTGGTTACTGGTGCTGGCGGCTCAATCGGTAGTGAGCTGTGTCGACAAATTATCAAGAACAAGCCTAAATGCTTGGTATT ATACGAATTATCTGAATACGCTCTGTATGCCATTCACCAAGACTTATTAGCTTGGCAAGCGACTAACTCAGTAAGTAGTG ATAATTCTCCCACACATATCATTGCTCTATTAGGTAACGTTAACAACCAACAAAAATTAAACATGGTATTTAACGAATAC GCGATTAATACCGTGTATCATGCGGCAGCTTATAAGCATGTGCCAATTGTAGAATATAACCCCTTTGAGGGCGTTATCAA TAATGCCAAAGGCACGTATCACTGCGTAAAAGCCGCTGTTGAGTCGAATGTAGAAACCTTTGTACTGATATCAACGGATA AAGCGGTACGCCCTACTAATATCATGGGCGCTTCTAAGCGCTTAGCAGAGCTGGTATGCCAGGGCTTTGGTAACCAGAAC CCTAGTACGAAAATCAGCATGGTACGCTTTGGTAATGTCTTGGGCTCATCAGGCTCAGTGGTTCCACTATTTACCAAACA AATAGCCAAAGGTGGCCCGATTACGGTGACTCATCCAGAAGTAACTCGCTACTTTATGACTATTCCTGAAGCCGCTAACC TAGTCATACAAGCAGGCGCTATGGCACAAGGGGGCGAAGTCTTTGTATTAGATATGGGTAAACCGGTAAAAATTGTCGAT TTGGCACGCCGTATGATTCACTTAAGTGGCTATGAGGTGAAGGATGAGAATAACCCTGCTGGTGATATCGAGATAGTCTT CAGTGGTCTACGCCCGGGCGAGAAGCTTTATGAAGAGCTTATCATTGGCGATGATAATATTGAAGCCACTCAGCATTCGT TAATTATGCAAGCACGTGAGCACAGCTTCGAGTTAACTGATATTGAAAACACTTTATCTGAATTAGCATCTAGAGCTCAA TACCATGATGTGGGCTGGTTAAAGCAGCAATTTACTCATTATGTAGAAGGCTATACGCCAGAGTCTAATCTAAATTAA Protein sequence : MRNNHKSNHSNKDSDNYLGSASHSSPKWSGIAETLLSLPRPVKQAVLLVGDYIISIVCLFLALSLRQGVLDVNASPLLVA LYALVPILGLYVVGFYRGVTRIFFDTDMRRVLKLFIIILIVFTVVYLFDFITSIPRSVPLLYLFMLFIWLWGSRLFLRDL LLRLQGKPIYQDLSKSSIERDNVLVYGAGSSGTALLEALQDSPRYQVAAFIDDDNRLTGGHILNKKIYPATQIESLVEEL NIAQVFLAMPSVNRQRRREIINDLTNLSVKIKELPSLQDIAEGKVTVSTMRRVDILDVLDRQTVDPNPVLLAKNIEGKNV LVTGAGGSIGSELCRQIIKNKPKCLVLYELSEYALYAIHQDLLAWQATNSVSSDNSPTHIIALLGNVNNQQKLNMVFNEY AINTVYHAAAYKHVPIVEYNPFEGVINNAKGTYHCVKAAVESNVETFVLISTDKAVRPTNIMGASKRLAELVCQGFGNQN PSTKISMVRFGNVLGSSGSVVPLFTKQIAKGGPITVTHPEVTRYFMTIPEAANLVIQAGAMAQGGEVFVLDMGKPVKIVD LARRMIHLSGYEVKDENNPAGDIEIVFSGLRPGEKLYEELIIGDDNIEATQHSLIMQAREHSFELTDIENTLSELASRAQ YHDVGWLKQQFTHYVEGYTPESNLN |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| cap1D | AAA64643.1 | type 1 capsule synthesis gene | Virulence | SCCcap1 | Protein | 7e-80 | 43 |
