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Name : Msm_0467 (Msm_0467) Accession : YP_001273040.1 Strain : Methanobrevibacter smithii ATCC 35061 Genome accession: NC_009515 Putative virulence/resistance : Unknown Product : NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase Function : - COG functional category : C : Energy production and conversion COG ID : COG1012 EC number : - Position : 444931 - 446343 bp Length : 1413 bp Strand : - Note : COG1012 DNA sequence : ATGGATATGTTAATAAATGGTAAACATATTTCAGCTGATGATTTGGCGGAAGTTAAAAATCCATACAATGGGGAAGTTAT AGATACAGTTCCTGTTTCCCATTTAAATAATGTGGATTTGGCTATTGATGCTGCAGTTAATGCTAAAGATTCTATTCAGG AAATGTCTGCATTTAAAATTTCAAATAAATTATATGCAGTTTACGAAAAATTAAAAGATAACAAAGATGAATTGGCTGAA TTGCTTACAAAAGAGGTAGGTAAACCTATTAATGAGTCTGTTGTTGAAGTTAACCGTTCAATTGAAACATTAAAACTTTC AGCAGAAGAAGCTAAAAGAATTTATGGTGAAACAGTTCCGCTGGATGGTGGGATAAACGGTAAAGGTTTTTTTGCATTTA CTCAAAGGGTTCCATTAGGTGTTGTAGCAGCTATAACTCCATTTAATTATCCCCTAAATTTATCAATTCATAAAATAGCT CCTGCTATTGCATGTAAAAATACTGTAATTATAAAACCTCCAATAAATGCACCATTGACAGTTATGAAATTTGCAGAACT TGTAAATGAGGAGTTTCCAGATGGCGTTATCAATACTGTAACAGGATATGGTTCAGAAGTAGGTGATGCACTGGTAACAT CTCCTAAAGTAGATAAAATTTCATTTACTGGAAGTGTAGCTACCGGACTGCTTATAGCTTCAAGAGCGGGAATGAAAAAA GTTACTTTGGAATTGGGAGGTAATGATCCTCTTGTTGTTCTAAAGGATGCGGATATTGACAGGGCAGTTAACGGAGTAAT GAATGGTGCTTATTTAAATGCCGGACAGGTATGTATGGGCGTTAAAAGGATTATTGTTGATGAGTCAATAGCTGATGAGT TTACGCAAAAATTGGTTAGGGAAACTAAAAAAATCAAAATGGGTGATCCTATGGATAAAAACACAGTATTGGGAACACTT ATTGATGAAGATGCTGCTCGCATGGTTGAAGAAACAGTTAATAATGCAGTTAAGGCAGGTGCCAAAATACTGACTGGTGG AAAAAGAGACGGTGCATTTTACGAAGCTACAGTACTGGATAATGTCACTCCGGATATGGATGTTGTTGTAAATGAAACAT TCGGTCCAGTTGCACCGATTATAAAAGTAAAATCAACTGATGAAGCTATTAAAGTAGCTAATGATACAGAATATGGTCTT CAGGCAGGAGTATTTACTGAAAACTTTAGAGATGGATTAAGGTGTGCAAATGAAATTGAGGCAGGTACGGTTTTTGTAAA TAAACAATCTACATTCAGAACTGATAACATGCCTTTCGGAGGATTTAAAAATAGTGGAACAGGAAAAGAAGGAGTAAAAT ATGCAGTAGAAGAAATGACTAAGGAAAAATTAATAGGATTAAATTTAAGGTAG Protein sequence : MDMLINGKHISADDLAEVKNPYNGEVIDTVPVSHLNNVDLAIDAAVNAKDSIQEMSAFKISNKLYAVYEKLKDNKDELAE LLTKEVGKPINESVVEVNRSIETLKLSAEEAKRIYGETVPLDGGINGKGFFAFTQRVPLGVVAAITPFNYPLNLSIHKIA PAIACKNTVIIKPPINAPLTVMKFAELVNEEFPDGVINTVTGYGSEVGDALVTSPKVDKISFTGSVATGLLIASRAGMKK VTLELGGNDPLVVLKDADIDRAVNGVMNGAYLNAGQVCMGVKRIIVDESIADEFTQKLVRETKKIKMGDPMDKNTVLGTL IDEDAARMVEETVNNAVKAGAKILTGGKRDGAFYEATVLDNVTPDMDVVVNETFGPVAPIIKVKSTDEAIKVANDTEYGL QAGVFTENFRDGLRCANEIEAGTVFVNKQSTFRTDNMPFGGFKNSGTGKEGVKYAVEEMTKEKLIGLNLR |
| Gene | GenBank Accn | Product | Virulance or Resistance | PAI or REI | Alignment Type | E-val | Identity |
| orf17 | AAO17183.1 | Orf17 | Not tested | tcd island | Protein | 2e-67 | 41 |
